Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466545
• Subject: NM_001290469.1
• Aligned Length: 3040
• Identities: 2762
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGGGGGACAAGAAAGATGACAAGGACTCACCCAAGAAGAACAAGGGCAAGGAGCGCCGGGACCTGGATGACCT  74
            |||||||||||.||||||||||||..|||.||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGACAAAAAAGATGACAAGAGCTCGCCCAAGAAGAGCAAGGCCAAAGAGCGCCGGGACCTGGATGACCT  74

Query   75  CAAGAAGGAGGTGGCTATGACAGAGCACAAGATGTCAGTGGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAACACAGACTGTG  148
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct   75  CAAGAAGGAAGTGGCTATGACAGAGCACAAGATGTCAGTAGAAGAGGTCTGCCGGAAATACAATACTGACTGCG  148

Query  149  TGCAGGGTTTGACCCACAGCAAAGCCCAGGAGATCCTGGCCCGGGATGGGCCTAACGCACTCACGCCACCGCCT  222
            ||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  149  TGCAGGGTCTGACACACAGTAAAGCCCAGGAGATCCTAGCCCGGGATGGGCCTAACGCCCTCACACCACCGCCC  222

Query  223  ACCACCCCAGAGTGGGTCAAGTTTTGCCGGCAGCTCTTCGGGGGCTTCTCCATCCTGCTGTGGATCGGGGCTAT  296
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  ACCACCCCAGAATGGGTCAAGTTCTGCCGGCAGCTGTTTGGTGGCTTCTCTATCCTGCTGTGGATCGGGGCAAT  296

Query  297  CCTCTGCTTCCTGGCCTACGGTATCCAGGCGGGCACCGAGGACGACCCCTCTGGTGACAACCTGTACCTGGGCA  370
            |||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CCTTTGCTTCCTGGCCTATGGCATCCAGGCAGGGACGGAGGATGACCCTTCCGGTGACAATCTGTACCTGGGCA  370

Query  371  TCGTGCTGGCGGCCGTGGTGATCATCACTGGCTGCTTCTCCTACTACCAGGAGGCCAAGAGCTCCAAGATCATG  444
            |.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  371  TAGTGCTGGCCGCAGTCGTGATCATCACCGGCTGCTTCTCCTACTACCAAGAAGCCAAGAGTTCTAAGATCATG  444

Query  445  GAGTCCTTCAAGAACATGGTGCCCCAGCAAGCCCTGGTGATCCGGGAAGGTGAGAAGATGCAGGTGAACGCTGA  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  445  GAGTCCTTCAAGAACATGGTCCCCCAGCAAGCCCTTGTGATCCGGGAAGGTGAAAAGATGCAGGTGAATGCGGA  518

Query  519  GGAGGTGGTGGTCGGGGACCTGGTGGAGATCAAGGGTGGAGACCGAGTGCCAGCTGACCTGCGGATCATCTCAG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  519  GGAGGTGGTGGTCGGGGACCTGGTGGAGATCAAGGGTGGTGACCGGGTGCCAGCTGACCTGCGCATCATCTCGG  592

Query  593  CCCACGGCTGCAAGGTGGACAACTCCTCCCTGACTGGCGAATCCGAGCCCCAGACTCGCTCTCCCGACTGCACG  666
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  593  CCCATGGCTGCAAGGTGGACAACTCCTCCCTGACTGGCGAATCTGAGCCTCAGACCCGCTCCCCGGACTGCACA  666

Query  667  CACGACAACCCCTTGGAGACTCGGAACATCACCTTCTTTTCCACCAACTGTGTGGAAGGCACGGCTCGGGGCGT  740
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  667  CACGACAACCCCCTGGAGACTCGGAACATCACCTTCTTTTCCACCAACTGCGTGGAAGGCACCGCTCGGGGTGT  740

Query  741  GGTGGTGGCCACGGGCGACCGCACTGTCATGGGCCGTATCGCCACCCTGGCATCAGGGC-TGGAGGTGGGCAAG  813
            ||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|| |||| ||||||||||||||
Sbjct  741  GGTGGTAGCCACAGGTGACCGCACCGTCATGGGCCGCATTGCCACCCTGGCCTC-GGGCTTGGAGGTGGGCAAG  813

Query  814  ACGCCCATCGCCATCGAGATTGAGCACTTCATCCAGCTCATCACCGGCGTGGCTGTCTTCCTGGGTGTCTCCTT  887
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  814  ACGCCCATCGCCATTGAGATTGAGCATTTCATCCAGCTCATTACGGGCGTGGCCGTGTTCCTGGGCGTGTCCTT  887

Query  888  CTTCATCCTCTCCCTCATTCTCGGATACACCTGGCTTGAGGCTGTCATCTTCCTCATCGGCATCATCGTGGCCA  961
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  888  CTTCATCCTCTCTCTCATTCTGGGTTACACCTGGCTCGAGGCAGTCATCTTCCTCATCGGCATCATTGTGGCCA  961

