Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468084
- Subject:
- XM_006515596.3
- Aligned Length:
- 2269
- Identities:
- 1636
- Gaps:
- 368
Alignment
Query 1 ATGATGCCGT--------------------TTCCG-------------------GTGACAACCCAGGGACCACC 35
|||..||||| ||||| ||.|||||.||||||.|||.
Sbjct 1 ATGGCGCCGTCCAGCCCCCTAGTTCCCCACTTCCGCTTCCCTCGGAGCGGTCCAGTTACAACGCAGGGATCACA 74
Query 36 GCAGCCGGCGCCGCCGCCGAATCGCTACGGCGTCTCCTCGCCTATCAGTCTAGCGGTCCCCAAGGAGACGGACT 109
.||..||..|||.||.|.||..|.|||.|||.|..||||.||||||||..||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 75 ACAAACGCAGCCACCACAGAGGCACTATGGCATTACCTCTCCTATCAGCTTAGCGGCCCCCAAGGAGACTGACT 148
Query 110 GCCTCCTCACCCAGAGGCTAATAGAAACCCTCAGGCCCTTCGGGGTCTTCGAAGAGGAAGAGGAACTGCAGCGC 183
||||.|||||.||||.|||.||.||.||.||.|.||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCCTACTCACACAGAAGCTCATCGAGACGCTGAAGCCCTTTGGGGTTTTTGAAGAAGAAGAGGAACTGCAGCGC 222
Query 184 AGGATTTTAGTTTTGGACAAATTAAATAATCTGGTAAAGGAATGGATACGCGAAATCAGTGAAAGCAAGAGTCT 257
|||||||||.||||||..|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 223 AGGATTTTAATTTTGGGAAAATTAAATAACCTGGTGAAAGAATGGATTCGAGAAATCAGTGAAAGCAAGAATCT 296
Query 258 TCCCCAGTCTGTAATTGAAAACGTTGGAGGAAAGATTTTTACGTTTGGCTCTTACAGATTAGGAGTACATACGA 331
.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||||
Sbjct 297 CCCACAATCTGTAATTGAAAATGTTGGAGGGAAGATTTTTACATTTGGATCTTACAGACTAGGAGTCCACACGA 370
Query 332 AAGGCGCAGATATTGACGCCTTGTGCGTTGCACCAAGTCATGTGGATCGAAGCGACTTTTTCACCTCATTCTAT 405
||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGGTGCTGATATTGATGCGTTGTGTGTTGCACCAAGACATGTTGATCGAAGTGACTTTTTCACCTCATTCTAT 444
Query 406 GCTAAACTGAAACTACAGGAGGAAGTGAAAGATTTAAGGGCTGTCCAGGAGGCATTTGTGCCAGTTATCAAACT 479
|.||||.|||||.||||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 GATAAATTGAAATTACAAGAAGAAGTGAAAGATTTAAGAGCTGTTGAAGAGGCATTTGTACCAGTTATCAAACT 518
Query 480 GTGTTTTGATGGGATAGAGATTGATATTTTATTTGCAAGATTAGCACTACAGACTATTCCAGAAGATTTGGACT 553
.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 519 CTGTTTTGATGGAATAGAGATTGATATTTTGTTTGCAAGATTAGCACTGCAGACTATTCCAGAAGATTTGGACC 592
Query 554 TAAGAGATGACAGTCTACTTAAAAATTTAGACATTAGATGCATAAGAATCCTTAATGGTTGCCGGGTAACCGAT 627
||.|||||||||||||.||||||||..||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 593 TACGAGATGACAGTCTGCTTAAAAACCTAGATATAAGATGCATAAGAAGCCTTAATGGTTGCAGGGTAACCGAT 666
Query 628 GAAATTTTACATCTAGTGCCAAACATTGACAACTTCAGGCTGACTCTGAGAGCCATCAAACTGTGGGCCAAGTG 701
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 667 GAAATTTTACATCTAGTACCAAACATTGACAACTTCAGGTTAACTCTGAGAGCCATCAAACTGTGGGCCAAACG 740
Query 702 CCACAATATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGAGGTGTTTCCTGGGCCATGCTAGTAGCAAGAACTTGTC 775
.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 741 GCACAACATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGTGGTGTTTCCTGGGCTATGCTAGTAGCAAGAACTTGCC 814
Query 776 AGCTTTATCCAAATGCAGTAGCGTCAACTCTTGTACGGAAATTCTTCTTGGTATTTTCAGAATGGGAATGGCCA 849
|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||..|||||.||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 815 AGCTTTATCCAAATGCAATAGCATCAACTCTTGTACATAAATTTTTCTTGGTATTTTCTAAATGGGAATGGCCA 888
Query 850 AACCCAGTGTTACTGAAGGAGCCTGAAGAACGGAATCTTAATTTGCCTGTATGGGACCCAAGAGTAAATCCCAG 923
