Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467640
- Subject:
- XM_006498640.2
- Aligned Length:
- 1842
- Identities:
- 1542
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACGTGCTGGGATTACAGTTGGTCCTGAGAAAAGGGTGCCAGCGATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC 148
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------ATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC 31
Query 149 AGTCCAGATCCTCACCTCCCACCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTC 222
||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 32 AGTCAAGATCCTCACCTCCCATCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTT 105
Query 223 ACTCCTACTGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCTCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCACCGCCACAGAG 296
||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 106 ACTCCTACAGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCCCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCGCCACCACAGAG 179
Query 297 ATTCAGCAATGGTCCTGCCTCCTCCACATCATCTGCACTCACAAATCAGCAATTGCCAGCCACTTGTGGTGCTC 370
||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||..||||.||.|||||||||||||
Sbjct 180 ATTCAGCAATGGGCCTGCCTCCTCCACATCGTCAGCACTAACGAATCAACAGCTGCCGGCTACTTGTGGTGCTC 253
Query 371 GACAACTCAGCAAGTTGAAACGCTTTCTTACCACTCTGCAACAGTTTGGCAATGACATCTCCCCTGAGATTGGG 444
|.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 254 GGCAGCTCAGCAAGTTGAAACGCTTCCTCACCACTCTGCAGCAGTTTGGCAATGATATCTCACCTGAGATCGGC 327
Query 445 GAGAAGGTGCGGACTCTTGTTCTTGCACTGGTGAACTCAACAGTGACAATTGAGGAATTCCACTGTAAGCTCCA 518
||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 328 GAGAAGGTTCGGACTCTCGTTCTAGCCTTGGTGAACTCAACAGTAACAATTGAAGAATTCCATTGCAAGCTCCA 401
Query 519 AGAAGCCACAAACTTTCCCCTTCGTCCTTTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGGG 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 402 GGAGGCCACAAACTTTCCTCTTCGTCCATTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGAG 475
Query 593 AACTGCTGCACTGCGCTCGGGCGGCCAAGCAGACCCCATCCCAGTACCTGGCTCAGCACGAACACCTTCTGCTC 666
|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 476 AACTGCTGCACTGTGCCCGGGCTGCCAAGCAGACCCCGTCCCAGTACCTGGCCCAGCATGAGCACCTTCTGCTC 549
Query 667 AACACAAGCATTGCATCGCCTGCTGACTCGTCAGAGTTGCTCATGGAGGTGCACGGAAATGGGAAGAGGCCCAG 740
|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 550 AACACCAGTATCGCATCTCCTGCTGACTCTTCTGAACTGCTCATGGAGGTTCATGGAAATGGAAAGAGGCCCAG 623
Query 741 TCCAGAGAGGAGAGAAGAGAATAGTTTTGATAGAGACACAATTGCTCCTGAGCCTCCTGCCAAGAGAGTATGTA 814
|||.||.|||||.||.|||||||.||||||.|||||.|||.||.|||||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct 624 TCCGGAAAGGAGGGACGAGAATAATTTTGAAAGAGATACAGTTCCTCCTGAACCGCCTGCCAAGAGAGTGTGTA 697
Query 815 CCATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCTGCTCTCACTGTGCCCCTCATGAATCCTGGGGGCCAATTCCATCCT 888
|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 698 CTATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCCGCCCTCACTGTTCCCCTTATGAATCCTGGGGGCCAGTTCCATCCT 771
Query 889 ACCCCTCCACCTCTTCAGCATTACACCTTAGAGGATATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCCAACAAGAT 962
||.||.||||||||||||||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 772 ACTCCACCACCTCTTCAGCACTATACACTAGAAGACATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCAAACAAGAT 845