Query  962  ATGTCCCAGAGGGTCTGCTGGCCACTGTCACTGTGTGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCCCGGAAGAAC  1035
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  962  ATGTCCCAGAGGGGCTGCTGGCTACTGTCACGGTGTGTCTGACGCTGACCGCCAAGCGCATGGCTCGCAAGAAC  1035

Query 1036  TGCCTGGTGAAGAACCTGGAGGCTGTAGAAACCCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCAGATAAGACAGGGAC  1109
            |||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1036  TGCCTGGTGAAGAACCTGGAGGCGGTGGAGACGCTGGGCTCCACGTCCACCATCTGCTCGGACAAGACCGGCAC  1109

Query 1110  CCTCACTCAGAACCGCATGACAGTCGCCCACATGTGGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCTGACACCACTGAGG  1183
            .|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1110  TCTCACCCAGAACCGCATGACCGTCGCCCACATGTGGTTTGACAACCAGATCCACGAGGCAGACACCACAGAGG  1183

Query 1184  ACCAGTCAGGGACCTCATTTGACAAGAGTTCGCACACCTGGGTGGCCCTGTCTCACATCGCTGGGCTCTGCAAT  1257
            |.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1184  ATCAGTCAGGGACCTCTTTCGACAAGAGCTCACACACCTGGGTGGCCCTGTCCCACATCGCCGGGCTCTGCAAC  1257

Query 1258  CGCGCTGTCTTCAAGGGTGGTCAGGACAACATCCCTGTGCTCAAGAGGGATGTGGCTGGGGATGCGTCTGAGTC  1331
            ||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 1258  CGGGCCGTCTTCAAGGGCGGGCAGGACAACATCCCAGTACTCAAGAGGGACGTGGCCGGTGATGCCTCCGAGTC  1331

Query 1332  TGCCCTGCTCAAGTGCATCGAGCTGTCCTCTGGCTCCGTGAAGCTGATGCGTGAACGCAACAAGAAAGTGGCTG  1405
            |||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1332  TGCCCTGCTTAAGTGCATTGAGCTGTCCTCGGGTTCCGTAAAGCTGATGCGAGAACGGAACAAGAAAGTGGCTG  1405

Query 1406  AGATTCCCTTCAATTCCACCAACAAATACCAGCTCTCCATCCATGAGACCGAGGACCCCAACGACAACCGATAC  1479
            |||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1406  AGATTCCGTTCAACTCGACCAACAAATACCAGCTATCCATCCATGAGACTGAGGATCCCAATGACAACCGGTAC  1479

Query 1480  CTGCTGGTGATGAAGGGTGCCCCCGAGCGCATCCTGGACCGCTGCTCCACCATCCTGCTACAGGGCAAGGAGCA  1553
            |||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1480  CTGCTAGTGATGAAGGGCGCCCCCGAACGCATTCTGGACCGCTGTGCCACCATCCTCCTGCAGGGCAAGGAGCA  1553

Query 1554  GCCTCTGGACGAGGAAATGAAGGAGGCCTTCCAGAATGCCTACCTTGAGCTCGGTGGCCTGGGCGAGCGCGTGC  1627
            |||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1554  GCCTCTGGATGAGGAGATGAAGGAGGCCTTCCAGAATGCCTACCTGGAGCTTGGTGGCCTGGGCGAGCGTGTGC  1627

Query 1628  TTGGTTTCTGCCATTATTACCTGCCCGAGGAGCAGTTCCCCAAGGGCTTTGCCTTCGACTGTGATGACGTGAAC  1701
            |.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1628  TGGGTTTCTGCCATTACTACCTGCCTGAGGAACAGTTCCCCAAGGGCTTTGCCTTTGACTGTGATGACGTGAAC  1701

Query 1702  TTCACCACGGACAACCTCTGCTTTGTGGGCCTCATGTCCATGATCGACCCACCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGC  1775
            ||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  TTCACCACAGACAACCTTTGCTTTGTGGGTCTCATGTCCATGATTGACCCTCCCCGGGCAGCCGTCCCTGACGC  1775

Query 1776  GGTGGGCAAGTGTCGCAGCGCAGGCATCAAGGTCATCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACGGCCAAGGCCA  1849
            .||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1776  TGTGGGCAAATGCCGAAGCGCAGGCATCAAGGTCATCATGGTCACCGGCGATCACCCCATCACTGCCAAGGCCA  1849

Query 1850  TTGCCAAGGGTGTGGGCATCATCTCTGAGGGCAACGAGACTGTGGAGGACATCGCCGCCCGGCTCAACATTCCC  1923
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1850  TTGCCAAGGGTGTGGGTATCATCTCTGAGGGTAACGAGACTGTCGAAGACATCGCTGCCCGGCTCAACATCCCT  1923

Query 1924  GTCAGCCAGGTTAACCCCCGGGATGCCAAGGCCTGCGTGATCCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCCGA  1997
            |||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1924  GTCAGCCAGGTGAACCCCAGGGATGCCAAAGCCTGTGTGATTCACGGCACCGACCTCAAGGACTTCACCTCGGA  1997

