Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467745
- Subject:
- NM_009674.3
- Aligned Length:
- 1400
- Identities:
- 1217
- Gaps:
- 13
Alignment
Query 1 ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCAACAGGCTACCCACCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC 74
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCCACCGGCTACCCGCCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC 74
Query 75 TTTTCCCCCTTCTGGTCAGTATCCTTATCCTAGTGGCTTTCCTCCAATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC 148
|||.|||.||.|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||..|
Sbjct 75 TTTCCCCACTGCGGGTCAGTACCCGTACCCTAGTGGCTTTCCACCAATGGGAGGAGGTGCTTACCCACCAGCAC 148
Query 149 CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT 222
|||||.||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 149 CAAGTGGTGGGTATCCAGGAGCTGGAGGCTACCCCGCACCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGGGGCTATCCTGGA 222
Query 223 GCCCCACAG-CCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTG 295
||||.| || ||||||||..|||||.|||||||.|| |||||||||.|||||.|.||||||.||||
Sbjct 223 GCCCTA-AGTCCAGGGGGTCCTCCAGCCTATCCTGG---------AGGCCAAGGCTTTGGGGCCCCACCCGGTG 286
Query 296 GAGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCT 369
||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||.||||.
Sbjct 287 GAGCAGGCTTTTCTGGCTATCCACAGCCACCTGCACAGTCTTATGGTGGCGGACCAGCCCAGGTTCCAGTACCA 360
Query 370 GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAGCCTGCCAC 443
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||||||||.|||||.||..|
Sbjct 361 GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCATCTCAGTACCCTGGAGGACAAGCTCCCTACCCTAGCCAGCCCGCTTC 434
Query 444 AGTGACTCAGGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTC 517
..|||||||||.|||.||||||||.||||..|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 435 GATGACTCAGGGCACCCAAGGAACAATCCTCCCAGCCTCCAACTTTGATGCTATGAGAGATGCAGAAATTCTCC 508
Query 518 GTAAGGCAATGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAG 591
|.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||
Sbjct 509 GCAAAGCAATGAAAGGGTTTGGGACAGACGAGCAAGCAATTGTGGATGTTGTGTCTAACCGTTCCAATGACCAG 582
Query 592 AGGCAAAAAATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAG 665
||||||.||||.||||||||.|||||||||...|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 583 AGGCAACAAATCAAAGCAGCTTTTAAGACCATGTATGGCAAGGATTTAATTAAAGATCTCAAGTCAGAATTGAG 656
Query 666 TGGAAATATGGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAG 739
|||.||||||||||||.|.|||||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 657 TGGGAATATGGAAGAATTAATCCTTGCGCTGTTCATGCCTTCTACATACTATGATGCCTGGAGCTTACGGAAGG 730
Query 740 CAATGCAGGGAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGA 813
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 731 CAATGCAGGGAGCAGGAACTCAAGAACGTGTATTGATAGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAAGAAATTCGA 804
Query 814 GAAATTGTCAGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACA 887
||.|||||.||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 805 GACATTGTTAGATGTTACCAATTAGAATTTGGACGAGACCTTGAGAAGGACATTAGGTCAGATACCTCGGGACA 878
Query 888 TTTTGAACGTTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTC 961
||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||..|||||..|.||||||||.|||||.|
Sbjct 879 TTTTGAACGTCTCCTCGTGTCCATGTGCCAGGGAAACCGTGACGAGAGGCAGAGCGTGAACCACCAGATGGCCC 952
Query 962 AGGAAGATGCTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATC 1035
||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 953 AGGAGGACGCTCAGCGTCTCTATCAGGCCGGGGAGGGGAGACTGGGAACGGATGAATCCTGTTTCAACATGATT 1026
Query 1036 CTTGCCACAAGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTT 1109
||.||||||||.|||||.||||||||||..||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|
Sbjct 1027 CTCGCCACAAGGAGCTTCCCTCAGCTGAAGGCCACTATGGAGGCTTATTCCAGGATGGCTAATCGCGATTTGCT 1100
Query 1110 AAGCAGTGTGAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACC 1183
|||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1101 AAGCAGTGTAAGCCGAGAATTTTCGGGATACGTTGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGCGCCCTCAACC 1174
Query 1184 GCCCTGCCTTCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGG 1257
|||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1175 GCCCTGCCTTCTTTGCTGAACGACTCTACTATTCCATGAAAGGCGCTGGCACGGACGACTCCACCCTGGTCAGG 1248
Query 1258 ATTGTGGTCACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCT 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1249 ATTGTGGTCACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTTCAGATAAAACAGATGTTCACCCAGATGTATCAGAAGACCCT 1322
Query 1332 GGGCACAATGATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTAC-CGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG 1398
..||||||||||.|||.|||||||||||||||||||| .|||| ||.||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1323 AAGCACAATGATCGCAAGTGACACGAGTGGAGATTACAGGAAG-CTGCTCCTGGCCATCGTTGGCCAG 1389