Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467767
- Subject:
- XM_006516598.3
- Aligned Length:
- 2291
- Identities:
- 1690
- Gaps:
- 343
Alignment
Query 1 ATGGAAGATCTGTCCTCTCCAGACTCCACCCTTCTCCAAGGGGGACATAATCTACTCTCATCAGCCAGTTTTCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAATCGGTGACTTTCAAGGATGTGATAGTGGACTTTACCCAGGAAGAATGGAAACAGCTGGACCCTGGCCAGA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GAGATTTGTTCAGGGATGTGACATTGGAAAATTATACACACCTGGTCTCTATAGGACTCCAAGTTTCTAAACCT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GATGTGATTTCCCAGTTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGA-TCATGGAGCCAAGCATTCCAGTAGGTACCTGTG 295
.||||||||||..|||||||||||||||||||||||| |.| |||..|..|||||||.||.|||.|||..|
Sbjct 1 ---ATGATTTCCCAACTAGAGCAAGGGACAGAGCCATGGACTGA-GGATTCGTGCATTCCTGTCGGTCCCTTGG 70
Query 296 CAGACTGGGAGACAAGACTTGAAAATAGTGTGTCAGCCCCAGAGCCTGACATTTCTGAAGAAGAGCTATCTC-C 368
.|||||||.|||.||||..||.|||||||||||||.|||.|||.|.|||||||||||||||..|.|||| || |
Sbjct 71 AAGACTGGAAGAAAAGAGCTGGAAATAGTGTGTCATCCCTAGAACTTGACATTTCTGAAGAGCATCTAT-TCTC 143
Query 369 AGAGGTAATAGTGGAAA--AACA-CAAAAGAGATGATTCTTGGAGTTCCAACTTGCTAGAAAGTTGGGAATATG 439
|||| |.|||.|.|| |||| ||||||.||||||
Sbjct 144 AGAG---ACAGTAGTAACCAACAGCAAAAGGGATGAT------------------------------------- 177
Query 440 AAGGCAGTTTAGAGAGACAGCAGGCAAACCAACAGACACTGCCAAAGGAAAT--AAAGGTAACCGAAAAGACAA 511
||.||||||||||..|..||.|||||||||||||..|||||||.||||.| ||| ||||.||.||.|||.
Sbjct 178 --GGGAGTTTAGAGAAGCTTCAAGCAAACCAACAGATGCTGCCAAGGGAAGTCCAAA--TAACGGAGAAAACAG 247
Query 512 TACCCAGTTGGGAAA--AAGGCCCTGTAAATAATGAATTTGGGAAAAGTGTCAATGTGAGTTCAAACCTTGTAA 583
.|||||.|||.||.| || || |||.||||||.||||.|.|..|||
Sbjct 248 CACCCACTTGTGAGAGCAA--CC---------------------------TCAGTGTGAGCTCAAGCTTCATAA 292
Query 584 CACAA---GAACCATCTCCAGAAGAGACCTCTACTAAAAGAAGCATCAAACAGAATTCAAACCCAGTTAAAAAA 654
||||| |||..|.|||..||..||.|.||.|||||||.|||...|||.||||||||..|||||||||||||.
Sbjct 293 CACAAACGGAAGTAGCTCTCGATCAGCCTTCCACTAAAACAAGAGCCAAGCAGAATTCCCACCCAGTTAAAAAG 366
Query 655 GAGAAATCT-TGTAAGTGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTATTGTTCAGCTCTTATTCGCCATCAGAGAA 727
||| ||.|| |||||||||||.||||||||.|||||.||||.|||.|||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 367 GAG-AAGCTGTGTAAGTGCAACGAATGTGGTAAAGCTTTTACTTACTGTTCTGCTCTCATTCGCCACCAAAGAA 439
Query 728 CACATACTGGAGAAAAACCCTACAAATGTAATGAATGTGAAAAAGCCTTCAGCCGGAGTGAAAACCTTATAAAC 801
|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 440 CGCATACTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAATGAATGTAACAAAGCTTTCAGCAGAAGTGAAAACCTTATAAAC 513
Query 802 CATCAAAGAATTCATACTGGAGATAAACCATATAAATGTGATCAGTGTGGAAAAGGCTTCATTGAGGGTCCATC 875
|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 514 CATCAGAGAATCCATACGGGAGATAAACCGTACAAATGTGACCAGTGTGGAAAGGGTTTCATTGAGGGTCCATC 587
Query 876 TCTTACTCAACATCAAAGAATTCATACTGGAGAAAAACCATATAAATGTGATGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTC 949
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 588 TCTCACTCAACATCAAAGAATTCACACTGGAGAAAAGCCCTATAAATGTGATGAATGTGGGAAGGCCTTTAGTC 661
Query 950 AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCATACTGGCGAGAAGCCATACACTTGTAATGAGTGTGGAAAA 1023
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||..||||||||.|||
Sbjct 662 AGAGGACCCATCTTGTTCAGCATCAGAGAATTCACACTGGTGAGAAGCCATATACTTGTACCGAGTGTGGGAAA 735
Query 1024 GCCTTTAGCCAGAGAGGCCACTTTATGGAACATCAGAAAATTCATACGGGAGAAAAACCTTTTAAATGTGATGA 1097
.||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 736 TCCTTCAGCCAGAGAGGTCACTTTATGGAGCACCAGAAAATTCATACAGGAGAAAAACCTTTCAAGTGTGAGGA 809
Query 1098 ATGTGATAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTTACTCAACATCAAAAAATTCATACTGGAGAAAAAACCTATA 1171
.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|
Sbjct 810 GTGTGAGAAAACCTTCACCAGGAGCACACACCTCACTCAACATCAGAAAATTCACACTGGGGAGAAAACTTACA 883