Query 963 GCTAGAGCATCGAGAAGTTCGTGATAGACACCACAGTCTTGGTCTAAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG 1036
||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 GCTAGAACACCGAGAAGTTCGTGAGAGGCACCACAATCTTAGTCTCAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG 919
Query 1037 ATCATCGTTTGACAGAAAGGGAATGGGCTGATGAATGGAAACATCTTGACCATGCGCTGAATTGCATTATGGAA 1110
|.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 920 ACCACCGTTTGACAGAAAGGGAGTGGGCTGATGAATGGAAACACCTTGACCATGCACTGAATTGCATTATGGAA 993
Query 1111 ATGGTAGAGAAAACAAGGCGCTCTATGGCAGTTCTGCGGCGCTGTCAGGAATCAGATCGTGAAGAACTCAACTA 1184
||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 994 ATGGTAGAGAAAACTAGGCGCTCCATGGCAGTTCTGAGGCGCTGTCAGGAATCTGACCGTGAAGAACTCAACTA 1067
Query 1185 CTGGAAAAGACGGTACAATGAAAACACAGAGCTGAGGAAAACGGGGACCGAGTTGGTCTCCAGGCAGCACAGCC 1258
.||||||.|.||||..||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1068 TTGGAAACGGCGGTTTAATGAAAATACAGAGTTGAGGAAAACTGGGACTGAGTTGGTCTCTAGGCAGCACAGCC 1141
Query 1259 CTGGGAGTGCAGATTCTCTCAGCAATGATTCTCAGAGAGAGTTCAACAGCAGGCCAGGTACAGGATACGTACCT 1332
||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||.||.|.|||.||.||||..||||||||.||.|||
Sbjct 1142 CTGGGAGTACAGATTCTCTCAGCAACGATTCTCAGCGGGAATTTACCAGTAGACCAGCAACAGGATATGTGCCT 1215
Query 1333 GTGGAGTTTTGGAAAAAAACAGAAGAAGCTGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAAGTACAGAAGGC 1406
||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1216 GTGGAGTTTTGGAAGAAAACAGAAGAAGCCGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAGGTACAGAAGGC 1289
Query 1407 CGTCGCTGAGGCAGAGCAGAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACAGAGAGAGCACGAATGGAGCAAACCATAGCGG 1480
.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1290 TGTAGCTGAGGCAGAGCAAAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACGGAGAGAGCTCGAATGGAGCAGACCATAGCGG 1363
Query 1481 ATGTCAAGCGGCAGGCCGCAGAGGATGCTTTCCTCGTCATCAATGAGCAAGAGGAGTCCACGGAGAACTGCTGG 1554
|||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1364 ATGTCAAACGGCAGGCTGCAGAAGATGCTTTCCTGGTCATCAATGAGCAAGAAGAGTCCACAGAGAACTGCTGG 1437
Query 1555 AACTGTGGCCGCAAAGCCAGCGAGACATGCAGTGGCTGCAATATCGCGCGATACTGTGGCTCTTTCTGCCAGCA 1628
|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1438 AACTGTGGCCGAAAAGCCAGTGAGACGTGCAGTGGCTGCAACATTGCTCGCTACTGCGGCTCCTTCTGCCAGCA 1511
Query 1629 CAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGTCAGAACCTGCATGGCCAGAGCCCCCACGGCCAGGGCCGGC 1702
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.||||||||.||.||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1512 TAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGCCAGAGTCTACATGGCCACAGTCCCCACAGCCAGAGCAGGC 1585
Query 1703 CGCTGCTTCCTGTAGGCAGGGGCTCCTCTGCCAGGTCCGCCGACTGCAGCGTGCCCAGCCCAGCCCTCGACAAG 1776
|.|||||.||||.|||..|||| |||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1586 CACTGCTCCCTGGAGGGCGGGG---CTCAGCCAGGTCTGCTGACTGCAGTGTGCCCAGCCCAGCCCTGGACAAG 1656
Query 1777 ACCTCGGCAACCACATCGCGTTCCTCAACACCTGCTTCTGTGACAGCTATCGACACCAACGGACTC 1842
|||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|||||||.|||
Sbjct 1657 ACCTCAGCTACCACCTCACGGTCCTCAACACCTGCCTCTGTGACAGCCATTGATGCCAACGGGCTC 1722