Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467740
• Subject: XM_017313144.1
• Aligned Length: 2136
• Identities: 1851
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ----------AT-----GCGTCCAATGCGAATTTTTGTGAATGATGACCGCCATGTGATGGCAAAGCATTCTTC  59
                      ||     ||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTTCGCATTTCCAGCGTCCCATGAGAATTTTTGTGAATGATGATCGCCACGTGATGGCAAAGCATTCTTC  74

Query   60  CGTTTATCCAACACAAGAGGAGCTGGAGGCAGTCCAGAACATGGTGTCCCACACGGAGCGGGCGCTCAAAGCTG  133
            .||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct   75  AGTGTACCCAACACAAGAGGAGCTGGAGGCTGTACAGAACATGGTGTCCCATACTGAGCGGGCCCTGAAGGCTG  148

Query  134  TGTCCGACTGGATAGACGAGCAGGAAAAGGGTAGCAGCGAGCAGGCAGAGTCCGATAACATGGATGTGCCCCCA  207
            |.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|.||||||||...|.|||.|.||.||.|||||....||||||
Sbjct  149  TCTCTGACTGGATTGATGAGCAGGAGAAAGGCAACAGCGAGCTCTCTGAGGCAGAAAATATGGACACACCCCCA  222

Query  208  GAGGACGACAGTAAAGAAGGGGCTGGGGAACAGAAGACGGAGCACATGACCAGAACCCTGCGGGGAGTGATGCG  281
            ||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||
Sbjct  223  GACGATGAGAGCAAAGAAGGGGCTGGGGAACAGAAGGCGGAACACATGACTAGGACCCTGAGGGGCGTGATGCG  296

Query  282  GGTGGGCCTGGTGGCAAAGGGCCTCCTACTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTGCTGCTGTGTAAGGAGA  355
            |||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  297  GGTCGGCCTGGTAGCCAAGGGTCTTCTGCTCAAGGGGGACTTGGATCTGGAGCTGGTTCTGCTCTGTAAGGAGA  370

Query  356  AGCCCACAACCGCCCTCCTGGACAAGGTGGCCGACAACCTGGCCATCCAGCTTGCTGCTGTAACAGAAGACAAG  429
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCCCACAACCGCCCTTCTGGACAAGGTGGCTGACAACCTGGCCATCCAGCTCACTACTGTAACAGAAGACAAG  444

Query  430  TACGAAATACTGCAATCTGTCGACGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCTCCATTGTCCCTGAC  503
            ||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||
Sbjct  445  TATGAAATACTCCAGTCTGTGGATGATGCTGCGATTGTGATAAAAAACACAAAAGAGCCCCCCTTGTCCTTGAC  518

Query  504  CATCCACCTGACATCCCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACG  577
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCCATCTGACCTCCCCTGTTGTCAGAGAAGAAATGGAGAAAGTATTAGCTGGAGAAACGCTATCAGTCAACG  592

Query  578  ACCCCCCGGACGTTCTGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAG  651
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCCCCCGGACGTTCTGGACAGGCAGAAATGCCTTGCTGCCTTGGCGTCCCTCCGACACGCCAAGTGGTTCCAG  666

Query  652  GCCAGAGCCAACGGGCTGAAGTCTTGTGTCATTGTGATCCGGGTCTTGAGGGACCTGTGCACTCGCGTGCCCAC  725
            |||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.||||||.||||.||.||.||||||||
Sbjct  667  GCCAGAGCCAATGGACTGAAGTCATGTGTCATTGTCATCCGTGTCCTAAGGGACTTGTGTACCCGAGTGCCCAC  740

Query  726  CTGGGGTCCCCTCCGAGGCTGGCCTCTCGAGCTCCTGTGTGAGAAATCCATTGGCACGGCCAACAGACCGATGG  799
            |||||||||||||.||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  741  CTGGGGTCCCCTCAGAGGATGGCCTCTGGAGCTGCTGTGTGAGAAGTCCATCGGCACTGCCAATAGGCCAATGG  814

Query  800  GTGCTGGCGAGGCCCTGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCGTCGGGCATCGTGATGCCAGATGGTTCTGGCATT  873
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCTGGTGAAGCCCTGCGGAGAGTGCTGGAGTGCCTGGCATCCGGCATCGTAATGCCAGATGGTTCTGGCATT  888

Query  874  TATGACCCTTGTGAAAAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACA  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATGACCCTTGTGAAAAAGAAGCCACTGATGCTATTGGGCATCTAGACAGACAGCAACGGGAAGATATCACACA  962

Query  948  GAGTGCGCAGCACGCACTGCGGCTCGCTGCCTTCGGCCAGCTCCATAAAGTCCTAGGCATGGACCCTCTGCCTT  1021
            ||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  GAGTGCGCAGCATGCTCTGCGGCTTGCTGCCTTTGGTCAACTCCATAAAGTACTGGGAATGGACCCCCTGCCTT  1036

Query 1022  CCAAGATGCCCAAGAAACCAAAGAATGAAAACCCAGTGGACTACACCGTTCAGATCCCACCAAGCACCACCTAT  1095
            ||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1037  CCAAAATGCCCAAGAAACCAAAGAACGAGAACCCGGTGGACTACACTGTTCAAATTCCTCCCAGCACCACCTAT  1110

Query 1096  GCCATTACGCCCATGAAACGCCCAATGGAGGAGGACGGGGAGGAGAAGTCGCCCAGCAAAAAGAAGAAGAAGAT  1169
            ||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  GCTATCACACCCATGAAACGCCCTATGGAAGAGGATGGGGAGGAGAAGTCTCCCAGCAAGAAGAAAAAGAAGAT  1184

