Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467640
• Subject: XM_006498641.1
• Aligned Length: 1853
• Identities: 1449
• Gaps: 226

Alignment

Query    1  ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACGTGCTGGGATTACAGTTGGTCCTGAGAAAAGGGTGCCAGCGATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGTCCAGATCCTCACCTCCCACCATGCCACCCCTCCCACCAATAAAT----------CCTGGAG-GACCGAGGC  211
                                                         ||          ||||||| |.|||    
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGGTGGGCGTCCCTGGAGCGGCCG----  25

Query  212  CAGTGTCCTTCACTCCTACTGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCTCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCA  285
                  |||    |||.||     ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   26  ------CCT----TCCAAC-----TAAGCAATGGCATCAACCATTCCCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCG  84

Query  286  CCGCCACAGAGATTCAGCAATGGTCCTGCCTCCTCCACATCATCTGCACTCACAAATCAGCAATTGCCAGCCAC  359
            ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||..||||.||.||
Sbjct   85  CCACCACAGAGATTCAGCAATGGGCCTGCCTCCTCCACATCGTCAGCACTAACGAATCAACAGCTGCCGGCTAC  158

Query  360  TTGTGGTGCTCGACAACTCAGCAAGTTGAAACGCTTTCTTACCACTCTGCAACAGTTTGGCAATGACATCTCCC  433
            ||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  159  TTGTGGTGCTCGGCAGCTCAGCAAGTTGAAACGCTTCCTCACCACTCTGCAGCAGTTTGGCAATGATATCTCAC  232

Query  434  CTGAGATTGGGGAGAAGGTGCGGACTCTTGTTCTTGCACTGGTGAACTCAACAGTGACAATTGAGGAATTCCAC  507
            |||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||..||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct  233  CTGAGATCGGCGAGAAGGTTCGGACTCTCGTTCTAGCCTTGGTGAACTCAACAGTAACAATTGAAGAATTCCAT  306

Query  508  TGTAAGCTCCAAGAAGCCACAAACTTTCCCCTTCGTCCTTTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCT  581
            ||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  307  TGCAAGCTCCAGGAGGCCACAAACTTTCCTCTTCGTCCATTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCT  380

Query  582  GCTGCAGCGGGAACTGCTGCACTGCGCTCGGGCGGCCAAGCAGACCCCATCCCAGTACCTGGCTCAGCACGAAC  655
            |||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  381  GCTGCAGCGAGAACTGCTGCACTGTGCCCGGGCTGCCAAGCAGACCCCGTCCCAGTACCTGGCCCAGCATGAGC  454

Query  656  ACCTTCTGCTCAACACAAGCATTGCATCGCCTGCTGACTCGTCAGAGTTGCTCATGGAGGTGCACGGAAATGGG  729
            ||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  455  ACCTTCTGCTCAACACCAGTATCGCATCTCCTGCTGACTCTTCTGAACTGCTCATGGAGGTTCATGGAAATGGA  528

Query  730  AAGAGGCCCAGTCCAGAGAGGAGAGAAGAGAATAGTTTTGATAGAGACACAATTGCTCCTGAGCCTCCTGCCAA  803
            ||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||.||||||.|||||.|||.||.|||||||.||.||||||||
Sbjct  529  AAGAGGCCCAGTCCGGAAAGGAGGGACGAGAATAATTTTGAAAGAGATACAGTTCCTCCTGAACCGCCTGCCAA  602

Query  804  GAGAGTATGTACCATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCTGCTCTCACTGTGCCCCTCATGAATCCTGGGGGCC  877
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  603  GAGAGTGTGTACTATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCCGCCCTCACTGTTCCCCTTATGAATCCTGGGGGCC  676

Query  878  AATTCCATCCTACCCCTCCACCTCTTCAGCATTACACCTTAGAGGATATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAA  951
            |.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||..||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  AGTTCCATCCTACTCCACCACCTCTTCAGCACTATACACTAGAAGACATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAA  750

Query  952  CCCAACAAGATGCTAGAGCATCGAGAAGTTCGTGATAGACACCACAGTCTTGGTCTAAATGGAGGCTATCAAGA  1025
            ||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||.||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  751  CCAAACAAGATGCTAGAACACCGAGAAGTTCGTGAGAGGCACCACAATCTTAGTCTCAATGGAGGCTATCAAGA  824

