Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467273
• Subject: XM_005268822.3
• Aligned Length: 2010
• Identities: 1794
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCGCCCCTGCGGTGCAGAGCAGCTCAGGGCCGGCTGGTGCGCGACCCCGGAAAGCGGGGGTGGAGAGGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGCGGAGCCCGCGGGGCCAGGCCTCCACCATGGACAGAGGCCAGGCCCTGCCCCTCCCAGGCAGCCTGGCTCCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGCCC  6
                                                                                ||||||
Sbjct  149  TCTGCTGGGCCCTGAAGGCAGACGGGATAATGTGGTTGGCCAAGGCCTGTTGGTCCATCCAGAGTGAGATGCCC  222

Query    7  TGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGAC  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCCCCTGAC  296

Query   81  CCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCA  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCCTGCCCA  370

Query  155  GCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAG  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACAGTCCAG  444

Query  229  CCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTT  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCACATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGCCTCTGCCTCCTT  518

Query  303  CAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCT  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATGAGGCCCTGTCCT  592

Query  377  CCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAG  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTCCAGCCGCCCCAG  666

Query  451  CTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGA  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCGGGCATGGACAGA  740

Query  525  GCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCC  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGCTGCCCAAAGCCTCTGGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTCCCACCGGCCCCAGCC  814

Query  599  CCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTAT  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGGGAGGGAGAGAGCTAT  888

Query  673  TCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACC  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGGGATACTGGATACACC  962

Query  747  CGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACG  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTGTGTGTGGGGACAACG  1036

Query  821  CTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAAC  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGCACAGTGCAGAAAAAC  1110

Query  895  GCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCG  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCGCTGCCAGTTCTGCCG  1184

Query  969  CTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCC  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGAAGGGGCGGCGGGGCC  1258

Query 1043  GGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACAC  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCCCTGGTCCGTGCACAC  1332

Query 1117  CTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAA  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCTGCCCCACTTTGGGAA  1406

Query 1191  GGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGG  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCATCCGCAAGTGGGCGG  1480

Query 1265  AGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTC  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCGGCCTTCCTGGAGCTC  1554

Query 1339  TTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACA  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTCAGGCCTGGTGCTACA  1628

Query 1413  CCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCT  1486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAAGGTCCCTGCACAGCT  1702

Query 1487  TGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAG  1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGGCATGGGCTGCAGGAG  1776

Query 1561  CCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGA  1634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGCAGCTGTGGCGGGCGA  1850

Query 1635  GCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCC  1708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCCTGTGCACCCAGGGCC  1924

Query 1709  TGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGAC  1782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGACAAGATCTTCATGGAC  1998

Query 1783  ACGCTGCCCTTC  1794
            ||||||||||||
Sbjct 1999  ACGCTGCCCTTC  2010