Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466325
- Subject:
- XR_939730.2
- Aligned Length:
- 4450
- Identities:
- 2610
- Gaps:
- 1831
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAGGGGAGGGGGAGGAGCGGCGAAAGCGGAAGCCATGTTGGAGTTTCACCCCGAGCGAGGGGCTGCGAGGGTTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCTCTCCTTGTGGGTGTGACCAGGTTCGGCGCGGCGGCGGGCCGCGGGGGGCGGGGACGATTGGCCGCTTGTC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTCGTCCGCAGCGGCGTGAGGGGAGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCAGCGTGGAGCCGGGTGATTGTGACCGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CGGGGGAGCCGGGAGCCGGCCGCGGCGCCCTCTCTCCGTGTGGCCCCCTGAGCGGCCCCCCTCCCCTGCCCGGG 296
Query 1 -----------------------------ATGAACCCCGGCTTCGATTTGAGACGCCGGAACCCGCAGGAGGAC 45
|||||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGGAGGCGGGGGGCACCTGGGGCCCGCCATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGAC 370
Query 46 TTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGGCACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGA 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGGCACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGA 444
Query 120 ATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGGAACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGA 193
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 445 ATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGGAACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATTATGA 518
Query 194 TGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTTGCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGC 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTTGCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGC 592
Query 268 ATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACAGGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGC 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACAGGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGC 666
Query 342 ATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGATTATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGG 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGATTATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGG 740
Query 416 GAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGTCATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCT 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGTCATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCT 814
Query 490 ACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGGCACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAA 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGGCACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAA 888
Query 564 GGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCTGGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTC 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCTGGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTC 962
Query 638 CTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCATTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAG 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCATTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAG 1036
Query 712 GATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCATCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACC 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCATCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACC 1110
Query 786 TACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTTTTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGG 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTTTTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGG 1184
Query 860 ATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACTTACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTA 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACTTACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTA 1258
Query 934 CCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAACGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGT 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAACGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGT 1332
Query 1008 GAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGACAGAACCACATCATGAACTT------------------------- 1056
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGACAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACA 1406
Query 1057 --------------------------------------GATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGT 1092
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGATCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGT 1480
Query 1093 GGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGC 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGC 1554
Query 1167 ACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTT 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTT 1628
Query 1241 TGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATC 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATC 1702
Query 1315 AAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACC 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACC 1776
Query 1389 CCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTAT 1462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTAT 1850
Query 1463 GTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGT 1536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGT 1924
Query 1537 AATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAA 1610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAA 1998
Query 1611 AATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACCCAGATACTAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGA 1684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACCCAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGA 2072
Query 1685 TTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTG 1758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTG 2146
Query 1759 TATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCT 1832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCT 2220
Query 1833 TTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGC 1906
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGC 2294
Query 1907 CAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCT 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCT 2368
Query 1981 TACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCA 2054
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCA 2442
Query 2055 GAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTC 2128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTC 2516
Query 2129 CTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCACCGGCTTCGATTTGAG 2202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|.|||||||||||
Sbjct 2517 CTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAG 2590
Query 2203 ACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAAC 2276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAAC 2664
Query 2277 CCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAA 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAA 2738
Query 2351 AATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAA-------------------- 2404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 AATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTAATTGAGCTGTTCTTG 2812
Query 2405 -----TAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTA 2473
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCTGCTAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTA 2886
Query 2474 ATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTG 2547
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTG 2960
Query 2548 GAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTAC-- 2619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTACTG 3034
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3035 AGAATTGTTGTGCTTTGACAGTTAACTCTAGAAAGAAAGAACACTACCACTGCAACATTAATGGATGCTTGAAG 3108
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3109 CTGTACAAAAGCTGCAGTAACCTGTCTTCAGTTACTTTGTAATTTATTGTGGCATGAGATAAGATGGGGAAAAT 3182
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3183 TTTGTTTTAAGTGGTATGGATATATTTAGCATATTGAACCACACAAGTGCTTAATTCATTGTTATGTAATCTTT 3256
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3257 GTACATATAGGCAGTATTTTTTCTGTGAAACTTCATATTGCTGAAGACATACACTAAGAATTTATGTAGATAAT 3330
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3331 GTACTTTTATGAGATGTACAAGTAAGTGTCTTATCTGTACAGATGTAAATGTTGATGAAAATGCAATTGGGGTT 3404
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3405 AATATTTTAAGAATTCTTTAGTATATTCTTGGGTGTGGCTATATTACAAAATGGGATGCTGGCAATGAAACAAT 3478
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3479 ACATTTAACACTATTGTATTTTTATTATATGTAATTTAGTAATATGAATATAAATCTTGTAACTTTTAAAATTG 3552
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3553 TAATGGAGGCTGTAATCATTTTATAATCTTTTTAATTTTAATGCAAGTACACTGGTGTTTATATTTGCACAAAG 3626
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3627 TATTGATATGTGATGTATTAAGTCACAAAAGTAAGCTGTGACATTGTCTATAAGCATTTGGCTCCACAAATGTA 3700
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3701 TTTGGATTGTTTTCTATGTGAAGCAAACCAATTATAATTAACCACATGTTGTAGTAACTGGTCTTTTTATATTT 3774
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3775 AAGCAGAATCCTGTAAGATTGCTTGTCTTTGCTTAAAAACAATACCTTTGAACATTTTTGAATCACAGAATAGC 3848
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3849 GGTACCATGATAGAATACTGCAATTGTGGTCAGAATTACAGTATGCACAAAGAATTAATTAGCATTATTAAAGA 3922
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3923 GTCCTCACTAAACATTTCATATGATCACACTGAAGAACTGTAACATTCCATAGAGTGAAGTGGTTCAAATTTCT 3996
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 3997 CTTGGAATTTTTACTTTTGTTGGCCTTATTTTATGATCCTTTTCATATTTCTTTTGACTTAGAGTATTAATACA 4070
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 4071 TGGCCAAAATAATTTAGTTACTACCTCATACAAACAATATAATGGTTACTACACATCACAGGAACTTAGTTTTG 4144
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 4145 GTTTAAGTCATTTTTGATTGCTTTTTTCCAATGGAATATGTATATACCAGGTTTTAGCAAAATGCACACTTTTG 4218
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 4219 GCTCTTTTTGGTATATGTTCTTTATATTTTAATGTGAGTATATACACTAAGAACAAACTAAATTGTGATTTATG 4292
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 4293 ATCTTCATTTATTTTAATGATAATGGTTTTAAAATATGTTCCTGATTGTACATATTGTAAAATAAACATGTTTT 4366
Query 2620 -------------------------------------------------------------------------- 2619
Sbjct 4367 TTAACATGCTGTTGTATAGTAGCTTGTCATCTGGTTTAATCTGTATATAGTAACACTAAAATATATTAAGAGGG 4440
Query 2620 ---------- 2619
Sbjct 4441 GAAAGCTTTA 4450