Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467155
• Subject: XM_017011464.1
• Aligned Length: 1478
• Identities: 1092
• Gaps: 361

Alignment

Query    1  ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCGGTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTGACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATG------ATTTCTCGAAACCACTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGC  216
                                   |||      ||||||       .||.|.|||     ||...|||       
Sbjct    1  -----------------------ATGAAGCTTATTTCT-------TCTTTCTTT-----CACTTTCC-------  32

Query  217  CAATGGACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGT  290
                                |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  --------------------CCAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGAACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGT  86

Query  291  CTATTCCATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAAT  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   87  CTATTCCATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTGGAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAAT  160

Query  365  ATGAAGTTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAA  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  161  ATGAAGTTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTCCCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAA  234

Query  439  AATAAGGAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAA  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  AATAAGGAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAGCAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAA  308

Query  513  TTTGAAATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGG  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  TTTGAAATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCAGTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGG  382

Query  587  CCAGTACACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATT  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  CCAGTACACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGAGCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATT  456

Query  661  TACCCTGGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAG  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457  TACCCTGGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAGCCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAG  530

Query  735  CTTACAGATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCG  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  531  CTTACAGATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAAATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCG  604

Query  809  TTATGAATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGAC  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  TTATGAATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGTTGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGAC  678

Query  883  TTACAGTCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGA  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  TTACAGTCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAGTGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGA  752

Query  957  AGAGGAACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTC  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  753  AGAGGAACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAGGACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTC  826

Query 1031  TGCAGGAGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAG  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  TGCAGGAGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAAGGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAG  900

Query 1105  AACAAAGAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACAT  1178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  AACAAAGAATTAGAGCAGACCAAGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACAT  974

Query 1179  GAATGATGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACT  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  975  GAATGATGTGCTAGAGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAG----------------  1032

Query 1253  GTGCCCACAGTTTCTGCTCCTACTGTATCAATGA-ATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCC------CATTTG  1319
                                        |||.|| ||.|.|    |.|||||..|  |||.|      ||||| 
Sbjct 1033  ----------------------------CAAAGAGATTGTT----CTGAAGACCG--TGCTCTAAGGGCATTT-  1071

Query 1320  TCGGAAGGACATTAAGT-CCAAAACATACTCTTTGGTTCTG-GACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCT  1391
               |||.|||      | |||             |||..|| ||     ||    .|.||||||       |||
Sbjct 1072  ---GAAAGAC------TGCCA-------------GGTAGTGCGA-----GC----CTGAGATGG-------TCT  1107

Query 1392  -GAG----CTC---AGAAGTGAAAGAACGACGAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC  1455
             |||    |||   ||..|||     ||..||  .||.||                                
Sbjct 1108  GGAGGATTCTCTCTAGCCGTG-----ACTCCG--CTGCTC--------------------------------  1140