Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467596
- Subject:
- XM_017313011.1
- Aligned Length:
- 1878
- Identities:
- 1581
- Gaps:
- 99
Alignment
Query 1 ATGGAGACGCCGCCGCTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCTCTCGATTCAAAAGATGATAA 74
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1 ATGGAGACGCCGCCACTGCCTCCCGCATGCACAAAGCAGGGTCATCAGAAGCCCCTCGATTCAAAAGACGAGAA 74
Query 75 TACCGAAAAACACTGCCCAGTGACAGTGAATCCTTGGCATATGAAGAAAGCTTTCAAAGTCATGAACGAATTAA 148
|.|.||.|||||.||||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|
Sbjct 75 TCCTGAGAAACATTGCCCACTGACGGTGAACCCCTGGCACATGAAGAAAGCCTTTAAAGTCATGAACGAACTCA 148
Query 149 GAAGTCAAAATTTGCTGTGCGATGTCACAATTGTGGCAGAAGACATGGAAATTTCTGCTCATAGAGTGGTGCTG 222
|||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||..|.|||||||||
Sbjct 149 GAAGTCAAAATCTGCTGTGTGACGTCACGATTGTGGCAGAAGACATGGAGATCCCTGCTCACCGCGTGGTGCTG 222
Query 223 GCCGCCTGTAGTCCTTATTTTCATGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGTGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTAGAAT 296
||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 223 GCGGCCTGCAGTCCGTACTTCCACGCCATGTTTACAGGTGAGATGAGCGAGAGCCGAGCAAAGAGAGTTCGAAT 296
Query 297 AAAAGAGGTAGATGGCTGGACCCTGAGGATGCTAATTGATTATGTTTACACTGCAGAAATTCAGGTTACAGA-- 368
|||.|||||.||.||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 297 AAAGGAGGTGGACGGCTGGACCCTGAGGATGCTGGTCGATTACGTTTACACGGCAGAGATTCAGGTCACAGAGG 370
Query 369 -----------------------------------------------AGAAA---------------------- 373
|||||
Sbjct 371 AGAACGTGCAGGTGCAATGTAAGTCACTGCATAGAGGATGGAAGAACAGAAAAGAATCAAAGACAACCAGCGGC 444
Query 374 ----------------------------ATGTACAGGTACTTCTCCCAGCAGCTGGTCTCTTACAGTTACAGGA 419
|||.||||||.||.||||||||||||||.||..|||||||||||||
Sbjct 445 CGGCCATCTGGAGTATCCTATAGTTTGTATGAACAGGTCCTCCTCCCAGCAGCTGGCCTGCTACAGTTACAGGA 518
Query 420 TGTGAAGAAGACTTGTTGTGAATTTTTGGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTG 493
||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTGAAGAAGACATGCTGTGAATTTTTAGAATCCCAGCTTCACCCTGTCAACTGCTTAGGAATCCGGGCTTTTG 592
Query 494 CTGATATGCATGCATGTACCGACCTTCTGAACAAGGCCAACACCTATGCAGAGCAACATTTTGCAGATGTTGTA 567
||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 CTGATATGCATGCATGCACAGACCTCCTGAATAAGGCCAACACGTATGCAGAACAACATTTTGCAGATGTCGTA 666
Query 568 CTTAGTGAAGAATTTCTCAATCTTGGCATCGAACAAGTGTGCAGCTTAATCTCAAGTGACAAACTTACCATTTC 641
|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 667 CTTAGTGAAGAGTTTCTTAACCTCGGCATCGAGCAGGTGTGCAGCTTAATCTCCAGTGATAAACTCACCATTTC 740
Query 642 TTCAGAAGAGAAGGTATTTGAAGCAGTAATAGCATGGGTGAACCATGACAAGGATGTGAGGCAAGAGTTTATGG 715
.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct 741 CTCCGAGGAGAAGGTATTTGAAGCAGTCATCGCCTGGGTAAACCACGATAAGGACGTAAGACAGGAGTTCATGG 814
Query 716 CCCGACTGATGGAACATGTACGGTTACCTTTGCTTCCTCGGGAATATTTAGTTCAGAGGGTTGAAGAGGAAGCA 789
|.||.||.|||||.|||||.||.||||||.|||||||||||||.||.||.||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCGGCTCATGGAGCATGTCCGATTACCTCTGCTTCCTCGGGAGTACTTGGTGCAGCGGGTTGAAGAGGAAGCA 888
Query 790 TTGGTCAAGAATAGCAGTGCTTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCAATGAAGTACCATTTGCTGCCAACAGAGCA 863
|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.||||||||