Query 1172 AATGTAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAACGGGCCCTCAACTTTTATCCGTCATCATATGATTCATACTGGTGAA 1245
|.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 884 AGTGTAATGAATGTGGGAAGGCCTTCAACGGCCCATCAACGTTTATCCGTCACCATATGATTCATACTGGAGAA 957
Query 1246 AAACCGTACGAATGCAATGAATGTGGGAAAGCCTTCAGCCAGCACTCAAACCTCACTCAGCATCAAAAAACTCA 1319
||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 958 AAGCCTTATGAGTGTAATGAATGTGGCAAAGCCTTCAGCCAGCACTCCAACCTGACTCAGCATCAGAAAACACA 1031
Query 1320 TACTGGGGAGAAACCCTATGATTGTGCAGAATGTGGAAAATCTTTTAGTTACTGGTCATCCCTTGCTCAACACC 1393
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1032 CACTGGGGAGAAACCCTATGACTGTGCAGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTACTGGTCATCCCTAGCTCAGCACC 1105
Query 1394 TGAAAATTCATACTGGAGAAAAACCTTACAAATGCAATGAATGTGGAAAGGCCTTCAGTTACTGCTCATCCCTT 1467
|||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|..||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1106 TGAAAATTCATACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGTAGCGACTGCGGGAAGGCCTTCAGTTACTGCTCCTCCCTT 1179
Query 1468 ACTCAACATCGGAGAATTCACACGAGAGAAAAGCCCTTTGAATGCAGTGAATGTGGAAAGGCTTTCAGTTATCT 1541
|||||.||||||||.||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1180 ACTCAGCATCGGAGGATTCACACCCGAGAGAAGCCCTTTGAGTGCAGTGAGTGTGGAAAGGCTTTCAGCTATCT 1253
Query 1542 CTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCATACTCAAGAGAAAGCTTATGAATGTAAAGAATGTGGGAAAGCTT 1615
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1254 GTCAAACCTTAATCAGCATCAGAAAACTCACACCCAGGAGAAAGCCTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCT 1327
Query 1616 TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAACCCTATCAGTGTCATGAATGT 1689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1328 TTATTCGGAGTTCATCTCTTGCTAAGCATGAAAGAATTCATACTGGAGAGAAGCCTTATCAATGTCATGAATGT 1401
Query 1690 GGGAAAACCTTCAGTTATGGTTCATCCCTTATTCAGCATAGGAAGATCCATACTGGAGAACGACCTTACAAGTG 1763
||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 1402 GGAAAAACCTTCAGCTATGGCTCATCTCTTATTCAGCATAAGAAAATCCATACTGGTGAAAGACCTTACAAGTG 1475
Query 1764 TAATGAGTGTGGGAGAGCATTCAACCAGAACATACACCTTACACAGCATAAGAGAATTCATACAGGAGCCAAGC 1837
||||||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1476 TAATGAATGTGGGCGAGCCTTCAACCAGAAAATACACCTTACACAACACAAGAGAATTCATACAGGAGCAAAGC 1549
Query 1838 CTTATGAGTGTGCTGAGTGTGGTAAAGCCTTTCGACATTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA 1911
|.||||..||..|..||||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 CGTATGCCTGCCCCAAGTGCGGGAAGACCTTTCGACACTGTTCATCTCTTGCTCAACATCAAAAAACTCACACA 1623
Query 1912 GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAATAAATGTGAAAAGACCTTTAGCCAGAGCTCCCATCTAACTCAGCATCAACG 1985
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||||.|||.|||||||||||.||
Sbjct 1624 GAAGAAAAACCCTACCAGTGTAACAAATGTGAAAAAACCTTCAGCCAGAACTCCCGTCTGACTCAGCATCAGCG 1697
Query 1986 AATTCACACTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGCAATGAATGTGACAAAGCCTTTAGCCGGAGCACTCATCTGACTG 2059
||||||.||.||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||..|||||.|.|||||...||.|||||||
Sbjct 1698 AATTCATACGGGAGAGAAGCCTTATAAGTGCAGTGAATGTGACAAATGCTTTACCGGGAGCGTGCACCTGACTG 1771
Query 2060 AACATCAGAATACTCATACTGGAGAGAAACCTTATAACTGTAATGAATGCAGAAAGACTTTTAGCCAGAGCACA 2133
||||||.||.||||||.|||||||||||||||||.|||| .|||.|||..|.|||||||.||||||||||||
Sbjct 1772 AACATCGGAGTACTCACACTGGAGAGAAACCTTACAACT---CTGAGTGCCCACAGACTTTCAGCCAGAGCACA 1842
Query 2134 TATCTCATTCAGCACCAGAGAATTCATTCAGGAGAGAAGCCTTTTGGATGTAATGATTGTGGAAAATCCTT-CA 2206
||.||||.||||||.||||..|||||||||||||||||||.|||.||.|||.|.||.||||.||||.|||| ||
Sbjct 1843 TACCTCACTCAGCATCAGAAGATTCATTCAGGAGAGAAGCTTTTGGGGTGTGAGGACTGTGAAAAAGCCTTCCA 1916
Query 2207 GATATCGCTCTGCTCTCAACAAACATCAGAGACTGCATCC-----TGGC----ATA--------------- 2253
| |.||.|||||||||||.||||||.||||||.||||.|| |||| .||
Sbjct 1917 G-TGTCACTCTGCTCTCACCAAACACCAGAGATTGCACCCTGCTGTGGCTGCTGTAGGAACATCATTAACA 1986