Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467155
• Subject: XR_001743731.2
• Aligned Length: 2156
• Identities: 1454
• Gaps: 701

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GTAGTGCTCCTGCTTCCTGGCCGAGGGCGGGCGAGCGGAGCCTGCTTTCGCAGCGATCGCGAGCGTGTGGCGAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGCTTCTGTCTGTTATTTAGATATGGAAGCTGAGGGGATGCACAGAGGCAGCCAGAACCTAGGTCAGGGTCTCG  148

Query    1  ----------------------------------ATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCG  40
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCGGTGCTGACCGCCCCCGGGGTCGAGTAGGCGATGGGGGAGCCCGGCTTCTTCGTCACAGGAGACCGCGCCG  222

Query   41  GTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGATGAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTG  114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGCCGGAGCTGGTGCCTGCGGCGGGTGGGGATGAGCGCCGGGTGGCTGCTGCTGGAAGATGGGTGCGAGGTG  296

Query  115  ACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAACTGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCA  188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTGTAGGACGAGGATTTGGTGTCACATACCAACTGGTATCAAAAATCTGCCCCCTGATGATTTCTCGAAACCA  370

Query  189  CTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGGACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGA  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGTGTTTTGAAGCAGAATCCTGAGGGCCAATGGACAATTATGGACAACAAGAGTCTAAATGGTGTTTGGCTGA  444

Query  263  ACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTCCATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTG  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACAGAGCGCGTCTGGAACCTTTAAGGGTCTATTCCATTCATCAGGGAGACTACATCCAACTTGGAGTGCCTCTG  518

Query  337  GAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAGTTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTC  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAATAAGGAGAATGCGGAGTATGAATATGAAGTTACTGAAGAAGACTGGGAGACAATATATCCTTGTCTTTC  592

Query  411  CCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAGGAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAG  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCAAAGAATGACCAAATGATAGAAAAAAATAAGGAATTGAGAACTAAAAGGAAATTCAGTTTGGATGAATTAG  666

Query  485  CAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAAATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCA  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGGTCCTGGAGCTGAAGGCCCCTCAAATTTGAAATCCAAAATAAATAAAGTGTCTTGTGAATCTGGTCAGCCA  740

Query  559  GTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTACACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGA  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGAAATCACAGGGGAAAGGTGAAGTGGCCAGTACACCCTCTGACAATTTGGATCCTAAGTTGACTGCCCTTGA  814

Query  633  GCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCTGGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCAAGTAAGACCACAGGGGCTCCCATTTACCCTGGCTTCCCCAAAGTCACAGAGGTTCATCATGAGCAGAAAG  888

Query  707  CCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACAGATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAA  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTCAAACTCTTCAGCATCTCAGAGAAGCTTACAGATGTTTAAGGTGACCATGTCCAGGATTCTGAGGCTCAAA  962

Query  781  ATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGAATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGT  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATACAGATGCAGGAAAAACATGAAGCCGTTATGAATGTGAAAAAGCAGACCCAAAAGGGGAACTCAAAGAAAGT  1036

Query  855  TGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAGTCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAG  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTGCAAATGGAGCAGGAACTTCAGGACTTACAGTCCCAGCTGTGTGCAGAGCAGGCTCAGCAGCAGGCAAGAG  1110

Query  929  TGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGAACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAG  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGGAGCAACTAGAGAAGACTTTCCAGGAAGAGGAACAGCATCTTCAGGGTTTGGAGATAGCCCAAGGAGAAAAG  1184

Query 1003  GACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGGAGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAA  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACCTGAAGCAACAGCTGGCCCAGGCTCTGCAGGAGCATTGGGCTCTAATGGAAGAGCTAAATCGCAGCAAGAA  1258

Query 1077  GGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAAGAATTAGAGCAGACCAA-----------------------  1127
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1259  GGACTTTGAAGCAATCATTCAAGCCAAGAACAAAGAATTAGAGCAGACCAAGGTACTGGAAAGAAGATGGAAGT  1332

Query 1128  ---------GGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGATGTGCTAG  1192
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTAGAATTTGGAAGAGAAGGAGAAGATGCAAGCACAGAAGGAAGAAGTTCTTAGCCACATGAATGATGTGCTAG  1406

Query 1193  AGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCCACAGTTTC  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAATGAGCTCCAATGTATTATTTGTTCAGAATACTTCATTGAGGCTGTCACCTTGAACTGTGCCCACAGTTTC  1480

Query 1267  TGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATTAAGTCCAA  1340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCTCCTACTGTATCAATGAATGGATGAAGCGGAAGATAGAATGCCCCATTTGTCGGAAGGACATTAAGTCCAA  1554

Query 1341  AACATACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAAAGAACGAC  1414
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACGTACTCTTTGGTTCTGGACAATTGCATTAATAAGATGGTAAATAATCTGAGCTCAGAAGTGAAAGAACGAC  1628

Query 1415  GAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTC---------------------------------  1455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 1629  GAATTGTTCTCATTAGGGAACGAAAAGCAAAGAGATTGTTCTGAAGACCGTGCTCTAAGGGCATTTGAAAGACT  1702

Query 1456  --------------------------------------------------------------------------  1455
                                                                                      
Sbjct 1703  GCCAGGTAGTGCGAGCCTGAGATGGTCTGGAGGATTCTCTCTAGCCGTGACTCCGCTGCTCTGAAGGTCAACTG  1776

Query 1456  --------------------------------------------------------------------------  1455
                                                                                      
Sbjct 1777  AGAAGTCTTGTGGGACAGAGACTTGAGTTAGGAAGCCCTCAGTCACTTGCCTTCCACGGTGGCCAGCCCTGCTG  1850

Query 1456  --------------------------------------------------------------------------  1455
                                                                                      
Sbjct 1851  CCATCATTGGCTGAAGCACCACCAGGATTCACGGCACCCAACTGCTTCAGGGTACTTCGTAGACTCTGCCTCAC  1924

Query 1456  --------------------------------------------------------------------------  1455
                                                                                      
Sbjct 1925  TACATGTCGAAAGAGTTATTTGAGTTCTCTTCTGTTTTTTTTTAATTTGTTGTTGTTGTTACTGTTTTGATACC  1998

Query 1456  --------------------------------------------------------------------------  1455
                                                                                      
Sbjct 1999  TCGGAAACACCTCCGTTGACAGTTGTTTTGGATAGGTTGGGTGTACCCCATGGCTGCCTCTGAAGGCAGTGTCT  2072

Query 1456  --------------------------------------------------------------------------  1455
                                                                                      
Sbjct 2073  ATTTTGAGAGGATGGCTTACCTCTTCTTTGTGAAAATACTATCTCATTTCCTGGAAATAAAATGTAAAACCTGT  2146

Query 1456  ----------  1455
                      
Sbjct 2147  CAGTTGCTCA  2156