Query 1998  GCAAATCGACGAGATCCTGCAGAATCACACCGAGATCGTCTTCGCCCGCACATCCCCCCAGCAGAAGCTCATCA  2071
            |||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1998  GCAGATTGACGAGATTCTGCAGAACCACACCGAGATCGTCTTTGCCCGAACCTCCCCTCAGCAGAAGCTCATCA  2071

Query 2072  TTGTGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGTGCAATTGTGGCTGTGACCGGGGATGGTGTGAACGACTCCCCCGCTCTG  2145
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2072  TCGTGGAGGGCTGTCAGAGACAGGGAGCAATTGTGGCTGTGACTGGCGATGGTGTGAATGACTCCCCTGCTCTG  2145

Query 2146  AAGAAGGCCGACATTGGGGTGGCCATGGGCATCGCTGGCTCTGACGTCTCCAAGCAGGCAGCTGACATGATCCT  2219
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 2146  AAGAAGGCTGACATCGGGGTGGCCATGGGCATTGCTGGCTCTGATGTCTCTAAGCAGGCTGCCGACATGATTCT  2219

Query 2220  GCTGGACGACAACTTTGCCTCCATCGTCACAGGGGTGGAGGAGGGCCGCCTGATCTTCGACAACCTAAAGAAGT  2293
            ||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2220  GCTGGATGACAACTTTGCTTCCATTGTCACTGGTGTGGAGGAAGGCCGCCTGATCTTTGACAACCTGAAGAAAT  2293

Query 2294  CCATTGCCTACACCCTGACCAGCAATATCCCGGAGATCACGCCCTTCCTGCTGTTCATCATGGCCAACATCCCG  2367
            ||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 2294  CCATCGCCTACACTCTGACTAGCAACATCCCTGAGATCACACCCTTCCTGCTCTTCATCATGGCTAACATCCCA  2367

Query 2368  CTGCCCCTGGGCACCATCACCATCCTCTGCATCGATCTGGGCACTGACATGGTCCCTGCCATCTCACTGGCGTA  2441
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2368  CTGCCTCTTGGCACCATCACCATCCTCTGCATTGACCTGGGTACCGACATGGTCCCTGCAATCTCCCTGGCCTA  2441

Query 2442  CGAGGCTGCCGAAAGCGACATCATGAAGAGACAGCCCAGGAACCCGCGGACGGACAAATTGGTCAATGAGAGAC  2515
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||.||.||.|
Sbjct 2442  CGAGGCTGCCGAGAGCGACATCATGAAGAGGCAGCCCAGGAACCCACGCACAGACAAACTGGTCAACGAAAGGC  2515

Query 2516  TCATCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGAATGATCCAGGCTCTCGGTGGCTTCTTCTCTTACTTTGTGATCCTG  2589
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2516  TCATCAGCATGGCCTACGGGCAGATTGGGATGATCCAGGCCCTCGGTGGTTTCTTCTCCTACTTTGTCATCCTG  2589

Query 2590  GCAGAAAATGGCTTCTTGCCCGGCAACCTGGTGGGCATCCGGCTGAACTGGGATGACCGCACCGTCAATGACCT  2663
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 2590  GCAGAAAATGGCTTCTTGCCCGGAAACCTGGTGGGCATCCGGCTCAACTGGGATGATCGCACTGTCAATGACCT  2663

Query 2664  GGAAGACAGTTACGGGCAGCAGTGGACATACGAGCAGAGGAAGGTGGTGGAGTTCACCTGCCACACGGCCTTCT  2737
            .|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2664  AGAAGACAGTTATGGGCAGCAGTGGACTTATGAGCAGAGGAAGGTGGTAGAGTTCACATGCCACACAGCCTTCT  2737

Query 2738  TTGTGAGCATCGTTGTCGTCCAGTGGGCCGATCTGATCATCTGCAAGACCCGGAGGAACTCGGTCTTCCAGCAG  2811
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2738  TTGTGAGTATCGTGGTGGTCCAGTGGGCTGACCTGATCATCTGCAAGACCAGGAGGAACTCCGTCTTCCAGCAG  2811

Query 2812  GGCATGAAGAACAAGATCCTGATCTTCGGGCTGTTTGAGGAGACGGCCCTGGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCCC  2885
            |||||||||||.||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812  GGCATGAAGAATAAGATCTTGATCTTCGGCTTGTTTGAGGAGACGGCCCTCGCTGCCTTCCTGTCCTACTGCCC  2885

Query 2886  CGGCATGGACGTGGCCCTGCGCATGTACCCTCTCAAGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTCC  2959
            .||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886  AGGCATGGATGTGGCCCTTCGCATGTACCCTCTCAAGCCCAGCTGGTGGTTCTGTGCCTTCCCCTACAGTTTCC  2959

Query 2960  TCATCTTCGTCTACGACGAAATCCGCAAACTCATCCTGCGCAGGAACCCAGGGGGTTGGGTGGAGAAGGAAACC  3033
            |||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2960  TCATCTTCGTCTATGATGAGATTCGCAAACTCATCCTGCGCAGGAACCCCGGGGGTTGGGTGGAGAAAGAGACC  3033

Query 3034  TACTAC  3039
            |||||.
Sbjct 3034  TACTAT  3039