Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467580
- Subject:
- NM_021494.1
- Aligned Length:
- 3861
- Identities:
- 2352
- Gaps:
- 1245
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGCGGCGGCGGCGGCGGAGGGGGCTCGGCGCCCAGTCGCTTCGCCGACTATTTTGTCATCTGCGGGCTGGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CACCGAGACCGGGCTGGAGCCGGACGAGCTGTCGGCATTATGCCAGTACATTCAGGCTTCTAAAGCCAGGGATG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GTGCCAGCCCTTTCATTTCAAGTACGACTGAAGGAGAAAATTTTGAGCAGACGCCATTGAGACGAACATTCAAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCTAAGGTCCTTGCCCGATACCCTGAGAATGTAGACTGGAATCCCTTTGATCAGGATGCAGTAGGAATGCTGTG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CATGCCCAAAGGGCTGGCATTCAAGACCCAGGCTGATCCCAGGGAGCCACAGTTCCATGCCTTTATTATCACAA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GGGAGGATGGTTCTCGGACATTTGGGTTTGCTCTTACCTTTTATGAAGAAGTGACCAGCAAGCAAATCTGCAGT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GCAATGCAGACCCTCTACCACATGCACAATGCTGAGTATGATGTCCTTCATGCTCCACTTGCTGATGGTGGAGA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CCAGAGTGGCATGGAAGATGGTGAAGGCATTCCTGGGACCAAGCTGCAGCGCTTCAACTCCTATGATATTAGCA 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 GGGACACACTCTATGTCTCTAAATGCATCTGTCTCATTACACCCATGTCTTTCATGAAGGCATGTCGGAGTGTG 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 CTGCAGCAGCTCCACCAGGCAGTCACATCGCCTCAGCCCCCTCCTCTGCCCCTTGAGAGCTACATATACAACGT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 ACTCTATGAGGTGCCACTTCCACCTCCTGGCCGCTCCCTAAAGTTTTCTGGGGTCTATGGGCCAATAATCTGCC 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 AGAGACCAAGTACCAATGAGCTTCCTCTATTCGATTTTCCCGTCAAAGAGGTCTTTGAACTGCTTGGGGTGGAG 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 AATGTGTTTCAGCTTTTTACTTGTGCCCTTCTGGAGTTTCAAATACTGCTCTACTCACAGCATTACCAGAGACT 962
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 963 GATGACTGTGGCGGAGACAATTACAGCTCTGATGTTTCCTTTCCAGTGGCAGCATGTCTATGTCCCCATCCTCC 1036
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1037 CAGCTTCTCTCCTGCATTTCTTAGATGCTCCTGTACCATACCTGATGGGCTTGCATTCCAACGGCCTGGATGAC 1110
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1111 CGCTCCAAGTTGGAGCTGCCTCAGGAGGCTAACCTCTGCTTTGTGGATGTTGACAACCACTTCATTGAGTTGCC 1184
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGGCATTTGGAA 13
|||||.|||||..
