Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467155
• Subject: XM_006715241.3
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1364
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCGGTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCGGTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGAT  74

Query   75  GAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTGACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTGACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAAC  148

Query  149  TGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG  222

Query  223  ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC  296

Query  297  CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG  370

Query  371  TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG  444

Query  445  GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA  518

Query  519  ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA  592

Query  593  CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT  666

Query  667  GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA  740

Query  741  GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA  814

Query  815  ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG  888

Query  889  TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA  962

Query  963  ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG  1036

Query 1037  AGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAA  1110
                                                                                      
Sbjct 1037  --------------------------------------------------------------------------  1036

Query 1111  GAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA  1184
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ----------------AGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA  1094

Query 1185  TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCC  1168

Query 1259  ACAGTTTCTGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  ACAGTTTCTGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATT  1242

Query 1333  AAGTCCAAAACATACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAA  1406
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  AAGTCCAAAACGTACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAA  1316

Query 1407  AGAACGACGAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC  1455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  AGAACGACGAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC  1365