Query 1026  TGAGTTGGTAGATCATCGTTTGACAGAAAGGGAATGGGCTGATGAATGGAAACATCTTGACCATGCGCTGAATT  1099
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  825  TGAGTTGGTAGACCACCGTTTGACAGAAAGGGAGTGGGCTGATGAATGGAAACACCTTGACCATGCACTGAATT  898

Query 1100  GCATTATGGAAATGGTAGAGAAAACAAGGCGCTCTATGGCAGTTCTGCGGCGCTGTCAGGAATCAGATCGTGAA  1173
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  899  GCATTATGGAAATGGTAGAGAAAACTAGGCGCTCCATGGCAGTTCTGAGGCGCTGTCAGGAATCTGACCGTGAA  972

Query 1174  GAACTCAACTACTGGAAAAGACGGTACAATGAAAACACAGAGCTGAGGAAAACGGGGACCGAGTTGGTCTCCAG  1247
            |||||||||||.||||||.|.||||..||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  973  GAACTCAACTATTGGAAACGGCGGTTTAATGAAAATACAGAGTTGAGGAAAACTGGGACTGAGTTGGTCTCTAG  1046

Query 1248  GCAGCACAGCCCTGGGAGTGCAGATTCTCTCAGCAATGATTCTCAGAGAGAGTTCAACAGCAGGCCAGGTACAG  1321
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||.||.|.|||.||.||||..||||
Sbjct 1047  GCAGCACAGCCCTGGGAGTACAGATTCTCTCAGCAACGATTCTCAGCGGGAATTTACCAGTAGACCAGCAACAG  1120

Query 1322  GATACGTACCTGTGGAGTTTTGGAAAAAAACAGAAGAAGCTGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAA  1395
            ||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1121  GATATGTGCCTGTGGAGTTTTGGAAGAAAACAGAAGAAGCCGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAG  1194

Query 1396  GTACAGAAGGCCGTCGCTGAGGCAGAGCAGAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACAGAGAGAGCACGAATGGAGCA  1469
            |||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1195  GTACAGAAGGCTGTAGCTGAGGCAGAGCAAAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACGGAGAGAGCTCGAATGGAGCA  1268

Query 1470  AACCATAGCGGATGTCAAGCGGCAGGCCGCAGAGGATGCTTTCCTCGTCATCAATGAGCAAGAGGAGTCCACGG  1543
            .|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1269  GACCATAGCGGATGTCAAACGGCAGGCTGCAGAAGATGCTTTCCTGGTCATCAATGAGCAAGAAGAGTCCACAG  1342

Query 1544  AGAACTGCTGGAACTGTGGCCGCAAAGCCAGCGAGACATGCAGTGGCTGCAATATCGCGCGATACTGTGGCTCT  1617
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1343  AGAACTGCTGGAACTGTGGCCGAAAAGCCAGTGAGACGTGCAGTGGCTGCAACATTGCTCGCTACTGCGGCTCC  1416

Query 1618  TTCTGCCAGCACAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGTCAGAACCTGCATGGCCAGAGCCCCCACGG  1691
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.||||||||.||.||||||.|
Sbjct 1417  TTCTGCCAGCATAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGCCAGAGTCTACATGGCCACAGTCCCCACAG  1490

Query 1692  CCAGGGCCGGCCGCTGCTTCCTGTAGGCAGGGGCTCCTCTGCCAGGTCCGCCGACTGCAGCGTGCCCAGCCCAG  1765
            ||||.||.||||.|||||.||||.|||..||||   |||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1491  CCAGAGCAGGCCACTGCTCCCTGGAGGGCGGGG---CTCAGCCAGGTCTGCTGACTGCAGTGTGCCCAGCCCAG  1561

Query 1766  CCCTCGACAAGACCTCGGCAACCACATCGCGTTCCTCAACACCTGCTTCTGTGACAGCTATCGACACCAACGGA  1839
            ||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||..|||||||.
Sbjct 1562  CCCTGGACAAGACCTCAGCTACCACCTCACGGTCCTCAACACCTGCCTCTGTGACAGCCATTGATGCCAACGGG  1635

Query 1840  CTC  1842
            |||
Sbjct 1636  CTC  1638