Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467155
• Subject: XM_017011463.1
• Aligned Length: 1472
• Identities: 1138
• Gaps: 316

Alignment

Query    1  ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCGGTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTGACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG  222
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------ATGATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGG  51

Query  223  ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   52  ACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTC  125

Query  297  CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  CATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAG  199

Query  371  TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  TTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAG  273

Query  445  GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  GAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAA  347

Query  519  ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  ATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTA  421

Query  593  CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  CACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCT  495

Query  667  GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  GGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACA  569

Query  741  GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  GATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGA  643

Query  815  ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  ATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAG  717

Query  889  TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  TCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGA  791

Query  963  ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  ACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGG  865

Query 1037  AGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  AGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAA  939

Query 1111  GAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  GAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGA  1013

Query 1185  TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct 1014  TGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAG----------------------  1065

Query 1259  ACAGTTTCTGCTCCTACTGTATCAATGA-ATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCC------CATTTGTCGGAA  1325
                                  |||.|| ||.|.|    |.|||||..|  |||.|      |||||    |||
Sbjct 1066  ----------------------CAAAGAGATTGTT----CTGAAGACCG--TGCTCTAAGGGCATTT----GAA  1107

Query 1326  GGACATTAAGT-CCAAAACATACTCTTTGGTTCTG-GACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCT-GAG--  1394
            .|||      | |||             |||..|| ||     ||    .|.||||||       ||| |||  
Sbjct 1108  AGAC------TGCCA-------------GGTAGTGCGA-----GC----CTGAGATGG-------TCTGGAGGA  1146

Query 1395  --CTC---AGAAGTGAAAGAACGACGAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC  1455
              |||   ||..|||     ||..||  .||.||                                
Sbjct 1147  TTCTCTCTAGCCGTG-----ACTCCG--CTGCTC--------------------------------  1173