Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467037
• Subject: XM_017007042.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1176
• Gaps: 438

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCCCGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAA  296

Query    1  -------------------------------------------------------------------ATGGCCC  7
                                                                               |||||||
Sbjct  297  GGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC  370

Query    8  GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT  81
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT  444

Query   82  GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA  155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA  518

Query  156  TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT  229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT  592

Query  230  ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG  303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG  666

Query  304  TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT  377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT  740

Query  378  CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT  451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT  814

Query  452  GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC  525
            |||||                                                                     
Sbjct  815  GGAAG---------------------------------------------------------------------  819

Query  526  CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA  599
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  820  ------CAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA  887

Query  600  TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC  673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC  961

Query  674  TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT  1035

Query  748  GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA  821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA  1109

Query  822  TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG  895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG  1183

Query  896  ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC  969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC  1257

Query  970  GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC  1043
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC  1331

Query 1044  AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCT  1117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCT  1405

Query 1118  CAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGG  1191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGG  1479

Query 1192  GGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  GGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1539