Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466843
- Subject:
- XM_006539279.3
- Aligned Length:
- 2076
- Identities:
- 1671
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGTGGCTGCAGCAGCGGCTCAAGGGGCTGCCGGGACTGCTGTCGAGCAGCTGGGCCCGCCGCCTCCTCTGCCT 74
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGGCTGCAGCAGCGCCTGAAGGGGCTGCCGGGGCTGCTGTCGAGCAGCTGGGCCCGCCGCCTCCTCTGCCT 74
Query 75 GCTTGGCCTCCTGCTGCTGCTTCTGTGGTTTGGGGGGTCCGGCGCGCGGCGGGCGGCGGGCGGCCTGCACCTGC 148
|||.||||||.||.|||||||.||||||||.|.|.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCTCGGCCTCTTGGTGCTGCTCCTGTGGTTCGCGAGCTCCGGGGCGCGGCGGGCGGCGGGCGGCCTGCACCTGC 148
Query 149 TGCCCTGGTCCCGCGGTGAGCCGGGCGCCGCCGAGCCGTCTGCCTGCCTGGAGGCGGCCACCCGCGCCTGGCGC 222
.|.|||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 CGTCCTGGGCCCGCAGCGAGCCGGGCGCCGCCGAGCCGTCTGCCTGTCTGGAGGCGGCCACCCGCGCGTGGCGC 222
Query 223 GGCCTGCGGGAGCGCGGTGAGGTGGTACCGCTGGGTCCTGGAGTGCCGGCCCTGGTGGCCAACGGCTTCCTGGC 296
||||||||.||.|||||.||||.|||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCCTGCGTGATCGCGGCGAGGCGGTGCCGCTTGGCCCCGGGGTGCCAGCCCTGGTGGCCAACGGCTTCCTGGC 296
Query 297 ACTGGACGTGGCTGC--CAATCGGCTGTGGGTGACTCCCGGGGAGCGGGAGCCCGCCGTGGCGCCGGACTTTGT 368
.|||||| |.||.| |||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.||
Sbjct 297 TCTGGAC--GCCTCCAACAACCGGCTGTGGGTGACGCCCGGAGAGCGGGAGCCTGCCGTGACGCCGGACTTCGT 368
Query 369 GCCCTTCGTGCAGCTGCGCCCGCTGAGCGCGCTGGCTGAAGCTGGAGAGGCGGTGCTGCTGCTGCGGGAGGGGC 442
|||||||||||||||.||||||||||..|.|.||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 369 GCCCTTCGTGCAGCTACGCCCGCTGAATGTGGTGGCCGAGGCTGGAGAGGCGGTGCTGCTTCTGCGGGAGGGCC 442
Query 443 TTCTGCGCCGCGTGCGTTGCCTGCAGCTGGGGTCCCCAGGTCCTGGCCCCGTGGCCGCCGG---CCCCGGGCCC 513
|.||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||..|.||||| .|||||.|| ||||||||||
Sbjct 443 TGCTGCGCCGAGTGCGCTGCCTGCAGCTGGGGACCCCGGGCTCGGGCCC---TGCCGCTGGTGTCCCCGGGCCC 513
Query 514 GCCTCCGTCTCTGGCCTTGCCGCGGGGTCCGGCCGCGACTGCGTGCTGCTGCAAGAGGACTTTCTGGCGCACAG 587
|||||.|.|||.||.||..||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.|
Sbjct 514 GCCTCGGCCTCCGGGCTCTCCGCGGGGTCGGGCCGGGACTGCGTGCTACTGCAGGAGGACTTCCTGGCGCACCG 587
Query 588 GGGCCGACCCCACGTCTACCTGCAGCGCATCCAGCTCAACAACCCCACGGAGCGCGTGGCCGCGCTGCAGACTG 661
.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 588 AGGCCGACCCCACGTCTATCTGCAGCGCATCCAGCTCAACAATCCCACGGAGCGCGTGGCCGCGTTGCAGACTG 661
Query 662 TGGGGCCCACTGCCGGCCCAGCCCCCAAGGCCTTCACCAGTACCCTGGAGAAGGTCGGAGACCATCAGTTCCTC 735
||||||||||.||.|||||||.||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 662 TGGGGCCCACCGCAGGCCCAGTCCCCAAATCCTTCACCAGCACCCTGGAGAAGGTCGGAGATCACCAGTTTCTC 735
Query 736 CTCTACTCAGGCCGGTCCCCGCCTACGCCCA-CTGGGTTGGTGCACCTGGTGGTGGTGGCCGCCAAGAAGCTGG 808
||||||||.|||||||||.|.|| .|..||| |.|||.||||||||.||||.||||||.||.|.||||||.|.|
Sbjct 736 CTCTACTCGGGCCGGTCCACACC-CCTTCCATCGGGGCTGGTGCACTTGGTCGTGGTGACCTCTAAGAAGTTAG 808
Query 809 TGAACCGCCTCCAAGTGGCTCCCAAGACGCAGCTGGATGAGACGGTGCTGTGGGTGGTGCACGTCTCTGGCCCC 882
|||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 809 TGAACAGGCTCCAGGTGGCTCCCAAGACACAGCTGGACGAGACGGTGCTGTGGGTGGTGCACATCTCTGGTCCC 882
Query 883 ATTAACCCCCAGGTGCTCAAAAGCAAAGCAGCCAAGGAGCTCAAGGCGCTGCAGGACTTGGCACGGAAGGAAAT 956
||..||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 883 ATCCACCCCCAGGTGCTCAAAAGCAAAGGAGCCAAGGAGCTCAAGGCGCTGCAGGACTTAGCACGGAAGGAGAT 956
Query 957 GCTGGAGCTCTTGGACATGCCAGCGGCGGAGCTGCTTCAAGACCACCAGCTCCTCTGGGCTCAGCTCTTCAGCC 1030
