Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467745
- Subject:
- XM_006518453.3
- Aligned Length:
- 1466
- Identities:
- 1220
- Gaps:
- 79
Alignment
Query 1 ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCAACAGGCTACCCACCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC 74
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCATACCCAGGCTATCCCCCCACCGGCTACCCGCCTTTCCCTGGATATCCTCCTGCAGGTCAGGAGTCATC 74
Query 75 TTTTCCCCCTTCTGGTCAGTATCCTTATCCTAGTGGCTTTCCTCCAATGGGAGGAGGTGCCTACCCACAAGTGC 148
|||.|||.||.|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||..|
Sbjct 75 TTTCCCCACTGCGGGTCAGTACCCGTACCCTAGTGGCTTTCCACCAATGGGAGGAGGTGCTTACCCACCAGCAC 148
Query 149 CAAGTAGTGGCTACCCAGGAGCTGGAGGCTACCCTGCGCCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGAGGCTATCCTGGT 222
|||||.||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 149 CAAGTGGTGGGTATCCAGGAGCTGGAGGCTACCCCGCACCTGGAGGTTATCCAGCCCCTGGGGGCTATCCTGGA 222
Query 223 GCCCCACAG-CCAGGGGGAGCTCCATCCTATCCCGGAGTTCCTCCAGGCCAAGGATTTGGAGTCCCACCAGGTG 295
||||.| || ||||||||..|||||.|||||||.|| |||||||||.|||||.|.||||||.||||
Sbjct 223 GCCCTA-AGTCCAGGGGGTCCTCCAGCCTATCCTGG---------AGGCCAAGGCTTTGGGGCCCCACCCGGTG 286
Query 296 GAGCAGGCTTTTCTGGGTATCCACAGCCACCTTCACAGTCTTATGGAGGTGGTCCAGCACAGGTTCCACTACCT 369
||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||.||||.
Sbjct 287 GAGCAGGCTTTTCTGGCTATCCACAGCCACCTGCACAGTCTTATGGTGGCGGACCAGCCCAGGTTCCAGTACCA 360
Query 370 GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCTTCTCAGTATCCTGGAGGACAACCTACTTACCCTAGTCAG-------- 435
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||||||||.|||
Sbjct 361 GGTGGCTTTCCTGGAGGACAGATGCCATCTCAGTACCCTGGAGGACAAGCTCCCTACCCTAGCCAGATCAATAC 434
Query 436 -------------------CCTGC---------------------------CA------------CAGTGACTC 451
||||| || |..||||||
Sbjct 435 AGAATCCTCTTCTTCCTATCCTGCTTTCCCCCCTGTTTCTTTGGATTATAGCAGTGATCCCGCTTCGATGACTC 508
Query 452 AGGTCACTCAAGGAACTATCCGACCAGCTGCCAACTTCGATGCTATAAGAGATGCAGAAATTCTTCGTAAGGCA 525
|||.|||.||||||||.||||..|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 509 AGGGCACCCAAGGAACAATCCTCCCAGCCTCCAACTTTGATGCTATGAGAGATGCAGAAATTCTCCGCAAAGCA 582
Query 526 ATGAAGGGTTTTGGGACAGATGAGCAGGCAATTGTGGATGTGGTGGCCAACCGTTCCAATGATCAGAGGCAAAA 599
|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 583 ATGAAAGGGTTTGGGACAGACGAGCAAGCAATTGTGGATGTTGTGTCTAACCGTTCCAATGACCAGAGGCAACA 656
Query 600 AATTAAAGCAGCATTTAAGACCTCCTATGGCAAGGATTTAATCAAAGATCTCAAATCAGAGTTAAGTGGAAATA 673
|||.||||||||.|||||||||...|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||
Sbjct 657 AATCAAAGCAGCTTTTAAGACCATGTATGGCAAGGATTTAATTAAAGATCTCAAGTCAGAATTGAGTGGGAATA 730
Query 674 TGGAAGAACTGATCCTGGCCCTCTTCATGCCTCCTACGTATTACGATGCCTGGAGCTTACGGAAAGCAATGCAG 747
||||||||.|.|||||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 731 TGGAAGAATTAATCCTTGCGCTGTTCATGCCTTCTACATACTATGATGCCTGGAGCTTACGGAAGGCAATGCAG 804
Query 748 GGAGCAGGAACTCAGGAACGTGTATTGATTGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAGGAAATCCGAGAAATTGT 821
||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 805 GGAGCAGGAACTCAAGAACGTGTATTGATAGAGATTTTGTGCACAAGAACAAATCAAGAAATTCGAGACATTGT 878
Query 822 CAGATGTTATCAGTCAGAATTTGGACGAGACCTTGAAAAGGACATTAGGTCAGATACATCAGGACATTTTGAAC 895
.||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 879 TAGATGTTACCAATTAGAATTTGGACGAGACCTTGAGAAGGACATTAGGTCAGATACCTCGGGACATTTTGAAC 952
Query 896 GTTTACTTGTGTCCATGTGCCAGGGAAATCGTGATGAGAACCAGAGTATAAACCACCAAATGGCTCAGGAAGAT 969
||.|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||..|||||..|.||||||||.|||||.|||||.||.
Sbjct 953 GTCTCCTCGTGTCCATGTGCCAGGGAAACCGTGACGAGAGGCAGAGCGTGAACCACCAGATGGCCCAGGAGGAC 1026
Query 970 GCTCAGCGTCTCTATCAAGCTGGTGAGGGGAGACTAGGGACCGATGAATCTTGCTTTAACATGATCCTTGCCAC 1043
|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1027 GCTCAGCGTCTCTATCAGGCCGGGGAGGGGAGACTGGGAACGGATGAATCCTGTTTCAACATGATTCTCGCCAC 1100
Query 1044 AAGAAGCTTTCCTCAGCTGAGAGCTACCATGGAGGCTTATTCTAGGATGGCTAATCGAGACTTGTTAAGCAGTG 1117
|||.|||||.||||||||||..||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 1101 AAGGAGCTTCCCTCAGCTGAAGGCCACTATGGAGGCTTATTCCAGGATGGCTAATCGCGATTTGCTAAGCAGTG 1174
Query 1118 TGAGCCGTGAGTTTTCCGGATATGTAGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGTGCCCTGAACCGCCCTGCC 1191
|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1175 TAAGCCGAGAATTTTCGGGATACGTTGAAAGTGGTTTGAAGACCATCTTGCAGTGCGCCCTCAACCGCCCTGCC 1248
Query 1192 TTCTTTGCTGAGAGGCTCTACTATGCTATGAAAGGTGCTGGCACAGATGACTCCACCCTGGTCCGGATTGTGGT 1265
|||||||||||..|.|||||||||.|.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1249 TTCTTTGCTGAACGACTCTACTATTCCATGAAAGGCGCTGGCACGGACGACTCCACCCTGGTCAGGATTGTGGT 1322
Query 1266 CACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTACAAATAAAACAGATGTTCGCTCAGATGTATCAGAAGACTCTGGGCACAA 1339
||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||..||||||
Sbjct 1323 CACTCGAAGTGAGATTGACCTTGTTCAGATAAAACAGATGTTCACCCAGATGTATCAGAAGACCCTAAGCACAA 1396
Query 1340 TGATTGCAGGTGACACGAGTGGAGATTAC-CGAAGACTTCTTCTGGCTATTGTGGGCCAG 1398
||||.|||.|||||||||||||||||||| .|||| ||.||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1397 TGATCGCAAGTGACACGAGTGGAGATTACAGGAAG-CTGCTCCTGGCCATCGTTGGCCAG 1455