Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467304
- Subject:
- XM_024446689.1
- Aligned Length:
- 2655
- Identities:
- 1599
- Gaps:
- 1056
Alignment
Query 1 ATGCAGGAAGCAATCATTCTCCTGGCTCTCCTGGGTGCCATGTCAGGGGGAGAAGCACTACACCTAATCCTCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCTGCTACAGGCAATGTGGCAGAGAATTCTCCACCTGGGACTTCAGTGCACAAGTTTTCTGTGAAGTTATCAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CATCATTGTCACCTGTGATCCCAGGATTTCCCCAGATAGTCAACTCAAATCCCCTCACTGAAGCTTTTAGGGTG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AATTGGCTGTCAGGCACCTACTTTGAGGTTGTCACCACTGGGATGGAACAACTAGATTTTGAAACAGGACCAAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CATATTTGATTTGCAGATTTATGTGAAGGATGAGGTTGGTGTCACAGACCTTCAAGTCCTGACTGTCCAGGTAA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CAGATGTGAACGAGCCACCTCAGTTTCAAGGCAACTTGGCAGAAGGTCTACACCTCTACATAGTAGAAAGAGCA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AACCCTGGATTCATTTACCAGGTTGAGGCCTTCGATCCAGAAGACACAAGCCGAAACATTCCCCTCAGTTATTT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CCTGATTTCTCCCCCAAAGAGCTTCAGAATGTCTGCTAATGGCACCCTCTTCTCCACAACAGAATTGGACTTTG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 AAGCAGGACACAGAAGTTTCCATCTCATCGTGGAGGTGAGGGACAGTGGAGGCCTCAAAGCCTCCACAGAGCTC 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 CAGGTGAACATCGTGAACCTCAACGACGAAGTCCCTCGCTTTACCAGCCCGACACGAGTGTACACAGTCCTGGA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 GGAACTGAGTCCAGGAACCATCGTGGCCAATATCACAGCGGAGGATCCTGATGATGAAGGTTTTCCCAGCCACC 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 TCCTCTACAGCATTACCACTGTTAGCAAATATTTCATGATAAATCAGTTGACTGGTACAATCCAAGTGGCCCAA 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 AGGATAGACCGAGATGCAGGTGAATTGAGACAAAATCCCACCATTTCCCTGGAAGTTCTAGTGAAGGACAGACC 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 ATATGGGGGTCAGGAGAATCGCATCCAGATAACCTTCATTGTGGAAGACGTCAACGACAATCCTGCCACATGCC 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 AAAAGTTCACCTTCAGCATTATGGTGCCGGAAAGAACAGCCAAGGGGACGTTGCTTCTTGACCTAAACAAGTTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 --------------------ATGGTGCCGGAAAGAACAGCCAAGGGGACGTTGCTTCTTGACCTAAACAAGTTC 54
Query 1111 TGCTTTGATGATGACAGTGAGGCACCAAACAACAGATTCAACTTCACCATGCCATCTGGAGTGGGGAGCGGCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 55 TGCTTTGATGATGACAGTGAGGCACCAAACAACAGATTCAACTTCACCATGCCATCTGGAGTGGGGAGCGGCAG 128
Query 1185 CAGATTTTTACAGGATCCAGCTGGCTCTGGGAAGATTGTGCTGATTGGTGATCTAGACTACGAAAATCCAAGTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 129 CAGATTTTTACAGGATCCAGCTGGCTCTGGGAAGATTGTGCTGATTGGTGATCTAGACTACGAAAATCCAAGTA 202
Query 1259 ACCTAGCAGCCGGCAATAAATATACGGTGATAATCCAGGTGCAGGATGTGGCCCCCCCTTACTATAAAAATAAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 203 ACCTAGCAGCCGGCAATAAATATACGGTGATAATCCAGGTGCAGGATGTGGCCCCCCCTTACTATAAAAATAAC 276
Query 1333 GTCTACGTTTATATCCTAACAAGCCCAGAAAATGAGTTTCCTCTCATTTTTGATAGGCCATCCTATGTATTTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 277 GTCTACGTTTATATCCTAACAAGCCCAGAAAATGAGTTTCCTCTCATTTTTGATAGGCCATCCTATGTATTTGA 350
Query 1407 TGTGTCAGAAAGAAGGCCCGCCAGAACCCGAGTGGGACAGGTGCGAGCCACTGATAAAGACCTCCCCCAGAGCA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TGTGTCAGAAAGAAGGCCCGCCAGAACCCGAGTGGGACAGGTGCGAGCCACTGATAAAGACCTCCCCCAGAGCA 424
Query 1481 GCCTCCTGTACTCCATCTCCACTGGAGGGGCCAGCCTCCAGTATCCAAATGTATTTTGGATTAATCCCAAGACA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 GCCTCCTGTACTCCATCTCCACTGGAGGGGCCAGCCTCCAGTATCCAAATGTATTTTGGATTAATCCCAAGACA 498
