Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467273
• Subject: NM_001202233.1
• Aligned Length: 1833
• Identities: 1794
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGC  35
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGTTGGCCAAGGCCTGTTGGTCCATCCAGAGTGAGATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGC  74

Query   36  ACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACC  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACC  148

Query  110  TGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACA  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACA  222

Query  184  GGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTC  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTC  296

Query  258  CTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCT  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCT  370

Query  332  GCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCC  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCC  444

Query  406  TGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCA  518

Query  480  CTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCAC  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCAC  592

Query  554  AGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTG  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTG  666

Query  628  TTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGC  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGC  740

Query  702  ACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGG  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGG  814

Query  776  CCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACA  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACA  888

Query  850  TGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGA  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGA  962

Query  924  CTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGG  1036

Query  998  TGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCA  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCA  1110

Query 1072  GATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACT  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACT  1184

Query 1146  GGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCT  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCT  1258

Query 1220  ACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCA  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCA  1332

Query 1294  CCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAA  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAA  1406

Query 1368  GCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGG  1441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGG  1480

Query 1442  ACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGC  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGC  1554

Query 1516  CTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCG  1589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCG  1628

Query 1590  CATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTC  1663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTC  1702

Query 1664  TGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAG  1737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAG  1776

Query 1738  GACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC  1794
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC  1833