Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467767
- Subject:
- NM_183014.1
- Aligned Length:
- 2291
- Identities:
- 1877
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 ATGGAAGATCTGTCCTCTCCAGACTCCACCCTTCTCCAAGGGGGACATAATCTACTCTCATCAGCCAGTTTTCA 74
||||.||.||||||||.|.|||||||..||..||||||.|.|||||.|...||||||..|.||.|.|||||||.
Sbjct 1 ATGGCAGGTCTGTCCTTTGCAGACTCTGCCAGTCTCCACGAGGGACGTCCCCTACTCCTACCATCTAGTTTTCG 74
Query 75 GGAATCGGTGACTTTCAAGGATGTGATAGTGGACTTTACCCAGGAAGAATGGAAACAGCTGGACCCTGGCCAGA 148
||||||.|||||.||||||||||||.|.|||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||...||||
Sbjct 75 GGAATCAGTGACCTTCAAGGATGTGGTCGTGAACTTCACTCAGGAAGAATGGAAACACCTGGATCCTATACAGA 148
Query 149 GAGATTTGTTCAGGGATGTGACATTGGAAAATTATACACACCTGGTCTCTATAGGACTCCAAGTTTCTAAACCT 222
|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 149 GAGATTTGTTCAGAGATGTGACACTGGAAAATTATACACATCTGGTCTCTATAGGGCTCCAGGTTTCCAAACCT 222
Query 223 GATGTGATTTCCCAGTTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGA-TCATGGAGCCAAGCATTCCAGTAGGTACCTGTG 295
|||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||| |.| |||..|..|||||||.||.|||.|||..|
Sbjct 223 GATATGATTTCCCAACTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGACTGA-GGATTCGTGCATTCCTGTCGGTCCCTTGG 295
Query 296 CAGACTGGGAGACAAGACTTGAAAATAGTGTGTCAGCCCCAGAGCCTGACATTTCTGAAGAAGAGCTATCTC-C 368
.|||||||.|||.||||..||.|||||||||||||.|||.|||.|.|||||||||||||||..|.|||| || |
Sbjct 296 AAGACTGGAAGAAAAGAGCTGGAAATAGTGTGTCATCCCTAGAACTTGACATTTCTGAAGAGCATCTAT-TCTC 368
Query 369 AGAGGTAATAGTGGAAA--AACA-CAAAAGAGATGATTCTTGGAGTTCCAACTTGCTAGAAAGTTGGGAATATG 439
|||| |.|||.|.|| |||| ||||||.||||||
Sbjct 369 AGAG---ACAGTAGTAACCAACAGCAAAAGGGATGAT------------------------------------- 402
Query 440 AAGGCAGTTTAGAGAGACAGCAGGCAAACCAACAGACACTGCCAAAGGAAAT--AAAGGTAACCGAAAAGACAA 511
||.||||||||||..|..||.|||||||||||||..|||||||.||||.| ||| ||||.||.||.|||.
Sbjct 403 --GGGAGTTTAGAGAAGCTTCAAGCAAACCAACAGATGCTGCCAAGGGAAGTCCAAA--TAACGGAGAAAACAG 472
Query 512 TACCCAGTTGGGAAA--AAGGCCCTGTAAATAATGAATTTGGGAAAAGTGTCAATGTGAGTTCAAACCTTGTAA 583
.|||||.|||.||.| || || |||.||||||.||||.|.|..|||
Sbjct 473 CACCCACTTGTGAGAGCAA--CC---------------------------TCAGTGTGAGCTCAAGCTTCATAA 517
Query 584 CACAA---GAACCATCTCCAGAAGAGACCTCTACTAAAAGAAGCATCAAACAGAATTCAAACCCAGTTAAAAAA 654
||||| |||..|.|||..||..||.|.||.|||||||.|||...|||.||||||||..|||||||||||||.
Sbjct 518 CACAAACGGAAGTAGCTCTCGATCAGCCTTCCACTAAAACAAGAGCCAAGCAGAATTCCCACCCAGTTAAAAAG 591
Query 655 GAGAAATCT-TGTAAGTGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTATTGTTCAGCTCTTATTCGCCATCAGAGAA 727
||| ||.|| |||||||||||.||||||||.|||||.||||.|||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 592 GAG-AAGCTGTGTAAGTGCAACGAATGTGGTAAAGCTTTTACTTACTGTTCTGCTCTCATTCGCCACCAAAGAA 664
Query 728 CACATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTAATGAATGTGAAAAAGCCTTCAGCCGGAGTGAAAACCTTATAAAC 801
|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 665 CGCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTAACAAAGCTTTCAGCAGAAGTGAAAACCTTATAAAC 738
Query 802 CATCAAAGAATTCATACTGGAGATAAACCATATAAATGTGATCAGTGTGGAAAAGGCTTCATTGAGGGTCCATC 875
|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 739 CATCAGAGAATCCATACGGGAGATAAACCGTACAAATGTGACCAGTGTGGAAAGGGTTTCATTGAGGGTCCATC 812
Query 876 TCTTACTCAACATCAAAGAATTCATACTGGAGAAAAACCATATAAATGTGATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTC 949
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 813 TCTCACTCAACATCAAAGAATTCACACTGGAGAAAAGCCCTATAAATGTGATGAATGTGGGAAGGCCTTTAGTC 886
Query 950 AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCATACTGGCGAGAAGCCATACACTTGTAATGAGTGTGGAAAA 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||..||||||||.|||
Sbjct 887 AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAGCCATATACTTGTACCGAGTGTGGGAAA 960
Query 1024 GCCTTTAGCCAGAGAGGCCACTTTATGGAACATCAGAAAATTCATACGGGAGAAAAACCTTTTAAATGTGATGA 1097
.||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 961 TCCTTCAGCCAGAGAGGTCACTTTATGGAGCACCAGAAAATTCATACAGGAGAAAAACCTTTCAAGTGTGAGGA 1034
Query 1098 ATGTGATAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTTACTCAACATCAAAAAATTCATACTGGAGAAAAAACCTATA 1171
.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1035 GTGTGAGAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTCACTCAACATCAGAAAATTCACACTGGGGAGAAAACTTACA 1108
