Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467886
- Subject:
- NM_001330508.2
- Aligned Length:
- 1745
- Identities:
- 1402
- Gaps:
- 319
Alignment
Query 1 ATGGCGGAACCGGGCGGCGCGGCGGGCCGGTCCCATCCGGAAGATGGATCGGCTTCTGAGGGAGAGAAGGAAGG 74
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Sbjct 1 ATGGCGGAACCGGGCGGCGCGGCGGGCCGGTCCCATCCGGAAGATGGATCGGCTTCTGAGGGAGAGAAGGAAGG 74
Query 75 GAATAATGAAAGCCACATGGTGTCACCACCAGAGAAGGATGATGGCCAGAAAGGTGAAGAAGCTGTCGGTAGCA 148
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Sbjct 75 GAATAATGAAAGCCACATGGTGTCACCACCAGAGAAGGATGATGGCCAGAAAGGTGAAGAAGCTGTCGGTAGCA 148
Query 149 CAGAGCATCCTGAGGAAGTCACAACCCAAGCGGAAGCTGCAATTGAAGAGGGGGAGGTCGAGACAGAAGGGGAA 222
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Sbjct 149 CAGAGCATCCTGAGGAAGTCACAACCCAAGCGGAAGCTGCAATTGAAGAGGGGGAGGTGGAGACAGAAGGGGAA 222
Query 223 GCAGCAGTGGAAGGGGAAGAGGAGGCTGTGTCCTATGGAGATGCTGAAAGCGAAGAGGAATATTACTATACAGA 296
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Sbjct 223 GCAGCAGTGGAAGGGGAAGAGGAGGCTGTGTCCTATGGAGATGCTGAAAGCGAAGAGGAATATTACTATACAGA 296
Query 297 AACTTCATCCCCGGAAGGGCAAATCAGTGCTGCAGATACGACTTACCCGTATTTCAGTCCTCCTCAGGAACTGC 370
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Sbjct 297 AACTTCATCCCCGGAAGGGCAAATCAGTGCTGCAGATACGACTTACCCGTATTTCAGTCCTCCTCAGGAACTGC 370
Query 371 CTGGAGAGGAGGCATACGATAGTGTTAGCGGGGAGGCTGGTCTCCAAGGCTTCCAGCAAGAGGCCACCGGTCCA 444
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Sbjct 371 CTGGAGAGGAGGCATACGATAGTGTTAGCGGGGAGGCTGGTCTCCAAGGCTTCCAGCAAGAGGCCACCGGTCCA 444
Query 445 CCAGAATCCAGAGAAAGGAGGGTCACCTCCCCAGAGCCATCCCACGGAGTCTTAGGCCCGTCGGAGCAAATGGG 518
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Sbjct 445 CCAGAATCCAGAGAAAGGAGGGTCACCTCCCCAGAGCCATCCCACGGAGTCTTAGGCCCGTCGGAGCAAATGGG 518
Query 519 CCAGGTCACCTCTGGGCCAGCAGTGGGCAGATTGACAGGATCCACAGAGGAGCCCCAGGGGCAGGTGCTCCCAA 592
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Sbjct 519 CCAGGTCACCTCTGGGCCAGCAGTGGGCAGATTGACAGGATCCACAGAGGAGCCCCAGGGGCAGGTGCTCCCAA 592
Query 593 TGGGCGTCCAGCACCGCTTCCGGCTGAGCCACGGGAGCGACATCGAGTCCTCAGACCTGGAGGAGTTCGTCTCG 666
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Sbjct 593 TGGGCGTCCAGCACCGCTTCCGGCTGAGCCACGGGAGCGACATCGAGTCCTCAGACCTGGAGGAGTTCGTCTCG 666
Query 667 CAGGAGCCAGTGATCCCCCCAGGGGTGCCCGATGCCCACCCCAGGGAAGGAGACCTGCCAGTGTTCCAGGACCA 740
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Sbjct 667 CAGGAGCCAGTGATCCCCCCAGGGGTGCCCGATGCCCACCCCAGGGAAGGAGACCTGCCAGTGTTCCAGGACCA 740
Query 741 GATCCAGCAGCCCAGCACCGAGGAGGGGGCCATGGCAGAGAGAGTGGAGTCCGAGGGGAGTGACGAGGAAGCAG 814
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Sbjct 741 GATCCAGCAGCCCAGCACCGAGGAGGGGGCCATGGCAGAGAGAGTGGAGTCCGAGGGGAGTGACGAGGAAGCAG 814
Query 815 AAGACGAAGGGTCCCAGCTGGTGGTTTTGGACCCAGACCACCCCCTGATGGTAAGATTTCAGGCTGCCCTGAAG 888