Sbjct 889 TTGGTGAAGAACAGCAGTGCGTGCAAAGATTACCTCATTGAAGCCATGAAGTACCACCTGCTGCCGACAGAGCA 962
Query 864 GCGTATATTAATGAAGAGTGTCCGGACCCGGCTGAGGACACCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTTG 937
|||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 963 GCGCATGTTAATGAAGAGCGTGCGGACCCGCCTGAGGACGCCCATGAACCTTCCCAAATTGATGGTGGTGGTCG 1036
Query 938 GGGGCCAAGCACCAAAGGCTATCCGGAGTGTGGAATGCTATGACTTTAAAGAAGAAAGGTGGCACCAAGTAGCA 1011
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||.|||
Sbjct 1037 GGGGCCAGGCACCAAAGGCTATCCGAAGTGTGGAATGCTACGACTTCAAAGAAGAACGGTGGCACCAGGTGGCA 1110
Query 1012 GAGTTGCCTTCCGGGAGGTGCAGGGCAGGCATGGTCTACATGGCTGGACTTGTTTTTGCTGTTGGTGGCTTTAA 1085
|||.||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 GAGCTGCCTTCCAGGAGGTGCAGGGCAGGGATGGTCTATATGGCTGGGCTGGTCTTTGCTGTTGGTGGCTTCAA 1184
Query 1086 TGGCTCATTAAGAGTTCGCACTGTAGATTCCTACGACCCTGTGAAGGACCAGTGGACCAGCGTTGCTAACATGA 1159
|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||.
Sbjct 1185 TGGCTCACTAAGAGTTCGCACTGTAGATTCCTATGACCCCGTGAAAGACCAGTGGACCAGCGTGGCGAACATGC 1258
Query 1160 GAGACCGGAGAAGCACTTTGGGAGCTGCTGTGTTAAATGGATTATTATACGCTGTGGGAGGCTTTGATGGGAGT 1233
|||||||.||||||||..|.|||||.||.|||.|.|||||..|..|.|||||.|||||.||||||||.||.||.
Sbjct 1259 GAGACCGAAGAAGCACACTTGGAGCCGCGGTGCTGAATGGGCTGCTGTACGCCGTGGGGGGCTTTGACGGCAGC 1332
Query 1234 ACAGGTTTGTCATCTGTGGAAGCATACAACATAAAGTCTAATGAGTGGTTTCATGTAGCTCCCATGAATACAAG 1307
||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 1333 ACAGGTCTATCGTCTGTGGAAGCATACAACATAAAATCTAATGAGTGGTTTCATGTCGCCCCAATGAACACGAG 1406
Query 1308 GAGGAGCAGTGTTGGTGTGGGTGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCTGTAGGAGGTTATGATGGAGCATCACGTC 1381
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1407 GAGGAGCAGTGTGGGTGTTGGCGTTGTTGGAGGTTTGCTCTATGCCGTGGGGGGTTACGATGGAGCATCGCGCC 1480
Query 1382 AGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAATGCTACAACAAATGAGTGGACCTATATAGCAGAAATGAGCACCAGG 1455
||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1481 AGTGTCTTAGCACAGTAGAATGCTATAATGCTACTGCAAACGAGTGGACTTACATAGCAGAAATGAGCACCAGA 1554
Query 1456 CGGAGTGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAACAATTTATTGTATGCTGTAGGAGGTCATGATGGCCCTTTAGTACG 1529
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 CGGAGCGGAGCAGGTGTTGGTGTGTTAAACAACTTATTATATGCTGTAGGAGGTCATGATGGTCCTTTAGTACG 1628
Query 1530 AAAAAGTGTTGAAGTATATGATCCCACCACTAACGCATGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAA 1603
|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAAAAGTGTTGAAGTATATGACCCCACCACAAATGCCTGGAGACAGGTTGCAGATATGAACATGTGCAGAAGAA 1702
Query 1604 ATGCAGGAGTTTGTGCAGTTAATGGTCTGTTATATGTTGTTGGAGGGGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCA 1677
|||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1703 ATGCAGGTGTCTGTGCAGTTAATGGTCTGTTGTATGTTGTCGGAGGAGATGATGGTTCCTGTAACTTGGCGTCG 1776
Query 1678 GTAGAATATTATAACCCAACAACCGATAAATGGACAGTTGTGTCATCGTGTATGAGCACAGGGAGAAGTTATGC 1751
|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1777 GTAGAGTATTATAACCCCACCACGGATAAATGGACAGTTGTGTCCTCTTGTATGAGCACGGGGAGAAGCTACGC 1850
Query 1752 AGGGGTCACAGTTATTGATAAACCATTA 1779
||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1851 AGGGGTCACAGTTATTGATAAACCGTTA 1878