Query 1172 AATGTAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAACGGGCCCTCAACTTTTATCCGTCATCATATGATTCATACTGGTGAA 1245
|.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1109 AGTGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAACGGCCCATCAACGTTTATCCGTCACCATATGATTCATACTGGAGAA 1182
Query 1246 AAACCGTACGAATGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGCACTCAAACCTCACTCAGCATCAAAAAACTCA 1319
||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1183 AAGCCTTATGAGTGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCAGCACTCCAACCTGACTCAGCATCAGAAAACACA 1256
Query 1320 TACTGGGGAGAAACCCTATGATTGTGCAGAATGTGGAAAATCTTTTAGTTACTGGTCATCCCTTGCTCAACACC 1393
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1257 CACTGGGGAGAAACCCTATGACTGTGCAGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTACTGGTCATCCCTAGCTCAGCACC 1330
Query 1394 TGAAAATTCATACTGGAGAAAAACCTTACAAATGCAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTTACTGCTCATCCCTT 1467
|||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|..||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1331 TGAAAATTCATACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGTAGCGACTGCGGGAAGGCCTTCAGTTACTGCTCCTCCCTT 1404
Query 1468 ACTCAACATCGGAGAATTCACACGAGAGAAAAGCCCTTTGAATGCAGTGAATGTGGAAAGGCTTTCAGTTATCT 1541
|||||.||||||||.||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1405 ACTCAGCATCGGAGGATTCACACCCGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCAGTGAGTGTGGAAAGGCTTTCAGCTATCT 1478
Query 1542 CTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCATACTCAAGAGAAAGCTTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCTT 1615
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1479 GTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCACACCCAGGAGAAAGCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCT 1552
Query 1616 TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATCAGTGTCATGAATGT 1689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1553 TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCTTATCAATGTCATGAATGT 1626
Query 1690 GGGAAAACCTTCAGTTATGGTTCATCCCTTATTCAGCATAGGAAGATCCATACTGGAGAACGACCTTACAAGTG 1763
||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 1627 GGAAAAACCTTCAGCTATGGCTCATCTCTTATTCAGCATAAGAAAATCCATACTGGTGAAAGACCTTACAAGTG 1700
Query 1764 TAATGAGTGTGGGAGAGCATTCAACCAGAACATACACCTTACACAGCATAAGAGAATTCATACAGGAGCCAAGC 1837
||||||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1701 TAATGAATGTGGGCGAGCCTTCAACCAGAAAATACACCTTACACAACACAAGAGAATTCATACAGGAGCAAAGC 1774
Query 1838 CTTATGAGTGTGCTGAGTGTGGTAAAGCCTTTCGACATTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA 1911
|.||||..||..|..||||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775 CGTATGCCTGCCCCAAGTGCGGGAAGACCTTTCGACACTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA 1848
Query 1912 GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAATAAATGTGAAAAGACCTTTAGCCAGAGCTCCCATCTAACTCAGCATCAACG 1985
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 1849 GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAACAAATGTGAAAAAACCTTCAGCCAGAACTCCCGTCTGACTCAGCATCAGCG 1922
Query 1986 AATTCACACTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGCAATGAATGTGACAAAGCCTTTAGCCGGAGCACTCATCTGACTG 2059
||||||.||.||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||..|||||.|.|||||...||.|||||||
Sbjct 1923 AATTCATACGGGAGAGAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGACAAATGCTTTACCGGGAGCGTGCACCTGACTG 1996
Query 2060 AACATCAGAATACTCATACTGGAGAGAAACCTTATAACTGTAATGAATGCAGAAAGACTTTTAGCCAGAGCACA 2133
||||||.||.||||||.|||||||||||||||||.|||| .|||.|||..|.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1997 AACATCGGAGTACTCACACTGGAGAGAAACCTTACAACT---CTGAGTGCCCACAGACTTTCAGCCAGAGCACA 2067
Query 2134 TATCTCATTCAGCACCAGAGAATTCATTCAGGAGAGAAGCCTTTTGGATGTAATGATTGTGGAAAATCCTT-CA 2206
||.||||.||||||.||||..|||||||||||||||||||.|||.||.|||.|.||.||||.||||.|||| ||
Sbjct 2068 TACCTCACTCAGCATCAGAAGATTCATTCAGGAGAGAAGCTTTTGGGGTGTGAGGACTGTGAAAAAGCCTTCCA 2141
Query 2207 GATATCGCTCTGCTCTCAACAAACATCAGAGACTGCATCC-----TGGC----ATA--------------- 2253
| |.||.|||||||||||.||||||.||||||.||||.|| |||| .||
Sbjct 2142 G-TGTCACTCTGCTCTCACCAAACACCAGAGATTGCACCCTGCTGTGGCTGCTGTAGGAACATCATTAACA 2211