Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467740
• Subject: XM_017313138.1
• Aligned Length: 2716
• Identities: 1693
• Gaps: 788

Alignment

Query    1  ATGCGTCCAATGCGAATTTTTGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTCCGTTTATCCAACACA  74
            ||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGCGTCCCATGAGAATTTTTGTGAATGATGATCGCCACGTGATGGCAAAGCATTCTTCAGTGTACCCAACACA  74

Query   75  AGAGGAGCTGGAGGCAGTCCAGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTGTGTCCGACTGGATAG  148
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct   75  AGAGGAGCTGGAGGCTGTACAGAACATGGTGTCCCATACTGAGCGGGCCCTGAAGGCTGTCTCTGACTGGATTG  148

Query  149  ACGAGCAGGAAAAGGGTAGCAGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCAGAGGACGACAGTAAA  222
            |.||||||||.||.||.|.||||||||...|.|||.|.||.||.|||||....||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  149  ATGAGCAGGAGAAAGGCAACAGCGAGCTCTCTGAGGCAGAAAATATGGACACACCCCCAGACGATGAGAGCAAA  222

Query  223  GAAGGGGCTGGGGAACAGAAGACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCGGGTGGGCCTGGTGGC  296
            |||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  GAAGGGGCTGGGGAACAGAAGGCGGAACACATGACTAGGACCCTGAGGGGCGTGATGCGGGTCGGCCTGGTAGC  296

Query  297  AAAGGGCCTCCTACTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCC  370
            .|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGGGTCTTCTGCTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTTCTGCTCTGTAAGGAGAAGCCCACAACCGCCC  370

Query  371  TCCTGGACAAGGTGGCCGACAACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAGTACGAAATACTGCAA  444
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct  371  TTCTGGACAAGGTGGCTGACAACCTGGCCATCCAGCTCACTACTGTAACAGAAGACAAGTATGAAATACTCCAG  444

Query  445  TCTGTCGACGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGACCATCCACCTGACATC  518
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||.|||||.||
Sbjct  445  TCTGTGGATGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCCCCCTTGTCCTTGACCATCCATCTGACCTC  518

Query  519  CCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGACCCCCCGGACGTTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  CCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACGATCCCCCGGACGTTC  592

Query  593  TGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAACGGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  593  TGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAGGCCAGAGCCAATGGA  666

Query  667  CTGAAGTCTTGTGTCATTGTGATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCCG  740
            ||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.||||||.||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct  667  CTGAAGTCATGTGTCATTGTCATCCGTGTCCTAAGGGACTTGTGTACCCGAGTGCCCACCTGGGGTCCCCTCAG  740

Query  741  AGGCTGGCCTCTCGAGCTCCTGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGGGTGCTGGCGAGGCCC  814
            |||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  741  AGGATGGCCTCTGGAGCTGCTGTGTGAGAAGTCCATCGGCACTGCCAATAGGCCAATGGGTGCTGGTGAAGCCC  814

Query  815  TGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAA  888
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCATCCGGCATCGTAATGCCAGATGGTTCTGGCATTTATGACCCTTGTGAA  888

Query  889  AAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCACGC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACAGAGTGCGCAGCATGC  962

Query  963  ACTGCGGCTCGCTGCCTTCGGCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTTCCAAGATGCCCAAGA  1036
            .||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  TCTGCGGCTTGCTGCCTTTGGTCAACTCCATAAAGTACTGGGAATGGACCCCCTGCCTTCCAAAATGCCCAAGA  1036

Query 1037  AACCAAAGAATGAAAACCCAGTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTATGCCATTACGCCCATG  1110
            ||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1037  AACCAAAGAACGAGAACCCGGTGGACTACACTGTTCAAATTCCTCCCAGCACCACCTATGCTATCACACCCATG  1110

Query 1111  AAACGCCCAATGGAGGAGGACGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGATTCAGAAGAAAGAGGA  1184
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACGCCCTATGGAAGAGGATGGGGAGGAGAAGTCTCCCAGCAAGAAGAAAAAGAAGATCCAGAAGAAAGAGGA  1184

Query 1185  GAAGGCAGAGCCCCCCCAGGCTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGC  1258
            ||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGGCTGATCCTCCTCAAGCTATGAATGCCCTGATGAGGTTAAATCAGCTGAAGCCAGGGCTGCAGTACAAGC  1258

Query 1259  TGGTGTCCCAGACTGGGCCCGTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGATGGCAATTCATTCGAG  1332
            ||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||.|...||||||
Sbjct 1259  TGATCTCCCAGACAGGCCCTGTTCATGCTCCCATCTTCACCATGTCTGTGGAGGTAGACGGCAGTAACTTCGAG  1332

Query 1333  GCCTCTGGGCCCTCCAAAAAGACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGACATGGGCTTGCCGAC  1406
            |||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||                                    
Sbjct 1333  GCCTCGGGGCCATCTAAAAAGACTGCCAAGCTTCATGT------------------------------------  1370