Sbjct 1185 AGAGGACTTGCCTCAATTTCCCAACAAACTGGAGTTTGTCCAGGAGGTCTCTGAGATCCTCATGGCCTTTGGCG 1258
Query 14 TTCCCCCTGAAGGGAATCTTCATTGCAGTGAGAGTGCCTCCAAGCTGAAGAGGCTGCGGGCCTCTGAGCTTGTC 87
||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1259 TTCCCCCTGAAGGGAACCTCCATTGCAGCGAAAGCGCCTCAAAGCTGAAGAGGATCCGAGCTTCTGAGCTTGTG 1332
Query 88 TCGGACAAGAGGAATGGGAACATTGCTGGCTCCCCTTTGCATTCCTACGAGCTTCTTAAGGAGAATGAAACTAT 161
||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1333 TCTGACAAGAGGAACGGGAACATTGCGGGCTCCCCTTTGCACTCCTATGAGCTCCTCAAGGAAAATGAAACTAT 1406
Query 162 TGCCCGGCTGCAAGCCTTGGTCAAGAGAACTGGGGTGAGCCTGGAAAAGTTGGAAGTGCGTGAAGACCCCAGCA 235
|||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.|||||..|||||||..|||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 1407 TGCTCGGTTGCAAGCTTTGGTCAAGAGGACTGGAGTGAGTTTGGAAAAACTGGAAGTTCGTGAAGATCCCAGTA 1480
Query 236 GCAATAAGGATCTCAAAGTTCAGTGTGATGAAGAAGAACTCAGGATTTACCAGCTAAACATTCAGATCCGGGAA 309
|||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481 GCAATAAAGATTTCAAAGTTCAATGTGATGAAGAAGAGCTCAGGATTTACCAGCTAAACATTCAAATCCGGGAA 1554
Query 310 GTTTTTGCAAATCGTTTCACTCAGATGTTTGCAGATTATGAGGTGTTTGTCATCCAACCCAGCCAGGATAAGGA 383
||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTCTTTGCCAATCGCTTTACTCAGATGTTTGCCGATTATGAAGTGTTTGTCATCCAGCCCAGCCAGGATAAGGA 1628
Query 384 ATCCTGGTTTACCAACAGGGAGCAAATGCAAAACTTTGATAAAGCATCTTTTCTGTCAGATCAGCCTGAGCCCT 457
.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GTCCTGGTTCACCAACAGGGAACAGATGCAGAACTTTGATAAAGCATCCTTCCTGTCAGATCAGCCTGAGCCCT 1702
Query 458 ACCTGCCCTTCCTCTCAAGATTCCTGGAGACCCAGATGTTTGCATCTTTCATTGACAACAAAATAATGTGTCAT 531
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1703 ACCTGCCCTTCCTCTCAAGATTCCTAGAGACCCAGATGTTTGCATCTTTTATTGATAACAAGATCATGTGTCAT 1776
Query 532 GATGATGATGATAAAGACCCTGTACTCCGGGTATTTGATTCCCGAGTTGACAAGATCAGGCTGTTGAATGTTCG 605
|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 GATGATGATGATAAAGACCCTGTCCTCCGGGTCTTTGACTCAAGGGTAGACAAGATCAGACTGTTGAATGTTCG 1850
Query 606 GACACCTACTCTCCGTACATCCATGTACCAGAAGTGTACCACTGTGGATGAAGCAGAGAAAGCAATTGAGCTGC 679
.|||||||||||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1851 AACACCTACTCTTAGGACATCTATGTACCAGAAGTGTACCACTGTGGATGAAGCAGAAAAAGCAATTGAACTAC 1924
Query 680 GTCTGGCAAAAATTGACCATACTGCAATTCACCCACATTTACTTGACATGAAGATTGGACAAGGGAAATATGAG 753
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1925 GTCTGGCAAAAATTGACCATACTGCAGTTCACCCACATCTTCTTGACATGAAAATTGGACAAGGAAAATATGAA 1998
Query 754 CCGGGCTTCTTCCCTAAGCTGCAGTCTGATGTACTTTCCACTGGGCCAGCCAGCAACAAGTGGACGAAAAGGAA 827
||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1999 CCTGGCTTTTTCCCTAAGCTGCAGTCTGATGTGCTTTGCACCGGGCCAGCCAGCAACAAGTGGACAAAAAGGAA 2072
Query 828 TGCCCCTGCCCAGTGGAGGCGGAAAGATCGGCAGAAGCAGCACACAGAACACCTGCGTTTAGATAATGACCAGA 901
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||
