Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467269
• Subject: NM_001352324.1
• Aligned Length: 1335
• Identities: 912
• Gaps: 423

Alignment

Query    1  ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA  222
                                                                          ||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------ATGTATTCTTCA  12

Query  223  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  86

Query  297  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   87  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  160

Query  371  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  161  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  234

Query  445  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  308

Query  519  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  382

Query  593  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  456

Query  667  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  530

Query  741  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  531  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA  604

Query  815  AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA  678

Query  889  ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG  752

Query  963  TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  753  TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  826

Query 1037  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  900

Query 1111  C-AAAAAATCGTG-------------------------------------------------------------  1122
            | |||||||||||                                                             
Sbjct  901  CAAAAAAATCGTGTGAAGCCTCAGTTTAGGTCATCTGGTGGTTCAGAACACTCAACAGAGGGCTCTGTATCCTT  974

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct  975  GGGGGATGGACAGTTGAACAGATATAGTTCAAGAAACTTTCCAGCTGAACGGCATAACCCCACAGTAACTGGGC  1048

Query 1123  --------------------------------------------------------------------------  1122
                                                                                      
Sbjct 1049  ATCAGGAGCAAACTTACCTTCAGAAGGAGACTTCCACTTTGCAGGTGGAACAGAATGGGGACTATGGTAGGGGC  1122

Query 1123  ---  1122
               
Sbjct 1123  AGG  1125