Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467701
• Subject: XM_011535491.2
• Aligned Length: 1560
• Identities: 1559
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTTCTGCACCCGAGGACTGCTATTTTTTGCCTTCCTGGCAGGTCTGGACATAGAGTTCACGGGCCTTCGTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTCTGCACCCGAGGACTGCTATTTTTTGCCTTCCTGGCAGGTCTGGACATAGAGTTCACGGGCCTTCGTTC  74

Query   75  TAACCTGTCTGGGCCCCAGCAGATCAGTCTTTTTGATTTGCCATCGGAGTGGTATCTAAAGACCCGTCAGAGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAACCTGTCTGGGCCCCAGCAGATCAGTCTTTTTGATTTGCCATCGGAGTGGTATCTAAAGACCCGTCAGAGTG  148

Query  149  TTCAGCAATTTACAGTCTGTCAGATTGGATTGTCTGTGTTTTCCGCTATTGAAGGAGAGGCAAACAAGTATATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCAGCAATTTACAGTCTGTCAGATTGGATTGTCTGTGTTTTCCGCTATTGAAGGAGAGGCAAACAAGTATATA  222

Query  223  GCCCATTCGTGTAACTTCTATCTCTTCCCTACAACGTTTGGGATTTTGGACTCAGAATTCTCCTTCCAGGCTTC  296
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCATTCTTGTAACTTCTATCTCTTCCCTACAACGTTTGGGATTTTGGACTCAGAATTCTCCTTCCAGGCTTC  296

Query  297  CAGTGTTCAGTTTTTGAATCAGTATGGCTTCAACTATAACAAGTTTCTCAAAAACGGAATCCCATATATGAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGTGTTCAGTTTTTGAATCAGTATGGCTTCAACTATAACAAGTTTCTCAAAAACGGAATCCCATATATGAATG  370

Query  371  AAGAACAGGAGAAGAAAATTAGACACGATATCCTGACTGGGAACTGGAGAGTTCGCAGCTCTCCGGATAAAGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAACAGGAGAAGAAAATTAGACACGATATCCTGACTGGGAACTGGAGAGTTCGCAGCTCTCCGGATAAAGAC  444

Query  445  CAAATCAAGGTGGTGATTGACGAAGTGACGCGGTGGCTGGAGCTGGCCAAGGAAGGCGACTGGATGACTCTTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAAATCAAGGTGGTGATTGACGAAGTGACGCGGTGGCTGGAGCTGGCCAAGGAAGGCGACTGGATGACTCTTCC  518

Query  519  TGGGATCACTGGCTTCCAGGCCTTTGAGGTCCAACTGGTGCTGAGGCAGGCCCTCCCCAACATCTGGACGGTGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGATCACTGGCTTCCAGGCCTTTGAGGTCCAACTGGTGCTGAGGCAGGCCCTCCCCAACATCTGGACGGTGC  592

Query  593  TGAAAGATGAGGGGGTGGTAGTGAAGAAAGTGAGTAAACAACATCGTTGGTATCTTCAGAACACCTCTTGTGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAAGATGAGGGGGTGGTAGTGAAGAAAGTGAGTAAACAACATCGTTGGTATCTTCAGAACACCTCTTGTGAC  666

Query  667  CGAGAGAGCTGTTGGAAGGAAAATATTCTTCTCTCAGCAAGGGGTTTTTCTGTCTTTTTCCAAATGCTGGTGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGAGAGAGCTGTTGGAAGGAAAATATTCTTCTCTCAGCAAGGGGTTTTTCTGTCTTTTTCCAAATGCTGGTGAA  740

Query  741  AGCCCAGAAGCCCTTAGTGGGACATAATATGATGATGGACCTGCTGCACCTCCATGAGAAGTTCTTCAGACCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCCCAGAAGCCCTTAGTGGGACATAATATGATGATGGACCTGCTGCACCTCCATGAGAAGTTCTTCAGACCCC  814

Query  815  TCCCAGAAAGCTACGATCAATTTAAGCAGAATATCCACAGCCTATTTCCTGTTCTCATTGATACCAAGAGTGTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCCAGAAAGCTACGATCAATTTAAGCAGAATATCCACAGCCTATTTCCTGTTCTCATTGATACCAAGAGTGTA  888

Query  889  ACAAAGGATATCTGGAAGGAGATGAATTTCCCGAGGGTGTCGAATCTTTCGGAAGTCTATGAAGTCCTGAACAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAAGGATATCTGGAAGGAGATGAATTTCCCGAGGGTGTCGAATCTTTCGGAAGTCTATGAAGTCCTGAACAG  962

Query  963  TGACTTGAATCCCACCAAGAATTCTGGACCAGAGATTGTTCACGCGAGCAGGTGTGAGAAATATGTTGAGACAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACTTGAATCCCACCAAGAATTCTGGACCAGAGATTGTTCACGCGAGCAGGTGTGAGAAATATGTTGAGACAA  1036

Query 1037  AGTGCCCCCACGAAGCCGCGTATGATGCCTTCCTCTGTGGGTCAGTTCTTTTGAAAGTGGCACACTTGCTTCTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGTGCCCCCACGAAGCCGCGTATGATGCCTTCCTCTGTGGGTCAGTTCTTTTGAAAGTGGCACACTTGCTTCTA  1110

Query 1111  CAGAAGATATACCACATCGACCCCGTGCCCGAGTCATCCTTTCCTCAGTACCTTGACGTGCTGGCTCCTTACGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAAGATATACCACATCGACCCCGTGCCCGAGTCATCCTTTCCTCAGTACCTTGACGTGCTGGCTCCTTACGT  1184

Query 1185  GAACCAAGTGAACCTCATCCGAGCGGGGGTCCCAAAGATCAATTTTTCTGGTCCAGATTATCCCAGTATCCGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAACCAAGTGAACCTCATCCGAGCGGGGGTCCCAAAGATCAATTTTTCTGGTCCAGATTATCCCAGTATCCGAC  1258

Query 1259  CTCCCATCCTCATCCTCAGCGTCAAAAGGTGGCCTGGGGTCAGCGAGCAGCAAGTCTACCATAAGTTTCAGAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCCCATCCTCATCCTCAGCGTCAAAAGGTGGCCTGGGGTCAGCGAGCAGCAAGTCTACCATAAGTTTCAGAAT  1332

Query 1333  CTCTGCAAGTTTGATGTCAGGCGACTCACAAGAAGCCAGTTCTTACTCCTGACCAATAAGTTTAAGGATGCGCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCTGCAAGTTTGATGTCAGGCGACTCACAAGAAGCCAGTTCTTACTCCTGACCAATAAGTTTAAGGATGCGCG  1406

Query 1407  GAACATCCTGAAGGAGTACCGGGACCACCCGACCCTGTGCATCTCCCTGTACCGCTACTGGAGGCACTCCCCAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAACATCCTGAAGGAGTACCGGGACCACCCGACCCTGTGCATCTCCCTGTACCGCTACTGGAGGCACTCCCCAA  1480

Query 1481  ACGTCAACTGCCTGCTCCAAGTCTGTGGCATAGTGACTGCCTGGGCCCTTCTCGCGTTCATCCTTGGAAGATCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACGTCAACTGCCTGCTCCAAGTCTGTGGCATAGTGACTGCCTGGGCCCTTCTCGCGTTCATCCTTGGAAGATCT  1554

Query 1555  GGTACC  1560
            ||||||
Sbjct 1555  GGTACC  1560