Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466978
• Subject: XM_017027007.2
• Aligned Length: 1312
• Identities: 1164
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||.||||||||.||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.|||.|||||.||||||||.||.||.|.|||.||||||||||||||||.||.||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
            ||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||.||||||||
Sbjct  445  CCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGAC  518

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
            ||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||.|||
Sbjct  519  TCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA  740

Query  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  888

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG  962

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGA  1109
            ||||||||..||||.|||||||||| ||| .||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTC-ACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGG  1109

Query 1110  AAAGTTTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCT  1183
            .||||||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1110  GAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1183

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGACTGGACAG---TT  1254
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||   |||||   .|
Sbjct 1184  CTGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGA---GACAGCATCT  1254

Query 1255  CCC---------------------------------------------------  1257
            |||                                                   
Sbjct 1255  CCCCAGGTTACCTATGCTGGTCCAAACACCTGGTCTCAAGAAATCCTTCTGCTG  1308