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Sbjct 815 AAGACGAAGGGTCCCAGCTGGTGGTTTTGGACCCAGACCACCCCCTGATGGTAAGATTCCAGGCTGCCCTGAAG 888
Query 889 AACTACCTGAACCGACAGATCGAAAAGTTGAAGCTGGACCTCCAAGAGCTGGTTGTGGCTACCAAGCAGAGCCG 962
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Sbjct 889 AACTACCTGAACCGACAGATCGAAAAGTTGAAGCTGGACCTCCAAGAGCTGGTTGTGGCTACCAAGCAGAGCCG 962
Query 963 AGCCCAGCGGCAGGAGCTGGGGGTGAATCTCTATGAGGTGCAGCAGCACCTGGTACACCTGCAGAAGCTGCTGG 1036
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Sbjct 963 AGCCCAGCGGCAGGAGCTGGGGGTGAATCTCTATGAGGTGCAGCAGCACCTGGTACACCTGCAGAAGCTGCTGG 1036
Query 1037 AGAAGAGTCACGACCGCCACGCAATGGCCTCGAGCGAGCGCAGGCAGAAGGAGGAGGAGCTGCAGGCCGCCCGC 1110
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Sbjct 1037 AGAAGAGTCACGACCGCCACGCAATGGCCTCGAGCGAGCGCAGGCAGAAGGAGGAGGAGCTGCAGGCCGCCCGC 1110
Query 1111 GCTCTCTACACCAAGACCTGCGCAGCCGCCAACGAGGAGCGCAAAAAGTTGGCGGCTCTGCAGACTGAGATGGA 1184
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Sbjct 1111 GCTCTCTACACCAAGACCTGCGCAGCCGCCAACGAGGAGCGCAAAAAGTTGGCGGCTCTGCAGACTGAGATGGA 1184
Query 1185 GAACTTGGCCCTGCATCTCTTCTACATGCAGAACATCGACCAGGACATGCGTGACGACATCCGCGTGATGACAC 1258
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Sbjct 1185 GAACTTGGCCCTGCATCTCTTCTACATGCAGAACATCGACCAGGACATGCGTGACGACATCCGCGTGATGACAC 1258
Query 1259 AAGTGGTAAAGAAGGCCGAGACGGAGAGGATCCGGGCAGAAATCGAGAAGAAAAAGCAGGGCGT-----TGGA- 1326
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Sbjct 1259 AAGTGGTAAAGAAGGCCGAGACGGAGAGGATCCGGGCAGAAATCGAGAAGAAAAAGCAGGACCTGTATGTGGAC 1332
Query 1327 -------------GA-CACAGGTGCTG--------------CCT---------TCATTCCT-----AAAAC--- 1355
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Sbjct 1333 CAGCTCACCACTCGAGCCCAGCAACTGGAAGAAGACATTGCCCTGTTTGAGGCTCAGTACTTGGCCCAAGCTGA 1406
Query 1356 ---CACCC--------AGG------GTGA-------------CCAGGTCTCGGGACGC---------GGA-AAG 1389
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Sbjct 1407 GGACACCCGGATTTTAAGGAAAGCAGTGAGTGAGGCCTGCACCGAGATC----GACGCCATCAGCGTGGAGAAG 1476
Query 1390 AAAAAGCCG--------GGCACTG-----------TGGTGG--------------CACGTGTCTCAC------- 1423
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Sbjct 1477 ----AGGCGCATCATGCAGCAATGGGCCAGCAGCCTGGTGGGCATGAAGCACCGCGACGAGGCGCACAGGGCGG 1546
Query 1424 --------CCGCTGAGCTT------------------------------------------------------- 1434
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Sbjct 1547 TGCTGGAGGCGCTCAGCGTGTCCCTAGAGCGCTTCCCAAGTCAAAATATAAACACCGCTCGTTCCCGCCTTTCT 1620
Query 1435 -------------------------------------------------------------------------- 1434
Sbjct 1621 ACCACATGGCATTCCGCTGGGATACTTCTACGGGGAAGCTTCCTGCCCGGGGCATCGAGGGCGTTCGCGTCCGT 1694
Query 1435 ------------------------------------------- 1434
Sbjct 1695 CTGTTATGGCGGTGCTGCTGTAGATAACCGGATCCGCGAATGC 1737
