Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467155
• Subject: XM_017011462.1
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1283
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCGGTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTGACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG  222
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------ATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG  51

Query  223  ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   52  ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC  125

Query  297  CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG  199

Query  371  TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG  273

Query  445  GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA  347

Query  519  ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA  421

Query  593  CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT  495

Query  667  GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA  569

Query  741  GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA  643

Query  815  ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG  717

Query  889  TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA  791

Query  963  ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG  865

Query 1037  AGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  AGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAA  939

Query 1111  GAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  GAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA  1013

Query 1185  TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCC  1087

Query 1259  ACAGTTTCTGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  ACAGTTTCTGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATT  1161

Query 1333  AAGTCCAAAACATACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAA  1406
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  AAGTCCAAAACGTACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAA  1235

Query 1407  AGAACGACGAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC  1455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  AGAACGACGAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC  1284