Sbjct 2073 TGCCCCTGCACAGTGGAGGCGGAAAGACCGGCAGAAGCAGCACACAGAACACTTGCGCTTAGACAATGACCAGA 2146
Query 902 GGGAGAAGTACATCCAGGAAGCCAGGACTATGGGCAGCACTATCCGCCAGCCCAAACTGTCCAACCTCTCTCCA 975
|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GAGAGAAGTACATCCAGGAAGCCAGGAATATGGGCAGTACCATCCGTCAGCCCAAACTGTCCAACCTCTCTCCA 2220
Query 976 TCAGTGATTGCCCAGACCAATTGGAAGTTTGTAGAGGGCCTGCTGAAGGAATGCCGCAATAAGACCAAGAGGAT 1049
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 2221 TCAGTCATTGCCCAGACCAACTGGAAGTTTGTAGAAGGCCTGCTGAAGGAATGTCGAAACAAGACCAAGAGGAT 2294
Query 1050 GCTGGTGGAAAAGATGGGCCGAGAAGCTGTGGAGCTAGGGCATGGGGAGGTGAACATCACAGGGGTGGAAGAGA 1123
||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 2295 GCTGGTAGAGAAGATGGGTCGAGAGGCCGTGGAGCTGGGGCATGGGGAGGTGAACATCACCGGTGTGGAAGAGA 2368
Query 1124 ACACCCTGATTGCCAGCCTTTGTGATCTCCTGGAAAGGATCTGGAGTCATGGACTACAAGTGAAACAGGGGAAA 1197
||||..|||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2369 ACACTTTGATTGCCAGCCTCTGTGACCTTCTGGAGAGGATCTGGAGCCATGGGCTACAAGTGAAGCAGGGGAAA 2442
Query 1198 TCAGCCTTATGGTCCCACCTGTTACATTATCAGGACAACCGGCAGAGAAAACTCACATCAGGAAGCCTCAGTAC 1271
|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2443 TCAGCTTTGTGGTCCCATCTGTTACATTATCAGGAAAACCGGCAGAGAAAACTCACATCAGGAAGCCTTAGTAC 2516
Query 1272 CTCAGGAATACTTCTTGATTCAGAACGTAGGAAGTCTGATGCCAGCTCACTCATGCCTCCCCTGAGGATCTCCC 1345
|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..|..|||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 2517 CTCAGGAATACTTCTTGATTCAGAACGGAGAAAGTCTGATGCCAGTGCCGTCATGTCTCCCCTGAGGATTTCCC 2590
Query 1346 TGATTCAGGATATGAGGCACATCCAGAACATCGGGGAAATCAAGACTGATGTGGGAAAGGCCAGAGCATGGGTG 1419
|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2591 TAATTCAGGATATGAGGCACATCCAGAATATTGGGGAAATCAAGACTGATGTGGGAAAAGCCAGAGCATGGGTG 2664
Query 1420 CGACTGTCCATGGAAAAAAAGTTACTTTCCAGACACCTGAAGCAGCTCCTCTCAGACCATGAGCTCACCAAAAA 1493
||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2665 CGACTGTCCATGGAGAAGAAATTACTGTCCAGACACCTGAAGCAGCTTCTTTCAGACCATGAGCTCACCAAGAA 2738
Query 1494 GTTATATAAGCGCTATGCCTTCCTGCGCTGTGATGACGAGAAGGAGCAGTTCCTCTATCACCTCCTGTCTTTCA 1567
|.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 2739 GCTGTACAAGCGTTACGCCTTCCTGCGCTGTGATGACGAGAAGGAGCAGTTCCTCTATCACCTGCTCTCCTTCA 2812
Query 1568 ATGCCGTCGATTACTTTTGCTTCACCAATGTCTTCACAACTATCCTGATCCCGTACCACATTCTGATCGTACCA 1641
|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 2813 ACGCAGTGGACTACTTCTGCTTCACCAACGTCTTTACAACCATCCTGATTCCATACCACATTTTGATTGTACCA 2886
Query 1642 AGCAAGAAGCTGGGGGGCTCCATGTTCACTGCCAACCCATGGATCTGTATATCAGGAGAATTGGGTGAGACACA 1715
||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||
Sbjct 2887 AGCAAGAAGCTGGGCGGCTCCATGTTCACCGCCAACCCGTGGATCTGTATATCAGGAGAGCTGGGTGAGACCCA 2960
Query 1716 GATCATGCAGATTCCCAGGAATGTGCTAGAGATGACCTTCGAGTGCCAGAACTTGGGGAAGCTTACTACTGTCC 1789
||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||.||.|||||||
