Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467002
• Subject: XM_017024038.2
• Aligned Length: 1302
• Identities: 1214
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGGAAGCGAGCTTTGTCCAGACCACCATGGCTCTGGGGCTGTCCTCCAAGAAAGCGTCCTCTCGCAACGTGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGCGAGCTTTGTCCAGACCACCATGGCTCTGGGGCTGTCCTCCAAGAAAGCGTCCTCTCGCAACGTGGC  74

Query   75  TGTGGAGCGTAAGAACCTGATCACCGTGTGCAGGTTCTCTGTGAAAACGCTGCTGGAGAAGTACACAGCGGAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGGAGCGTAAGAACCTGATCACCGTGTGCAGGTTCTCTGTGAAAACGCTGCTGGAGAAGTACACAGCGGAGC  148

Query  149  CCATCGATGACTCATCGGAGGAGTTTGTCAATTTTGCAGCCATTTTAGAGCAGATCCTCAGCCACCGCTTCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATCGATGACTCATCGGAGGAGTTTGTCAATTTTGCAGCCATTTTAGAGCAGATCCTCAGCCACCGCTTCAAA  222

Query  223  GCCTGTGCCCCAGCAGGTCCAGTGAGCTGGTTCAGCTCAGACGGGCAGCGGGGCTTTTGGGACTATATCCGGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTGTGCCCCAGCAGGTCCAGTGAGCTGGTTCAGCTCAGACGGGCAGCGGGGCTTTTGGGACTATATCCGGCT  296

Query  297  GGCCTGCAGCAAAGTGCCCAACAACTGTGTGAGCAGCATCGAGAACATGGAGAACATCAGCACAGCCCGGGCCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCTGCAGCAAAGTGCCCAACAACTGTGTGAGCAGCATCGAGAACATGGAGAACATCAGCACAGCCCGGGCCA  370

Query  371  AGGGCCGGGCATGGATCCGGGTGGCACTGATGGAGAAGCGCATGTCAGAATACATCACCACGGCTCTGCGTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGGCCGGGCATGGATCCGGGTGGCACTGATGGAGAAGCGCATGTCAGAATACATCACCACGGCTCTGCGTGAC  444

Query  445  ACCCGGACCACCAGACGGTTCTATGACTCTGGAGCCATCATGCTGCGGGATGAAGCCACCATCCTCACCGGAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACCCGGACCACCAGACGGTTCTATGACTCTGGAGCCATCATGCTGCGGGATGAAGCCACCATCCTCACCGGAAT  518

Query  519  GCTGATCGGACTGAGCGCCATCGACTTCAGCTTCTGTCTAAAGGGGGAAGTCCTGGACGGGAAGACCCCCGTGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGATCGGACTGAGCGCCATCGACTTCAGCTTCTGTCTAAAGGGGGAAGTCCTGGACGGGAAGACCCCCGTGG  592

Query  593  TCATCGATTACACGCCCTACCTAAAGTTCACGCAGAGCTACGACTACCTGACGGACGAGGAGGAGCGGCACAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCATCGATTACACGCCCTACCTAAAGTTCACGCAGAGCTACGACTACCTGACGGACGAGGAGGAGCGGCACAGC  666

Query  667  GCCGAGAGCAGCACGAGCGAGGACAACTCGCCCGAGCACCCGTACCTCCCGCTCGTCACCGACGAGGACAGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GCCGAGAGCAGCACGAGCGAGGACAACTCGCCCGAGCACCCGTACCTCCCGCTCGTCACCGATGAGGACAGCTG  740

Query  741  GTACAGCAAGTGGCACAAGATGGAGCAGAAGTTCCGCATCGTCTACGCGCAGAAGGGCTACCTGGAGGAGCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACAGCAAGTGGCACAAGATGGAGCAGAAGTTCCGCATCGTCTACGCGCAGAAGGGCTACCTGGAGGAGCTGG  814

Query  815  TGCGTCTGCGCGAGTCGCAGCTGAAGGACCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGCTTCAGCTGCAGCTGGAGGAGGCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCGTCTGCGCGAGTCGCAGCTGAAGGACCTGGAGGCGGAGAACCGGCGGCTTCAGCTGCAGCTGGAGGAGGCG  888

Query  889  GCGGCGCAGAACCAGCGCGAGAAACGGGAGCTGGAAGGCGTGATCCTGGAGCTGCAGGAGCAGCTGACAGGTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGGCGCAGAACCAGCGCGAGAAACGGGAGCTGGAAGGCGTGATCCTGGAGCTGCAGGAGCAGCTGACAGGTCT  962

Query  963  GATCCCCAGTGACCACGCCCCTCTGGCCCAGGGTTCCAAGGAGCTCACTACACCCCTGGTCAATCAATGGCCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATCCCCAGTGACCACGCCCCTCTGGCCCAGGGTTCCAAGGAGCTCACTACACCCCTGGTCAATCAATGGCCCT  1036

Query 1037  CACTGGGAACGCTTAATGGGGCCGAGGGCGCCAGCAACTCCAAGCTCTACCGGAGACACAGCTTCATGAGCACG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTGGGAACGCTTAATGGGGCCGAGGGCGCCAGCAACTCCAAGCTCTACCGGAGACACAGCTTCATGAGCACG  1110

Query 1111  GAGCCGCTGTCAGCTGAAGCCAGTCTGAGCTCGGACTCCCAGCGCCTGGGAGAGGGCACGCGGGACGAGGAGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGCCGCTGTCAGCTGAAGCCAGTCTGAGCTCGGACTCCCAGCGCCTGGGAGAGGGCACGCGGGACGAGGAGCC  1184

Query 1185  CTGGGGTCCCATC-------------------------------------------------------------  1197
            |||||||||||||                                                             
Sbjct 1185  CTGGGGTCCCATCGTAGAGACGGAGTTTCGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATTCACCCACCT  1258

Query 1198  --------------------------GGAAGCTCAGAGCCAAAT  1215
                                      ||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGAAGCTCAGAGCCAAAT  1302