Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467603
• Subject: XM_011514214.2
• Aligned Length: 1491
• Identities: 962
• Gaps: 528

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTCTACCGGACCAGATGTCAAGGCTACAGTGGGGGACATTTCCAGTGATGGCAATTTAAACGTGGCTCAAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAATGCTCCAGGAAAGGTTTTTGTTCAGTCCGACATGGGCTGGCCCTCATCTTGCAGCTCTGTAATTTTTCAA  148

Query    1  --------------ATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCC  60
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTACACCCAACAAATGAACTTGAGCATTGCCATCCCAGCTATGGTGAACAACACAGCCCCACCTAGCCAGCCC  222

Query   61  AATGCCTCCACAGAACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAAT  134
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AATGCTTCCACAGAACGGCCCTCCACTGACTCCCAGGGCTACTGGAATGAAACTCTAAAAGAATTTAAAGCAAT  296

Query  135  GGCCCCTGCATATGACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGG  208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCCCTGCATATGACTGGAGTCCTGAAATCCAGGGAATCATCCTCAGCTCCCTCAACTATGGCTCATTCTTGG  370

Query  209  CTCCAATCCCCAGTGGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCC  282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAATCCCCAGTGGCTATGTGGCTGGAATATTTGGAGCCAAGTATGTGGTTGGTGCTGGCTTGTTTATTTCC  444

Query  283  TCATTCCTGACCCTCTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACA  356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCATTCCTGACCCTCTTCATTCCACTGGCAGCTAATGCGGGAGTGGCCTTGCTCATTGTCCTCCGGATTGTACA  518

Query  357  AGGCATAGCCCAGGTTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGA  430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCATAGCCCAGGTTATGGTATTAACTGGTCAGTATTCAATTTGGGTCAAATGGGCTCCCCCACTGGAAAGGA  592

Query  431  GTCAACTCACCACCATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTC  504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCAACTCACCACCATTGCTGGATCAGGGTCAATGCTGGGGTCCTTCATTGTTCTACTTGCTGGTGGTCTCCTC  666

Query  505  TGCCAGACCATAGGATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTT  578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGCCAGACCATAGGATGGCCTTACGTCTTCTATATCTTTGGAGGAATTGGCTGTGCTTGTTGTCCTCTCTGGTT  740

Query  579  TCCTCTCATTTATGATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCAT  652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTCTCATTTATGATGATCCTGTGAATCATCCCTTTATCAGTGCTGGTGAGAAGAGATACATTGTGTGTTCAT  814

Query  653  TGGCTCAGCAGGACTGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCC  726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCTCAGCAGGACTGTTCACCAGGCTGGTCTCTTCCCATTAGGGCTATGATCAAATCCTTACCACTCTGGGCC  888

Query  727  ATTTTAGTCTCTTATTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTC  800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTTTAGTCTCTTATTTCTGTGAATACTGGCTTTTTTATACCATTATGGCGTACACACCAACGTACATCAGCTC  962

Query  801  GGTACTTCAAGCCAACCTCAGAGATAGTGGGATCCTGTCTGCCTTGCCGTTTGTTGTTGGATGTATCTGCATTA  874
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct  963  GGTACTTCAAGCCAACCTCAGAGAT-------------------------------------------------  987

Query  875  TCCTTGGAGGTCTACTGGCAGACTTTCTTCTCTCCAGAAAAATCCTCAGACTCATCACCATCAGGAAACTCTTC  948
                                                                                      
Sbjct  988  --------------------------------------------------------------------------  987

Query  949  ACTACCATTGGGGTTCTCTTCCCATCCGTGATCCTCGTGTCCCTGCCCTGGGTCAGATCCAGCCACAGCATGAC  1022
                                                                                      
Sbjct  988  --------------------------------------------------------------------------  987

Query 1023  CATGACCTTCTTGGTGCTGTCTTCTGCCATCAGCAGCTTCTGTGAATCAGGAGCCCTTGTTAACTTCTTGGATA  1096
                                                                                      
Sbjct  988  --------------------------------------------------------------------------  987

Query 1097  TTGCTCCTCGGTACACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCT  1170
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  988  ----------GTACACTGGCTTTCTCAAAGGACTATTGCAAGTCTTTGCACACATAGCTGGAGCCATCTCTCCT  1051

Query 1171  ACTGCTGCTGGATTTTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGT  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052  ACTGCTGCTGGATTTTTCATCAGTCAGGATTCAGAGTTTGGTTGGAGAAATGTCTTCTTGCTTTCAGCTGCTGT  1125

Query 1245  TAACATATCGGGCCTGGTTTTCTACCTCATCTTTGGCCGAGCAGATGTGCAGGACTGGGCTAAAGAGCAGACAT  1318
                                                                                      
Sbjct 1126  --------------------------------------------------------------------------  1125

Query 1319  TCACCCACCTC  1329
                       
Sbjct 1126  -----------  1125