Sbjct 2961 GATCCTGCAGATCCCCAGGAATGTGCTAGAGATGACGTTTGAGTGCCAGAACCTGGGGAAGCTCACCACTGTCC 3034
Query 1790 AGATTGGCCATGATAACTCTGGGCTGTATGCCAAATGGCTGGTGGAGTATGTGATGGTCAGGAATGAGATCACA 1863
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|.|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3035 AGATTGGCCATGATAATTCTGGGCTGTATGCCAAGTGGCTTGTGGAATGTGTGATGGTCAGGAATGAGGTCACA 3108
Query 1864 GGACATACCTACAAGTTCCCGTGTGGCCGGTGGTTAGGGAAGGGCATGGATGATGGAAGCCTGGAGCGGATCCT 1937
|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||.||||||.|||||||..|.||
Sbjct 3109 GGACACACCTACAAGTTTCCGTGTGGCCGATGGCTGGGGAAGGGTATGGACGACGGAAGCTTGGAGCGCGTGCT 3182
Query 1938 AGTTGGGGAGCTGCTCACATCCCAGCCTGAGGTGGATGAGAGGCCATGCCGGACCCCGCCGCTGCAGCAGTCCC 2011
.|||||||||||||||||.||||..||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 3183 TGTTGGGGAGCTGCTCACTTCCCTACCTGAGGTGGATGAGAGGCCTTGTCGCACTCCGCCACTACAGCAGTCCC 3256
Query 2012 CCAGTGTCATCCGGAGGCTTGTTACCATCTCACCCAACAACAAGCCCAAGCTGAACACTGGGCAGATCCAGGAG 2085
||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 CCAGTGTCATCCGGAGACTTGTGACCATCTCGCCCAACAATAAGCCCAAGCTGAACACTGGGCAGATCCAGGAG 3330
Query 2086 TCCATCGGGGAGGCAGTCAATGGCATTGTGAAGCACTTCCATAAGCCTGAGAAAGAGCGAGGCAGTCTGACGCT 2159
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 3331 TCCATTGGGGAGGCAGTCAATGGCATTGTGAAGCACTTCCATAAACCTGAGAAAGAGCGTGGCAGCCTGACACT 3404
Query 2160 GTTGCTCTGTGGAGAGTGTGGCCTTGTCTCGGCCTTGGAACAGGCTTTCCAGCATGGATTTAAATCGCCCCGGC 2233
|||||||||||||||||||||.||.||.||.||..|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 3405 GTTGCTCTGTGGAGAGTGTGGTCTCGTTTCAGCACTGGAACAAGCTTTTCAGCATGGATTTAAATCACCCCGGC 3478
Query 2234 TCTTCAAAAATGTCTTCATTTGGGATTTCCTGGAAAAAGCACAAACCTATTATGAGACATTAGAGAAGAATGAA 2307
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.
Sbjct 3479 TCTTCAAAAATGTCTTCATTTGGGATTTCCTGGAGAAAGCACAAACCTATTATGAGACGTTAGAGCAGAATGAC 3552
Query 2308 GTAGTCCCTGAGGAAAACTGGCATACAAGAGCCCGGAACTTCTGCCGATTTGTCACTGCAATCAACAATACTCC 2381
|||||.||.||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||.||
Sbjct 3553 GTAGTTCCAGAAGAAAACTGGCACACACGGGCCCGCAATTTCTGCCGCTTTGTCACTGCAGTCAACAACACGCC 3626
Query 2382 CCGGAACATCGGCAAGGATGGCAAGTTTCAGATGCTGGTGTGCTTGGGAGCCAGAGATCACCTCCTACACCACT 2455
|||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 3627 CCGGAACATTGGCAAGGACGGCAAATTTCAGATGCTGGTGTGCCTGGGAGCCAGAGATCACCTCCTGCACCACT 3700
Query 2456 GGATTGCCCTGCTGGCTGACTGCCCCATCACTGCACACATGTATGAGGATGTGGCACTGATCAAAGACCATACA 2529
||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 3701 GGATAGCCTTGCTGGCCGACTGCCCCATCACTGCGCACATGTATGAGGACGTGGCGCTGATCAAGGACCACACA 3774
Query 2530 CTTGTCAATTCCTTGATTCGTGTGCTGCAGACATTGCAGGAGTTCAACATCACGCTGGAGACGTCCCTTGTCAA 2603
||.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct 3775 CTCGTCAATTCCTTGATCCGAGTGCTGCAGACCCTGCAAGAATTCAACATCACACTGGACACTTCCCTCGTTAA 3848
Query 2604 GGGCATCGACATC 2616
||||||.||||||
Sbjct 3849 GGGCATTGACATC 3861