|||||||||.|||||.|||||.||..|||||||||||||.||.||||||..|||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 957 GCTGGAGCTGTTGGAGATGCCCGCCTCGGAGCTGCTTCAGGATCACCAGTACCTCTGGGCCCAGCTCTTCAGTC 1030
Query 1031 CAGGAGTGGAAATGAAGAAGATCACTGACACCCACACGCCGTCTGGCCTCACCGTGAACCTGACGCTCTATTAC 1104
|.||.|||||.|||||||.||||||.||..|.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1031 CCGGTGTGGAGATGAAGAGGATCACGGATGCTCACACGCCATCTGGCCTGACCGTGAACCTGACCCTGTACTAC 1104
Query 1105 ATGCTCTCCTGCTCGCCAGCCCCACTGCTCAGCCCCTCCCTGAGCCACAGGGAGCGAGACCAGATGGAGTCGAC 1178
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.|.||
Sbjct 1105 ATGCTCTCCTGCTCTCCAGCCCCACTGCTCAGCCCCTCTCTGAGCCACAGGGAACGCGAGCAGATGGAGGCAAC 1178
Query 1179 GCTCAACTATGAAGATCACTGCTTCAGCGGGCACGCCACCATGCACGCCGAGAACCTGTGGCCGGGGCGGCTGT 1252
|||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.|||.|
Sbjct 1179 GCTCAACTATGAAGACCACTGCTTCAGTGGCCATGCCACCATGCATGCCGAGAACCTGTGGCCTGGCCAGCTCT 1252
Query 1253 CCTCCGTCCAGCAGATCCTGCAGCTCTCTGACCTGTGGAGGCTGACCCTCCAGAAGCGTGGCTGCAGGGGGCTG 1326
||||.||.|||||||||||||||||..||||||||||||.|.||||||||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1253 CCTCAGTGCAGCAGATCCTGCAGCTGGCTGACCTGTGGAAGTTGACCCTCCAGAAGCGCGGCTGCAAGGGGCTG 1326
Query 1327 GTGAAGGTGGGTGCCCCAGGCATCCTGCAGGGGATGGTGCTCAGCTTTGGGGGGCTGCAGTTCACAGAGAACCA 1400
||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1327 GTGAAGGTTGGCGCTCCGGGCATCCTGCAAGGCATGGTGCTCAGCTTCGGCGGGCTACAGTTCACAGAAAACCA 1400
Query 1401 CCTCCAGTTCCAGGCCGACCCCGACGTGCTGCACAACAGCTATGCATTGCATGGCATCCGCTACAAGAACGACC 1474
|||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 CCTGCAGTTCCAGGCCGACCCCGAGGTGCTCCACAACAGCTATGCGCTTCACGGCATCCGCTACAAGAACGACC 1474
Query 1475 ATATCAACCTGGCCGTGCTGGCGGATGCCGAGGGCAAGCCCTACCTACACGTGTCCGTGGAGTCCCGTGGCCAG 1548
|.|||||||||||.|||||||.|||.||.|||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||.
Sbjct 1475 ACATCAACCTGGCTGTGCTGGTGGACGCTGAGGGCAAGCCCTACCTGCATGTGTCTTTGGAGTCCCGAGGCCAA 1548
Query 1549 CCTGTCAAGATCTATGCCTGCAAGGCAGGCTGCCTGGACGAGCCAGTGGAGCTGACCTCGGCGCCCACGGGCCA 1622
||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||..|.||.||.||.|||||||||||.|.|||....|||||
Sbjct 1549 CCCGTCAAGATCTACGCCTGTGAGGCAGGCTGCCTCCATGACCCCGTAGAGCTGACCTCAGAGCCTGGAGGCCA 1622
Query 1623 CACCTTCTCGGTCATGGTGACACAGCCCATCACGCCACTGCTCTACATCTCCACCGACCTCACACACCTGCAGG 1696
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1623 CACCTTCTCTGTCATGGTGACCCAGCCCATCACACCACTGTTGTACATCTCCACCGACCTCACACATCTGCAGG 1696
Query 1697 ACCTGCGGCACACGCTGCACCTCAAGGCCATCCTGGCCCATGATGAGCACATGGCCCAGCAGGACCCCGGGCTG 1770
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1697 ACCTGCGGCACACGCTGCACCTTAAGGCCATCCTGGCCCACGATGAGCACATGGCCCAGCAGGATCCCGGCCTG 1770
Query 1771 CCCTTCCTCTTCTGGTTCAGCGTGGCCTCCCTAATCACCCTCTTCCACCTCTTCCTCTTCAAGCTCATCTACAA 1844
||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1771 CCCTTCCTCTTCTGGTTCAGTGTGGCCTCCCTCATCACCCTCTTCCACCTCTTCCTCTTTAAACTCATCTATAA 1844
Query 1845 CGAGTACTGTGGGCCTGGAGCCAAGCCCCTCTTCAGGAGTAAGGAAGATCCCAG--TGTC-------------- 1902
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||| |||| |.||
Sbjct 1845 TGAGTACTGTGGGCCTGGAGCCAAGCCCCTCTTCAGGAGCAAGG------CCAGGCTTTCAGGGAAAGCAGTCC 1912
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 1913 TTGGCCCTCAGGAGCAGGCAGCAGACGGAGGCAGGTCTGAGTTCCTCACGATGGAGGAACCAGTGGAGACTTGG 1986
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 1987 GTCGGAAAGCAGTGTGGAGAAGGTCTTCCAAGTAGCCAGCTTTTGGCCAGCTATCTAGAAAAGGAAGATCCCAG 2060
Query 1903 ---- 1902
Sbjct 2061 TGTC 2064