Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467940
• Subject: XM_011528246.3
• Aligned Length: 3561
• Identities: 3263
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGCCTCTGCGCCACTGGGGGATGGCCAGGGGCAGTAAGCCCGTTGGGGATGGAGCCCAGCCCATGGCTGCCAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGGAGGCCTGAAGGTGCTTCTGCACTGGGCTGGTCCAGGCGGCGGGGAGCCCTGGGTCACTTTCAGTGAGTCAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGCTGACAGCTGAGGAAGTCTGCATCCACATTGCACATAAAGTTGGTATCACTCCTCCTTGCTTCAATCTCTTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCCTCTTCGATGCTCAGGCCCAAGTCTGGTTGCCCCCAAACCACATCCTAGAGATCCCCAGAGATGCAAGCCT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGGCTGTGTACC  370
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -ATGCTATATTTCCGCATAAGGTTTTATTTCCGGAACTGGCATGGCATGAATCCTCGGGAACCGGCTGTGTACC  73

Query  371  GTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGACCCAGCCTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  GTTGTGGGCCCCCAGGAACCGAGGCATCCTCAGATCAGACAGCACAGGGGATGCAACTCCTGGACCCAGCCTCA  147

Query  445  TTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCTGTCGACCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  TTTGAGTACCTCTTTGAGCAGGGCAAGCATGAGTTTGTGAATGACGTGGCATCACTGTGGGAGCTGTCGACCGA  221

Query  519  GGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCGCTCTCCGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  GGAGGAGATCCACCACTTTAAGAATGAGAGCCTGGGCATGGCCTTTCTGCACCTCTGTCACCTCGCTCTCCGCC  295

Query  593  ATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTCCGCCGGCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  ATGGCATCCCCCTGGAGGAGGTGGCCAAGAAGACCAGCTTCAAGGACTGCATCCCGCGCTCCTTCCGCCGGCAT  369

Query  667  ATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGACTTCCAGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATCCGGCAGCACAGCGCCCTGACCCGGCTGCGCCTTCGGAACGTCTTCCGCAGGTTCCTGCGGGACTTCCAGCC  443

Query  741  GGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCCGCTTCGGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GGGCCGACTCTCCCAGCAGATGGTCATGGTCAAATACCTAGCCACACTCGAGCGGCTGGCACCCCGCTTCGGCA  517

Query  815  CAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATCCGGGACAGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  CAGAGCGTGTGCCCGTGTGCCACCTGAGGCTGCTGGCCCAGGCCGAGGGGGAGCCCTGCTACATCCGGGACAGT  591

Query  889  GGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGTGACAGGCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GGGGTGGCCCCTACAGACCCTGGCCCTGAGTCTGCTGCTGGGCCCCCAACCCACGAGGTGCTGGTGACAGGCAC  665

Query  963  TGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCAGTGGCAGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  TGGTGGCATCCAGTGGTGGCCAGTAGAGGAGGAGGTGAACAAGGAGGAGGGTTCTAGTGGCAGCAGTGGCAGGA  739

Query 1037  ACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGACAGGCCGCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  ACCCCCAAGCCAGCCTGTTTGGGAAGAAGGCCAAGGCTCACAAGGCAGTCGGCCAGCCGGCAGACAGGCCGCGG  813

Query 1111  GAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTGTGTCAGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GAGCCACTGTGGGCCTACTTCTGTGACTTCCGGGACATCACCCACGTGGTGCTGAAAGAGCACTGTGTCAGCAT  887

Query 1185  CCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCGTGTCGCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CCACCGGCAGGACAACAAGTGCCTGGAGCTGAGCTTGCCTTCCCGGGCTGCGGCGCTGTCCTTCGTGTCGCTGG  961

Query 1259  TGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCACGGCTGGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TGGACGGCTATTTCCGCCTGACGGCCGACTCCAGCCACTACCTGTGCCACGAGGTGGCTCCCCCACGGCTGGTG  1035

Query 1333  ATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCCCGAGGACGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  ATGAGCATCCGGGATGGGATCCACGGACCCCTGCTGGAGCCATTTGTGCAGGCCAAGCTGCGGCCCGAGGACGG  1109

Query 1407  CCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTAGCCAGGCAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CCTGTACCTCATTCACTGGAGCACCAGCCACCCCTACCGCCTGATCCTCACAGTGGCCCAGCGTAGCCAGGCAC  1183

Query 1481  CAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTGCTGGAGGGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  CAGACGGCATGCAGAGCTTGCGGCTCCGAAAGTTCCCCATTGAGCAGCAGGACGGGGCCTTCGTGCTGGAGGGC  1257

Query 1555  TGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGCCGGGGATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  TGGGGCCGGTCCTTCCCCAGCGTTCGGGAACTTGGGGCTGCCTTGCAGGGCTGCTTGCTGAGGGCCGGGGATGA  1331

Query 1629  CTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGCGGGGGGCTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CTGCTTCTCTCTGCGTCGCTGTTGCCTGCCCCAACCAGGAGAAACCTCCAATCTCATCATCATGCGGGGGGCTC  1405

Query 1703  GGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATCACCCAGCTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  GGGCCAGCCCCAGGACACTCAACCTCAGCCAGCTCAGCTTCCACCGGGTTGACCAGAAGGAGATCACCCAGCTG  1479

Query 1777  TCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGGGGACCCTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  TCCCACTTGGGCCAGGGCACAAGGACCAACGTGTATGAGGGCCGCCTGCGAGTGGAGGGCAGCGGGGACCCTGA  1553

Query 1851  GGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAGTGGTGCTCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  GGAGGGCAAGATGGATGACGAGGACCCCCTCGTGCCTGGCAGGGACCGTGGGCAGGAGCTACGAGTGGTGCTCA  1627

