Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466876
- Subject:
- NM_001360706.1
- Aligned Length:
- 1194
- Identities:
- 1071
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGGATGAAGAACCTGAAAGAACTAAGCGATGGGAAGGAGGCTATGAAAGAACATGGGAGATTCTTAAAGAAGA 74
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGAAGAACCTGAGAGAACCAAGCGGTGGGAAGGAGGCTATGAGAGAACCTGGGAAATTCTTAAAGAAGA 74
Query 75 TGAATCTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGACATTCTATTCAAGGCAAAGAGAAAAAGAGTATTTGAGCACC 148
||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 75 TGAAACTGGATCACTTAAAGCTACAATAGAAGATATTCTCTTCAAGGCAAAGAGGAAAAGAGTGTTTGAGCACC 148
Query 149 ATGGACAAGTTCGACTTGGAATGATGCGCCACCTTTATGTGGTAGTAGATGGATCAAGAACAATGGAAGACCAA 222
||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 149 ATGGACAAGTCCGACTTGGAATGATGCGCCACCTGTATGTGGTGGTGGATGGATCGAGAACAATGGAAGATCAG 222
Query 223 GATTTAAAGCCTAATAGACTGACGTGTACTTTAAAGTTGTTGGAATACTTTGTAGAGGAATATTTTGATCAAAA 296
|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 GATTTAAAGCCCAATAGACTGACTTGCACTTTAAAGTTGCTGGAATACTTTGTAGAAGAATATTTTGATCAAAA 296
Query 297 TCCTATTAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAGTAAAAGAGCTGAAAAATTGACTGAACTTTCAGGAAACC 370
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 CCCTATCAGTCAGATTGGAATAATTGTAACTAAGAGTAAAAGAGCTGAAAAACTGACTGAACTCTCAGGAAACC 370
Query 371 CAAGAAAACATATAACGTCTTTGAAGGAAGCTGTGGATATGACCTGCCATGGAGAGCCATCTCTTTATAATTCC 444
||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 371 CAAGGAAACATATAACATCTTTGAAGAAAGCTGTAGATATGACCTGCCATGGAGAACCATCGCTCTATAATTCC 444
Query 445 CTAAGCATGGCTATGCAGACTCTAAAACACATGCCTGGACATACAAGTCGAGAAGTACTAATCATCTTTAGCAG 518
.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 445 TTAAGCATGGCTATGCAGACCCTAAAACACATGCCTGGACATACAAGTAGAGAAGTGCTCATCATCTTCAGCAG 518
Query 519 CCTTACAACTTGCGATCCATCTAATATTTATGATTTAATCAAGACCCTAAAGGCAGCTAAAATTAGAGTATCTG 592
|||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 CCTCACCACCTGTGATCCATCTAATATTTACGATCTCATCAAGACCCTGAAGACAGCTAAAATTAGAGTGTCTG 592
Query 593 TTATTGGATTGTCTGCAGAAGTTCGCGTTTGCACTGTACTTGCTCGTGAAACTGGTGGCACGTACCATGTTATT 666
||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 593 TTATTGGATTATCTGCGGAGGTTCGAGTTTGTACTGTACTTGCTCGTGAAACTGGTGGCACATACCATGTTATC 666
Query 667 TTAGATGAAAGCCATTACAAAGAGTTGCTCACACATCATCTTAGTCCTCCTCCTGCTAGCTCAAGTTCTGAATG 740
||||||||||.|||||||||.||||||.|..||||||||.|.||.||.||||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 667 TTAGATGAAACCCATTACAAGGAGTTGTTGGCACATCATGTGAGCCCCCCTCCTGCCAGCTCAAGCTCCGAGTG 740
Query 741 CTCACTTATTCGTATGGGATTTCCTCAGCACACCATTGCTTCTTTATCTGACCAGGATGCAAAACCCTCTTTCA 814
||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 741 CTCACTCATTCGCATGGGATTCCCTCAGCATACCATTGCTTCTTTGTCTGATCAGGATGCAAAACCATCCTTCA 814
Query 815 GCATGGCGCATTTGGATGGCAA---TACTGAGCCAGGGCTTACATTAGGAGGCTATTTCTGCCCACAGTGTCGG 885
|||||||||||||||||..||| .||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 815 GCATGGCGCATTTGGATAACAACAGCACTGAGCCAGGGCTTACACTGGGAGGCTACTTCTGCCCACAGTGCCGA 888
Query 886 GCAAAGTACTGTGAGCTACCTGTTGAATGTAAAATCTGTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCTCCCCACTTGGCACG 959
|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|
Sbjct 889 GCAAAGTACTGCGAGCTTCCTGTTGAATGTAAAATATGTGGTCTTACTTTGGTGTCTGCACCTCATTTGGCAAG 962
Query 960 GTCTTACCATCATTTGTTTCCTTTGGATGCTTTTCAAGAAATTCCCCTAGAAGAATATAATGGAGAAAGATTTT 1033
.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 963 ATCTTACCATCATTTATTTCCTTTGGATGCTTTTCAAGAAATTTCCCTAGAAGAATATAAAGGAGAAAGGTTTT 1036
Query 1034 GTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGTTTATGTTTGTGCTGTGTGCCAAAATGTTTTCTGTGTG 1107
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037 GTTATGGATGTCAGGGGGAATTGAAAGACCAACATGTCTATGTTTGCACAGTGTGCCAAAATGTTTTTTGTGTG 1110
Query 1108 GACTGTGATGTTTTTGTTCATGATTCTCTACACTGTTGCCCTGGCTGTATTCATAAGATTCCAGCTCCTTCAGG 1181
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.
Sbjct 1111 GACTGTGATGTCTTTGTTCATGACTCTCTCCATTGTTGTCCTGGCTGTATTCATAAGATCCCAACTCCTTCAGC 1184
Query 1182 TGTT------ 1185
...|
Sbjct 1185 GCATCATGAC 1194