Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466372
• Subject: XM_005247565.2
• Aligned Length: 1552
• Identities: 1359
• Gaps: 161

Alignment

Query    1  ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC  74
            |||| ||     |..|||   ||||.||..||||  ||.|.|                    ||||        
Sbjct    1  ATGG-TG-----GTCACC---CAGCTGAATCTGG--AGTTTT--------------------GCTT--------  35

Query   75  CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATG-GA-GCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGAC  146
              ||||..||                    |||||.|| || ||| ||||     |||.||||       |.||
Sbjct   36  --TCAGGGCA--------------------AGAAGCTGCGAGGCT-TCAG-----CTGTGAGC-------TTAC  74

Query  147  CC---CCAAGCCAC-TGGAGACTGAGCCTAGCAGGGA---------GACC-------GCCTGGTCCATAGGCCT  200
            ||   ||   |||| |||.|.|| .||||      ||         .|||       |||.||||         
Sbjct   75  CCGGTCC---CCACATGGGGTCT-TGCCT------GAATCTTTCTTCACCATCATGTGCCAGGTC---------  129

Query  201  TCAGGTGACCGTGCCC-TTCATGTTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGG------GCCGGCATGCTTCTG--GACT  265
                |||   |||||| |||     |||.|.||  ||..|||.|..|      ||||||.||.|..||  .||.
Sbjct  130  ----GTG---GTGCCCATTC-----TGCTGTCC--GGCTTGTGCATGATGACAGCCGGCCTGGTGATGAACACC  189

Query  266  ATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGTGAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAG  339
            |||  ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  ATT--CAACACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGTGAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAG  261

Query  340  GGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGACTCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGA  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  GGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGACTCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGA  335

Query  414  GCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTG  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  GCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTG  409

Query  488  TGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  TGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGC  483

Query  562  AGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAA  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  AGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAA  557

Query  636  GCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTC  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  GCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTC  631

Query  710  TGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTT  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  TGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTT  705

Query  784  GCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTG  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  GCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTG  779

Query  858  GTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGC  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  GTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGC  853

Query  932  AGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGC  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  AGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGC  927

Query 1006  CGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAA  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  CGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAA  1001

Query 1080  CCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  CCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAG  1075

Query 1154  GCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  GCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTG  1149

Query 1228  CTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTGGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTG  1301
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150  CTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTCGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTG  1223

Query 1302  GCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTTCAAGCT  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1224  GCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTTCAAGCT  1297

Query 1376  CCGTGGGCCACACTGCTGCTGTGCCAAGAAGGTGTACAGCCTCCCCAGGATGGGGCCTCATACAACCCTTCATC  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298  CCGTGGGCCACACTGCTGCTGTGCCAAGAAGGTGTACAGCCTCCCCAGGATGGGGCCTCATACAACCCTTCATC  1371

Query 1450  TGCACTCAACATTTAATCGTGTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGT---------------------  1500
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 1372  TGCACTCAACATTTAATCGTGTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGTTTGTTAGCAAAAACCTCTATT  1443