Query 1170  TCAGAAGAAAGAGGAGAAGGCAGAGCCCCCCCAGGCTATGAATGCCCTGATGCGGTTGAACCAGCTGAAGCCAG  1243
            .||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CCAGAAGAAAGAGGAGAAGGCTGATCCTCCTCAAGCTATGAATGCCCTGATGAGGTTAAATCAGCTGAAGCCAG  1258

Query 1244  GGCTGCAGTACAAGCTGGTGTCCCAGACTGGGCCCGTCCATGCCCCCATCTTTACCATGTCTGTGGAGGTTGAT  1317
            |||||||||||||||||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259  GGCTGCAGTACAAGCTGATCTCCCAGACAGGCCCTGTTCATGCTCCCATCTTCACCATGTCTGTGGAGGTAGAC  1332

Query 1318  GGCAATTCATTCGAGGCCTCTGGGCCCTCCAAAAAGACGGCCAAGCTGCACGTGGCCGTTAAGGTGTTACAGGA  1391
            ||||.|...|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333  GGCAGTAACTTCGAGGCCTCGGGGCCATCTAAAAAGACTGCCAAGCTTCATGTAGCTGTGAAGGTGTTACAGGA  1406

Query 1392  CATGGGCTTGCCGACGGGTGCTGAAGGCAGGGACTCGAGCAAGGGGGAGGACTCGGCTGAGGAGACCGAGGCGA  1465
            ||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.|.||
Sbjct 1407  CATGGGCTTGCCAACAGGCGCTGAAGGCAGAGACTCCAGCAAGGGGGAAGACTCCGCTGAGGAGTCAGATGGGA  1480

Query 1466  AGCCAGCAGTGGTGGCCCCTGCCCCAGTGGTAGAAGCTGTCTCCACCCCTAGTGCGGCCTTTCCCTCAGATGCC  1539
            ||||||||.|.||||||||..||||.|||||.|||||||||||||.|||.|||.|.|.|||.||.|||||||||
Sbjct 1481  AGCCAGCAATAGTGGCCCCACCCCCTGTGGTGGAAGCTGTCTCCAACCCCAGTTCTGTCTTCCCTTCAGATGCC  1554

Query 1540  ACTGCCGAGAACGTAAAACAGCAGGGGCCGATCCTGACAAAGCACGGCAAGAACCCAGTCATGGAGCTGAACGA  1613
            |||.|.|            |||||||.|||||..||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1555  ACTACTG------------AGCAGGGACCGATTTTGACTAAGCATGGCAAGAACCCTGTTATGGAGCTTAATGA  1616

Query 1614  GAAGAGGCGTGGGCTCAAGTACGAGCTCATCTCCGAGACCGGGGGCAGCCACGACAAGCGCTTCGTCATGGAGG  1687
            ||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||..|.||.||.|||||||
Sbjct 1617  GAAGAGACGTGGCCTCAAATATGAGCTCATTTCTGAGACGGGGGGCAGCCACGACAAAAGGTTTGTTATGGAGG  1690

Query 1688  TCGAAGTGGATGGACAGAAGTTCCAAGGTGCTGGTTCCAACAAAAAGGTGGCGAAGGCCTACGCTGCTCTTGCT  1761
            |.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1691  TTGAGGTGGACGGACAGAAGTTTCAAGGTGCTGGTTCAAACAAAAAGGTGGCAAAGGCTTATGCTGCACTTGCC  1764

Query 1762  GCCCTAGAAAAGCTTTTCCCTGACACCCCTCTCGCCCTTGATGCCAACAAAAAGAAGAGAGCCCCAGTACCCGT  1835
            ||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||..||||||||||.||
Sbjct 1765  GCATTAGAAAAACTTTTCCCTGATACCCCTCTTGCTCTTGAAGCCAACAAAAAGAAAAGGACCCCAGTACCTGT  1838

Query 1836  CAGAGGGGGACCGAAATTTGCTGCTAAGCCACATAACCCTGGCTTCGGCATGGGAGGCCCCATGCACAACGAAG  1909
            |.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1839  CCGAGGTGGACCCAAATTTGCTGCCAAGCCACACAACCCTGGTTTTGGCATGGGAGGCCCCATGCATAATGAAG  1912

Query 1910  TGCCCCCACCCCCCAACCTTCGAGGGCGGGGAAGAGGCGGGAGCATCCGGGGACGAGGGCGCGGGCGAGGATTT  1983
            ||||.|||||.||.|||.|.|||||.|||||..||||.||.|.||||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1913  TGCCGCCACCTCCTAACATCCGAGGTCGGGGCCGAGGAGGTAACATCCGAGGGCGAGGACGGGGGCGAGGATTT  1986

Query 1984  GGTGGCGCCAACCAT---GGAGGCTACATGAATGCCGGTGCTGGGTATGGAAGCTATGGGTACGGAGGCAACTC  2054
            |||||||||||||||   |||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.|..||||.||
Sbjct 1987  GGTGGCGCCAACCATGGAGGAGGCTACATGAATGCTGGTGCTGGATATGGAAGCTATGGGTACAGCAGCAATTC  2060

Query 2055  TGCGACAGCAGGCTACAGTGACTTTTTCACAGACTGCTACGGCTATCATGATTTTGGGTCTTCC  2118
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2061  GGCCACAGCAGGCTACAGTGACTTTTTCACAGACTGCTACGGCTATCATGATTTTGGGGCTTCC  2124