Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467640
- Subject:
- NM_009823.1
- Aligned Length:
- 1842
- Identities:
- 1591
- Gaps:
- 63
Alignment
Query 1 ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCA 74
|||.||| .|||| |||| ||.|.||| ||||.|||
Sbjct 1 -------------ATGGTGG------GCGTC-------CCTG---------GAGCGGCC-------GCCTTCCA 32
Query 75 ACGTGCTGGGATTACAGTTGGTCCTGAGAAAAGGGTGCCAGCGATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC 148
|| |||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 33 AC---------------TTGGTTGTGAGAAAAGGGTGCCAGCAATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC 91
Query 149 AGTCCAGATCCTCACCTCCCACCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTC 222
||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 92 AGTCAAGATCCTCACCTCCCATCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTT 165
Query 223 ACTCCTACTGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCTCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCACCGCCACAGAG 296
||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 166 ACTCCTACAGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCCCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCGCCACCACAGAG 239
Query 297 ATTCAGCAATGGTCCTGCCTCCTCCACATCATCTGCACTCACAAATCAGCAATTGCCAGCCACTTGTGGTGCTC 370
||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||..||||.||.|||||||||||||
Sbjct 240 ATTCAGCAATGGGCCTGCCTCCTCCACATCGTCAGCACTAACGAATCAACAGCTGCCGGCTACTTGTGGTGCTC 313
Query 371 GACAACTCAGCAAGTTGAAACGCTTTCTTACCACTCTGCAACAGTTTGGCAATGACATCTCCCCTGAGATTGGG 444
|.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 314 GGCAGCTCAGCAAGTTGAAACGCTTCCTCACCACTCTGCAGCAGTTTGGCAATGATATCTCACCTGAGATCGGC 387
Query 445 GAGAAGGTGCGGACTCTTGTTCTTGCACTGGTGAACTCAACAGTGACAATTGAGGAATTCCACTGTAAGCTCCA 518
||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 388 GAGAAGGTTCGGACTCTCGTTCTAGCCTTGGTGAACTCAACAGTAACAATTGAAGAATTCCATTGCAAGCTCCA 461
Query 519 AGAAGCCACAAACTTTCCCCTTCGTCCTTTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGGG 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 462 GGAGGCCACAAACTTTCCTCTTCGTCCATTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGAG 535
Query 593 AACTGCTGCACTGCGCTCGGGCGGCCAAGCAGACCCCATCCCAGTACCTGGCTCAGCACGAACACCTTCTGCTC 666
|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 536 AACTGCTGCACTGTGCCCGGGCTGCCAAGCAGACCCCGTCCCAGTACCTGGCCCAGCATGAGCACCTTCTGCTC 609
Query 667 AACACAAGCATTGCATCGCCTGCTGACTCGTCAGAGTTGCTCATGGAGGTGCACGGAAATGGGAAGAGGCCCAG 740
|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 610 AACACCAGTATCGCATCTCCTGCTGACTCTTCTGAACTGCTCATGGAGGTTCATGGAAATGGAAAGAGGCCCAG 683
Query 741 TCCAGAGAGGAGAGAAGAGAATAGTTTTGATAGAGACACAATTGCTCCTGAGCCTCCTGCCAAGAGAGTATGTA 814
|||.||.|||||.||.|||||||.||||||.|||||.|||.||.|||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 684 TCCGGAAAGGAGGGACGAGAATAATTTTGAAAGAGATACAGTTCCTCCTGAACCGCCTGCCAAGAGAGTGTGTA 757
Query 815 CCATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCTGCTCTCACTGTGCCCCTCATGAATCCTGGGGGCCAATTCCATCCT 888
|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 758 CTATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCCGCCCTCACTGTTCCCCTTATGAATCCTGGGGGCCAGTTCCATCCT 831
Query 889 ACCCCTCCACCTCTTCAGCATTACACCTTAGAGGATATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCCAACAAGAT 962