Query 1407  GGGTGCTGAAGGCAGGGACTCGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGAAGCCAGCAGTGGTGG  1480
                                                                                      
Sbjct 1371  --------------------------------------------------------------------------  1370

Query 1481  CCCCTGCCCCAGTGGTAGAAGCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCCACTGCCGAGAACGTA  1554
                               ||||||                            ||                   
Sbjct 1371  -------------------AGCTGT----------------------------GA-------------------  1378

Query 1555  AAACAGCAGGGGCCGATCCTGACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGAGAAGAGGCGTGGGCT  1628
                |||||||.|||||..||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1379  ----AGCAGGGACCGATTTTGACTAAGCATGGCAAGAACCCTGTTATGGAGCTTAATGAGAAGAGACGTGGCCT  1448

Query 1629  CAAGTACGAGCTCATCTCCGAGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGGTCGAAGTGGATGGAC  1702
            |||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1449  CAAATATGAGCTCATTTCTGAGACGGGGGGCAGCCACGACAAAAGGTTTGTTATGGAGGTTGAGGTGGACGGAC  1522

Query 1703  AGAAGTTCCAAGGTGCTGGTTCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCTGCCCTAGAAAAGCTT  1776
            |||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||..|||||||.|||
Sbjct 1523  AGAAGTTTCAAGGTGCTGGTTCAAACAAAAAGGTGGCAAAGGCTTATGCTGCACTTGCCGCATTAGAAAAACTT  1596

Query 1777  TTCCCTGACACCCCTCTCGCCCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGTCAGAGGGGGACCGAA  1850
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||..||||||||||.|||.||||.|||||.||
Sbjct 1597  TTCCCTGATACCCCTCTTGCTCTTGAAGCCAACAAAAAGAAAAGGACCCCAGTACCTGTCCGAGGTGGACCCAA  1670

Query 1851  ATTTGCTGCTAAGCCACATAACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAGTGCCCCCACCCCCCA  1924
            |||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1671  ATTTGCTGCCAAGCCACACAACCCTGGTTTTGGCATGGGAGGCCCCATGCATAATGAAGTGCCGCCACCTCCTA  1744

Query 1925  ACCTTCGAGGGCGGGGAAGAGGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCAT  1998
            ||.|.|||||.|||||..||||.||.|.||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745  ACATCCGAGGTCGGGGCCGAGGAGGTAACATCCGAGGGCGAGGACGGGGGCGAGGATTTGGTGGCGCCAACCAT  1818

Query 1999  ---GGAGGCTACATGAATGCCGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTCTGCGACAGCAGGCTA  2069
               |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|..||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1819  GGAGGAGGCTACATGAATGCTGGTGCTGGATATGGAAGCTATGGGTACAGCAGCAATTCGGCCACAGCAGGCTA  1892

Query 2070  CAGTGACTTTTTCACAG-ACTGCTACGGCTATCATGATTTTGGGTCTTCC------------------------  2118
            ||||.|.||.|  |||| |.|| .|.|||       |||.||||..|.||                        
Sbjct 1893  CAGTCAGTTCT--ACAGCAATG-GAGGGC-------ATTCTGGGAATGCCGGTGGTGGAGGCAGCGGGGGAGGT  1956

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 1957  GGTGGCTCATCCAGCTACAGCTCCTACTACCAAGGAGACAGCTACAACTCACCAGTACCCCCGAAGCATGCTGG  2030

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2031  GAAGAAGCCGCTGCATGGGGGCCAGCAGAAAGCCTCCTACAGCTCGGGCTACCAGTCCCACCAGGGCCAGCAGC  2104

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2105  AACCTTACAACCAGAGCCAGTACAGCAGCTACGGCACGCCACAGGGCAAGCAGAAAGGCTATGGCCATGGGCAG  2178

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2179  GGCAGCTACTCCTCCTACTCCAACTCTTACAACTCCCCAGGTGGTGGTGGGGGCTCTGACTACAGCTACGACAG  2252

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2253  CAAATTCAACTACAGTGGGAGTGGAGGCCGGAGTGGAGGCAACAGCTATGGCTCCAGCGGGTCATCGTCCTACA  2326

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2327  ACACAGGCTCACATGGAGGCTATGGCACAGGCTCCGGAGGCAGCTCTTCATACCAAGGCAAACAAGGAGGCTAC  2400

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2401  TCATCACAGTCAAACTACAGCTCACCTGGGTCCAGCCAGAGCTACAGTGGTCCTGCCAGCTCCTACCAGTCCTC  2474

Query 2119  ----------------------------------------------------  2118
                                                                
Sbjct 2475  ACAGGGTGGCTACAGTCGGAACACAGAGCACAGCATGAACTACCAGTACAGA  2526