Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467640
- Subject:
- XM_017028123.1
- Aligned Length:
- 1850
- Identities:
- 1347
- Gaps:
- 472
Alignment
Query 1 ATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTGCCTGCATTGGCCTCCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACGTGCTGGGATTACAGTTGGTCCTGAGAAAAGGGTGCCAGCGATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC 148
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------ATGCCTGGATCGCCTGTGGAAGTGAAGATAC 31
Query 149 AGTCCAGATCCTCACCTCCCACCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 32 AGTCCAGATCCTCACCTCCCACCATGCCACCCCTCCCACCAATAAATCCTGGAGGACCGAGGCCAGTGTCCTTC 105
Query 223 ACTCCTACTGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCTCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCACCGCCACAGAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106 ACTCCTACTGCATTAAGCAATGGCATCAACCATTCTCCTCCTACCCTGAATGGTGCCCCATCACCGCCACAGAG 179
Query 297 ATTCAGCAATGGTCCTGCCTCCTCCACATCATCTGCACTCACAAATCAGCAATTGCCAGCCACTTGTGGTGCTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180 ATTCAGCAATGGTCCTGCCTCCTCCACATCATCTGCACTCACAAATCAGCAATTGCCAGCCACTTGTGGTGCTC 253
Query 371 GACAACTCAGCAAGTTGAAACGCTTTCTTACCACTCTGCAACAGTTTGGCAATGACATCTCCCCTGAGATTGGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254 GACAACTCAGCAAGTTGAAACGCTTTCTTACCACTCTGCAACAGTTTGGCAATGACATCTCCCCTGAGATTGGG 327
Query 445 GAGAAGGTGCGGACTCTTGTTCTTGCACTGGTGAACTCAACAGTGACAATTGAGGAATTCCACTGTAAGCTCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328 GAGAAGGTGCGGACTCTTGTTCTTGCACTGGTGAACTCAACAGTGACAATTGAGGAATTCCACTGTAAGCTCCA 401
Query 519 AGAAGCCACAAACTTTCCCCTTCGTCCTTTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402 AGAAGCCACAAACTTTCCCCTTCGTCCTTTTGTGATTCCATTTCTCAAGGCCAACCTGCCCCTGCTGCAGCGGG 475
Query 593 AACTGCTGCACTGCGCTCGGGCGGCCAAGCAGACCCCATCCCAGTACCTGGCTCAGCACGAACACCTTCTGCTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476 AACTGCTGCACTGCGCTCGGGCGGCCAAGCAGACCCCATCCCAGTACCTGGCTCAGCACGAACACCTTCTGCTC 549
Query 667 AACACAAGCATTGCATCGCCTGCTGACTCGTCAGAGTTGCTCATGGAGGTGCACGGAAATGGGAAGAGGCCCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550 AACACAAGCATTGCATCGCCTGCTGACTCGTCAGAGTTGCTCATGGAGGTGCACGGAAATGGGAAGAGGCCCAG 623
Query 741 TCCAGAGAGGAGAGAAGAGAATAGTTTTGATAGAGACACAATTGCTCCTGAGCCTCCTGCCAAGAGAGTATGTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624 TCCAGAGAGGAGAGAAGAGAATAGTTTTGATAGAGACACAATTGCTCCTGAGCCTCCTGCCAAGAGAGTATGTA 697
Query 815 CCATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCTGCTCTCACTGTGCCCCTCATGAATCCTGGGGGCCAATTCCATCCT 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 698 CCATCAGCCCTGCTCCTCGGCACAGTCCTGCTCTCACTGTGCCCCTCATGAATCCCGGGGGCCAATTCCATCCT 771