Query 1925  AAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGCCAGGTCTCC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  AAGTGCTGGACCCTAGTCACCATGACATCGCCCTGGCCTTCTACGAGACAGCCAGCCTCATGAGCCAGGTCTCC  1701

Query 1999  CACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGAGTACGTGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  CACACGCACCTGGCCTTCGTGCATGGCGTCTGTGTGCGCGGCCCTGAAAATATCATGGTGACAGAGTACGTGGA  1775

Query 2073  GCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGGTGGTGGCCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  GCACGGACCCCTGGATGTGTGGCTGCGGAGGGAGCGGGGCCATGTGCCCATGGCTTGGAAGATGGTGGTGGCCC  1849

Query 2147  AGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGCCGGAACATC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  AGCAGCTGGCCAGCGCCCTCAGCTACCTGGAGAACAAGAACCTGGTTCATGGTAATGTGTGTGGCCGGAACATC  1923

Query 2221  CTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGTGGGCCTGGG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  CTGCTGGCCCGGCTGGGGTTGGCAGAGGGCACCAGCCCCTTCATCAAGCTGAGTGATCCTGGCGTGGGCCTGGG  1997

Query 2295  CGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTGGGGCCAACA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  CGCCCTCTCCAGGGAGGAGCGGGTGGAGAGGATCCCCTGGCTGGCCCCCGAATGCCTACCAGGTGGGGCCAACA  2071

Query 2369  GCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGAGAGGCCCCT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  GCCTAAGCACCGCCATGGACAAGTGGGGGTTTGGCGCCACCCTCCTGGAGATCTGCTTTGACGGAGAGGCCCCT  2145

Query 2443  CTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCCCTCCTGCCC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  CTGCAGAGCCGCAGTCCCTCCGAGAAGGAGCATTTCTACCAGAGGCAGCACCGGCTGCCCGAGCCCTCCTGCCC  2219

Query 2517  ACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCACCATCCTGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  ACAGCTGGCCACACTCACCAGCCAGTGTCTGACCTATGAGCCAACCCAGAGGCCATCATTCCGCACCATCCTGC  2293

Query 2591  GTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCGGCGTCGGAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294  GTGACCTCACCCGGCTGCAGCCCCACAATCTTGCTGACGTCTTGACTGTGAACCCGGACTCACCGGCGTCGGAC  2367

Query 2665  CCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAAGGTCAGCTT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368  CCTACGGTTTTCCACAAGCGCTATTTGAAAAAGATCCGAGATCTGGGCGAGGGTCACTTCGGCAAGGTCAGCTT  2441

Query 2739  GTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAGACTGCGGCC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2442  GTACTGCTACGATCCGACCAACGACGGCACTGGCGAGATGGTGGCGGTGAAAGCCCTCAAGGCAGACTGCGGCC  2515

Query 2813  CCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATCATCAAGTAC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516  CCCAGCACCGCTCGGGCTGGAAGCAGGAGATTGACATTCTGCGCACGCTCTACCACGAGCACATCATCAAGTAC  2589

Query 2887  AAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGGCAGCCTCCG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590  AAGGGCTGCTGCGAGGACCAAGGCGAGAAGTCGCTGCAGCTGGTCATGGAGTACGTGCCCCTGGGCAGCCTCCG  2663

Query 2961  AGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCGAGGGCATGG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664  AGACTACCTGCCCCGGCACAGCATCGGGCTGGCCCAGCTGCTGCTCTTCGCCCAGCAGATCTGCGAGGGCATGG  2737

Query 3035  CCTATCTGCACTCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAACGACAGGCTG  3108
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738  CCTATCTGCACGCGCAGCACTACATCCACCGAGACCTAGCCGCGCGCAACGTGCTGCTGGACAACGACAGGCTG  2811

Query 3109  GTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCGCGAGGATGG  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812  GTCAAGATCGGGGACTTTGGCCTAGCCAAGGCCGTGCCCGAAGGCCACGAGTACTACCGCGTGCGCGAGGATGG  2885

Query 3183  GGACAGCCCCGTGTTCTGGTATGCCCCAGAGTGCCTGAAGGAGTATAAGTTCTACTATGCGTCAGATGTCTGGT  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886  GGACAGCCCCGTGTTCTGGTATGCCCCAGAGTGCCTGAAGGAGTATAAGTTCTACTATGCGTCAGATGTCTGGT  2959

Query 3257  CCTTCGGGGTGACCCTGTATGAGCTGCTGACGCACTGTGACTCCAGCCAGAGCCCCCCCACGAAATTCCTTGAG  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960  CCTTCGGGGTGACCCTGTATGAGCTGCTGACGCACTGTGACTCCAGCCAGAGCCCCCCCACGAAATTCCTTGAG  3033

Query 3331  CTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGAGAGGCTGCC  3404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034  CTCATAGGCATTGCTCAGGGTCAGATGACAGTTCTGAGACTCACTGAGTTGCTGGAACGAGGGGAGAGGCTGCC  3107

Query 3405  ACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGTCCTTTCGCC  3478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108  ACGGCCCGACAAATGTCCCTGTGAGGTCTATCATCTCATGAAGAACTGCTGGGAGACAGAGGCGTCCTTTCGCC  3181

Query 3479  CAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCTTCAGTGTTC  3552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182  CAACCTTCGAGAACCTCATACCCATTCTGAAGACAGTCCATGAGAAGTACCAAGGCCAGGCCCCTTCAGTGTTC  3255

Query 3553  AGCGTGTGC  3561
            |||||||||
Sbjct 3256  AGCGTGTGC  3264