||.||.||||||||||||||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 832 ACTCCACCACCTCTTCAGCACTATACACTAGAAGACATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCAAACAAGAT 905
Query 963 GCTAGAGCATCGAGAAGTTCGTGATAGACACCACAGTCTTGGTCTAAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG 1036
||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 GCTAGAACACCGAGAAGTTCGTGAGAGGCACCACAATCTTAGTCTCAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG 979
Query 1037 ATCATCGTTTGACAGAAAGGGAATGGGCTGATGAATGGAAACATCTTGACCATGCGCTGAATTGCATTATGGAA 1110
|.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 980 ACCACCGTTTGACAGAAAGGGAGTGGGCTGATGAATGGAAACACCTTGACCATGCACTGAATTGCATTATGGAA 1053
Query 1111 ATGGTAGAGAAAACAAGGCGCTCTATGGCAGTTCTGCGGCGCTGTCAGGAATCAGATCGTGAAGAACTCAACTA 1184
||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1054 ATGGTAGAGAAAACTAGGCGCTCCATGGCAGTTCTGAGGCGCTGTCAGGAATCTGACCGTGAAGAACTCAACTA 1127
Query 1185 CTGGAAAAGACGGTACAATGAAAACACAGAGCTGAGGAAAACGGGGACCGAGTTGGTCTCCAGGCAGCACAGCC 1258
.||||||.|.||||..||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1128 TTGGAAACGGCGGTTTAATGAAAATACAGAGTTGAGGAAAACTGGGACTGAGTTGGTCTCTAGGCAGCACAGCC 1201
Query 1259 CTGGGAGTGCAGATTCTCTCAGCAATGATTCTCAGAGAGAGTTCAACAGCAGGCCAGGTACAGGATACGTACCT 1332
||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||.||.|.|||.||.||||..||||||||.||.|||
Sbjct 1202 CTGGGAGTACAGATTCTCTCAGCAACGATTCTCAGCGGGAATTTACCAGTAGACCAGCAACAGGATATGTGCCT 1275
Query 1333 GTGGAGTTTTGGAAAAAAACAGAAGAAGCTGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAAGTACAGAAGGC 1406
||||||||||||||.||||| ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1276 GTGGAGTTTTGGAAGAAAAC---AGAAGCCGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAGGTACAGAAGGC 1346
Query 1407 CGTCGCTGAGGCAGAGCAGAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACAGAGAGAGCACGAATGGAGCAAACCATAGCGG 1480
.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1347 TGTAGCTGAGGCAGAGCAAAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACGGAGAGAGCTCGAATGGAGCAGACCATAGCGG 1420
Query 1481 ATGTCAAGCGGCAGGCCGCAGAGGATGCTTTCCTCGTCATCAATGAGCAAGAGGAGTCCACGGAGAACTGCTGG 1554
|||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1421 ATGTCAAACGGCAGGCTGCAGAAGATGCTTTCCTGGTCATCAATGAGCAAGAAGAGTCCACAGAGAACTGCTGG 1494
Query 1555 AACTGTGGCCGCAAAGCCAGCGAGACATGCAGTGGCTGCAATATCGCGCGATACTGTGGCTCTTTCTGCCAGCA 1628
|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1495 AACTGTGGCCGAAAAGCCAGTGAGACGTGCAGTGGCTGCAACATTGCTCGCTACTGCGGCTCCTTCTGCCAGCA 1568
Query 1629 CAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGTCAGAACCTGCATGGCCAGAGCCCCCACGGCCAGGGCCGGC 1702
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.||||||||.||.||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1569 TAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGCCAGAGTCTACATGGCCACAGTCCCCACAGCCAGAGCAGGC 1642
Query 1703 CGCTGCTTCCTGTAGGCAGGGGCTCCTCTGCCAGGTCCGCCGACTGCAGCGTGCCCAGCCCAGCCCTCGACAAG 1776
|.|||||.||||.|||..|||| |||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1643 CACTGCTCCCTGGAGGGCGGGG---CTCAGCCAGGTCTGCTGACTGCAGTGTGCCCAGCCCAGCCCTGGACAAG 1713
Query 1777 ACCTCGGCAACCACATCGCGTTCCTCAACACCTGCTTCTGTGACAGCTATCGACACCAACGGACTC 1842
|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|||||||.|||
Sbjct 1714 ACCTCAGCTACCACCTCACGGTCCTCAACACCTGCCTCTGTGACAGCCATTGATGCCAACGGGCTC 1779