Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467273
• Subject: NM_001202234.1
• Aligned Length: 1956
• Identities: 1794
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGACAAGTGCACAGTATAAAATCAAGATTCTAATTGAAGGCCTCCACCATGGACAGAGGCCAGGCCCTGCCCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCCAGGCAGCCTGGCTCCTTCTGCTGGGCCCTGAAGGCAGACGGGATAATGTGGTTGGCCAAGGCCTGTTGGT  148

Query    1  --------------ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCAC  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATCCAGAGTGAGATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCAC  222

Query   61  CTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGC  134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGCAAGCGACCCCCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGC  296

Query  135  TGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACC  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCCCCACTGCCCTGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACC  370

Query  209  AGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACC  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGCCAGGAACAGTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACC  444

Query  283  TCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCC  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCCTGCCTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCC  518

Query  357  AGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGC  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTGGATGAGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGC  592

Query  431  CCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAA  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGCTTCCAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAA  666

Query  505  GGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAG  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGCCTGCGGGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAG  740

Query  579  TCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGC  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTCCCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGC  814

Query  653  TGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGC  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGGGAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGC  888

Query  727  TCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTG  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCGGGGATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTG  962

Query  801  TGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCA  874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCTGTGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCA  1036

Query  875  AGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGA  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCGCACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGA  1110

Query  949  AACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAG  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCGCTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAG  1184

Query 1023  CCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCA  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGAAGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCA  1258

Query 1097  CTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTG  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTTCCCTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTG  1332

Query 1171  GTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGA  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGCTGCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGA  1406

Query 1245  GGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGG  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGTCATCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGG  1480

Query 1319  AGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTC  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTCGGCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTC  1554

Query 1393  TGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTT  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCTCAGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTT  1628

Query 1467  CTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCG  1540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCAAGGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCG  1702

Query 1541  ACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCAC  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCGGCATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCAC  1776

Query 1615  GTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCG  1688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGGCAGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCG  1850

Query 1689  GACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCA  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACCCTGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCA  1924

Query 1763  TTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC  1794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGACAAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC  1956