Query 1555 GGAGAACTCCAGCTGGTAACTAAAGTGGACTGTGAAACAACCCCCATCTATATTCTCAGAATCCAGGCCACCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 GGAGAACTCCAGCTGGTAACTAAAGTGGACTGTGAAACAACCCCCATCTATATTCTCAGAATCCAGGCCACCAA 572
Query 1629 CAACGAAGACACAAGCTCTGTCACTGTTACTGTGAACATCCTTGAAGAAAATGATGAAAAGCCAATTTGTACTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 CAACGAAGACACAAGCTCTGTCACTGTTACTGTGAACATCCTTGAAGAAAATGATGAAAAGCCAATTTGTACTC 646
Query 1703 CAAACTCTTATTTCCTGGCCCTCCCAGTGGATCTGAAAGTTGGCACAAATATTCAGAATTTCAAGCTGACATGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 CAAACTCTTATTTCCTGGCCCTCCCAGTGGATCTGAAAGTTGGCACAAATATTCAGAATTTCAAGCTGACATGT 720
Query 1777 ACCGACCTTGATTCCAGCCCCAGATCTTTCCGTTATTCCATTGGCCCAGGTAACGTCAACAATCATTTCACCTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 ACCGACCTTGATTCCAGCCCCAGATCTTTCCGTTATTCCATTGGCCCAGGTAACGTCAACAATCATTTCACCTT 794
Query 1851 CTCTCCCAATGCTGGTTCCAATGTCACACGCCTGCTGCTTACATCTCGCTTTGACTATGCTGGTGGGTTTGATA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 CTCTCCCAATGCTGGTTCCAATGTCACACGCCTGCTGCTTACATCTCGCTTTGACTATGCTGGTGGGTTTGATA 868
Query 1925 AGATCTGGGACTACAAGCTACTTGTCTACGTAACTGATGACAACTTGATGTCTGACAGGAAGAAAGCGGAGGCT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 AGATCTGGGACTACAAGCTACTTGTCTACGTAACTGATGACAACTTGATGTCTGACAGGAAGAAAGCGGAGGCT 942
Query 1999 CTTGTTGAGACAGGAACAGTGACACTGAGTATTAAAGTCATTCCCCACCCAACCACTATCATCACCACGACCCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 CTTGTTGAGACAGGAACAGTGACACTGAGTATTAAAGTCATTCCCCACCCAACCACTATCATCACCACGACCCC 1016
Query 2073 CAGGCCCAGGGTCACCTATCAGGTCCTGAGGAAAAACGTTTACTCTCCATCTGCATGGTACGTGCCGTTTGTCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 CAGGCCCAGGGTCACCTATCAGGTCCTGAGGAAAAACGTTTACTCTCCATCTGCATGGTACGTGCCGTTTGTCA 1090
Query 2147 TCACTTTGGGCTCCATATTGCTTCTGGGTCTCCTCGTGTACCTGGTCGTCCTATTGGCCAAAGCCATCCACAGA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 TCACTTTGGGCTCCATATTGCTTCTGGGTCTCCTCGTGTACCTGGTCGTCCTATTGGCCAAAGCCATCCACAGA 1164
Query 2221 CACTGCCCCTGCAAGACTGGGAAGAACAAGGAACCTCTGACAAAGAAAGGAGAAACGAAGACTGCAGAGAGAGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 CACTGCCCCTGCAAGACTGGGAAGAACAAGGAACCTCTGACAAAGAAAGGAGAAACGAAGACTGCAGAGAGAGA 1238
Query 2295 CGTCGTGGTGGAAACTATCCAGATGAACACTATCTTTGATGGAGAAGCCATAGATCCAGTGACCGGGGAAACAT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1239 CGTCGTGGTGGAAACTATCCAGATGAACACTATCTTTGATGGAGAAGCCATAGATCCAGTGACCGGGGAAACAT 1312
Query 2369 ATGAATTCAACTCAAAAACTGGAGCCAGAAAGTGGAAAGATCCACTAACCCAAATGCCAAAATGGAAAGAGTCC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 ATGAATTCAACTCAAAAACTGGAGCCAGAAAGTGGAAAGATCCACTAACCCAAATGCCAAAATGGAAAGAGTCC 1386
Query 2443 AGCCACCAGGGAGCTGCCCCACGCAGAGTCACTGCTGGGGAAGGGATGGGGTCACTGAGAAGTGCCAACTGGGA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 AGCCACCAGGGAGCTGCCCCACGCAGAGTCACTGCTGGGGAAGGGATGGGGTCACTGAGAAGTGCCAACTGGGA 1460
Query 2517 AGAAGATGAGCTGAGTGGCAAAGCGTGGGCTGAGGATGCTGGTCTGGGTTCCAGAAATGAGGGTGGCAAGCTGG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 AGAAGATGAGCTGAGTGGCAAAGCGTGGGCTGAGGATGCTGGTCTGGGTTCCAGAAATGAGGGTGGCAAGCTGG 1534
Query 2591 GCAACCCAAAGAACAGAAATCCAGCCTTCATGAACAGGGCTTACCCCAAACCACACCCAGGAAAG 2655
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 GCAACCCAAAGAACAGAAATCCAGCCTTCATGAACAGGGCTTACCCCAAACCACACCCAGGAAAG 1599