Query 889 ACCCCTCCACCTCTTCAGCATTACACCTTAGAGGATATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCCAACAAGAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772 ACCCCTCCACCTCTTCAGCATTACACCTTAGAGGATATTGCAACTTCTCACCTGTATCGGGAACCCAACAAGAT 845
Query 963 GCTAGAGCATCGAGAAGTTCGTGATAGACACCACAGTCTTGGTCTAAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 GCTAGAGCATCGAGAAGTTCGTGATAGACACCACAGTCTTGGTCTAAATGGAGGCTATCAAGATGAGTTGGTAG 919
Query 1037 ATCATCGTTTGACAGAAAGGGAATGGGCTGATGAATGGAAACATCTTGACCATGCGCTGAATTGCATTATGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 920 ATCATCGTTTGACAGAAAGGGAATGGGCTGATGAATGGAAACATCTTGACCATGCGCTGAATTGCATTATGGAA 993
Query 1111 ATGGTAGAGAAAACAAGGCGCTCTATGGCAGTTCTGCGGCGCTGTCAGGAATCAGATCGTGAAGAACTCAACTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 994 ATGGTAGAGAAAACAAGGCGCTCTATGGCAGTTCTGCGGCGCTGTCAGGAATCAGATCGTGAAGAACTCAACTA 1067
Query 1185 CTGGAAAAGACGGTACAATGAAAACACAGAGCTGAGGAAAACGGGGACCGAGTTGGTCTCCAGGCAGCACAGCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068 CTGGAAAAGACGGTACAATGAAAACACAGAGCTGAGGAAAACGGGGACCGAGTTGGTCTCCAGGCAGCACAGCC 1141
Query 1259 CTGGGAGTGCAGATTCTCTCAGCAATGATTCTCAGAGAGAGTTCAACAGCAGGCCAGGTACAGGATACGTACCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142 CTGGGAGTGCAGATTCTCTCAGCAATGATTCTCAGAGAGAGTTCAACAGCAGGCCAGGTACAGGATACGTACCT 1215
Query 1333 GTGGAGTTTTGGAAAAAAACAGAAGAAGC-TGTGAATAAGGTGAAAATTCAGGCCATGTCAGAAGTACAGAAGG 1405
|||||||||||||||||||| ||| |.|..||.||| |||| ||| ||.|||
Sbjct 1216 GTGGAGTTTTGGAAAAAAAC------AGCGTCTACATTAGG-GAAA--TCA-----------------AGCAGG 1263
Query 1406 CCGTCGCTGA-GGCAGAGCAGAAAGCCTTTGAAGTGATTGCAACAGAGAGAGCACGAATGGAGCAAACCATAGC 1478
.|.|.|.||| ||.|| |||||| ||||| .|||||
Sbjct 1264 GCATTGGTGATGGGAG--------------GAAGTG-----AACAG------------------GAACCA---- 1296
Query 1479 GGATGTCAAGCGGCAGGCCGCAGAGGATGCTTTCCTCGTCATCAATGAGCAAGAGGAGTCCACGGAGAACTGCT 1552
||.|| ||.|||| |.|||.||| ||.|| |
Sbjct 1297 -----------GGTAG------GATGATG-------------------GTAAGTGGA---CAGGG--------T 1323
Query 1553 GGAACTGTGGCCGCAAAGCCAGCGAGACAT---GCAGTGGCTGC---AATATCGCGCGATACTGTGGCTCTTTC 1620
..|| |||.|||| |.|.| ||||| |||| ||| ||.|| |||||
Sbjct 1324 TTAA----------AAACCCAG---GGCTTTTGGCAGT--CTGCCCAAAT-----------CTATG--TCTTT- 1368
Query 1621 TGCCAGCACAAGGACTGGGAGCGGCACCACCGCCTCTGTGGTCAGAACCTGCATGGCCAGAGCCCCCACGGCCA 1694
||..||.|.....|||||
Sbjct 1369 ----------AGCCCTTGTTTGTGCACC---------------------------------------------- 1386
Query 1695 GGGCCGGCCGCTGCTTCCTGTAGGCAGGGGCTCCTCTGCCAGGTCCGCCGACTGCAGCGTGCCCAGCCCAGCCC 1768
Sbjct 1387 -------------------------------------------------------------------------- 1386
Query 1769 TCGACAAGACCTCGGCAACCACATCGCGTTCCTCAACACCTGCTTCTGTGACAGCTATCGACACCAACGGACTC 1842
Sbjct 1387 -------------------------------------------------------------------------- 1386