||.||||||.||.||||..|||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 889 AATCCAGTGCTATTGAAACAGCCTGAAGAATGCAATCTTAATTTGCCTGTGTGGGACCCAAGGGTAAACCCCAG 962
Query 924 TGATAGGTACCATCTTATGCCTATCATCACACCAGCATACCCACAGCAGAACTCCACATACAACGTGTCTATTT 997
||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..|||
Sbjct 963 TGATAGGTACCATCTTATGCCTATAATTACACCAGCATACCCACAGCAGAACTCCACGTACAATGTGTCCGTTT 1036
Query 998 CAACCAGGATGGTCATGATTGAGGAGTTTAAACAGGGGCTTGCTATCACACACGAGATTTTGCTAAGTAAGGCA 1071
||||..|||||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CAACACGGATGGTCATGGTTGAGGAGTTTAAACAAGGTCTTGCTATCACAGATGAAATTTTGCTGAGTAAGGCA 1110
Query 1072 GAGTGGTCCAAACTCTTTGAAGCTCCAAGCTTCTTTCAAAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTGGCAAGTGC 1145
||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 GAGTGGTCCAAACTTTTTGAAGCTCCAAACTTCTTTCAGAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTAGCAAGTGC 1184
Query 1146 ATCAACAGAAAAACAACATTTAGAATGGGTGGGCTTGGTGGAATCAAAGATCCGAATCCTGGTTGGGAGCTTGG 1219
..|.||.|||||.||.|.|.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1185 GCCCACGGAAAAGCAGCGTCTGGAATGGGTGGGCTTGGTGGAATCAAAAATCCGCATCCTGGTTGGAAGCTTGG 1258
Query 1220 AGAAGAATGAATTTATTACACTGGCACATGTGAATCCACAGTCATTTCCAGCACCCAAAGAAAATCCTGATATG 1293
||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||||||.|.|
Sbjct 1259 AGAAGAATGAGTTTATTACACTGGCTCATGTGAATCCCCAGTCATTTCCAGCCCCCAAAGAAAGTCCTGACAGG 1332
Query 1294 GAAGAATTTCGTACAATGTGGGTGATTGGGTTAGGGCTAAAAAAGCCAGATAATTCTGAAATTCTCAGCATTGA 1367
|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|.|||||..|.||.||.|||||||.||||||..|.||
Sbjct 1333 GAAGAATTTCGCACAATGTGGGTGATTGGGTTAGTGTTTAAAAAAACTGAAAACTCTGAAAATCTCAGTGTCGA 1406
Query 1368 TCTCACCTATGATATCCAGTCTTTCACAGATACTGTTTATAGGCAAGCAGTGAATAGTAAGATGTTTGAGATGG 1441
.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||.||.|||||||||.|||
Sbjct 1407 CCTCACCTATGATATCCAGTCTTTCACAGACACAGTTTATAGGCAAGCAATAAACAGCAAAATGTTTGAGTTGG 1480
Query 1442 GTATGAAAATTACTGCAGTGCAT-TTAAGAAGAAAGGAACTTCACCAGCTGCTGCCTCATCATGTGCTTCAGGA 1514
.||||||.|||.|.|||.||||| |.||| ||||||.||||.||.||||||||||||..|||.|||||||||
Sbjct 1481 ATATGAAGATTGCAGCAATGCATGTGAAG-AGAAAGCAACTCCATCAGCTGCTGCCTAGTCACGTGCTTCAG-- 1551
Query 1515 CAAGA--AAGCA-CACTCAACAGAAGGTAG--AAGATTGACAGATTTGAACGACAGCAGCTTTGACTTGTCTGC 1583
|||| |||.| ||.||||||||||| || ||| ||.||||.|.||||.|||||||||.|||||||||||..
Sbjct 1552 -AAGAGGAAGAAGCATTCAACAGAAGG-AGTCAAG-TTAACAGCTCTGAATGACAGCAGCCTTGACTTGTCTAT 1622
Query 1584 AGGCTGTGAAAACAGCATGTCTGTGCCTTCATCTACTAGCACTATGAAGACAGGCCCATTGATTA------GCA 1651
.|.|.||||.|||||||||||||||||||||.|.||.||..||||||||||..|.|||||||.|| |||
Sbjct 1623 GGACAGTGATAACAGCATGTCTGTGCCTTCACCCACCAGTGCTATGAAGACCAGTCCATTGAATAGTTCTGGCA 1696
Query 1652 GTTCTCAGGGTAGAAACAGTCCTGCCTTGGCTGTAATGACAGCATCTGTGGCTAACATACAGGCTACTGAATTT 1725
|.||.|||||.||||||||||||||....|||||.|...|||||||||||.|.|.|||.||||||.||||..||
Sbjct 1697 GCTCCCAGGGCAGAAACAGTCCTGCTCCAGCTGTGACCGCAGCATCTGTGACCAGCATCCAGGCTTCTGAGGTT 1770
Query 1726 TCCTT---GCAA-CAGGTGAATACCAATGAAAGTTCAGGGGTTGCATTAAACGAAAGTATTCCTCACGCTGTCT 1795
||..| |||| || |||.|||.||||||..||||||.|.|||..|.||||||.||||||||..|||.|.
Sbjct 1771 TCTGTACCGCAAGCA----AATTCCAGTGAAAGCCCAGGGGGTCCATCGAGCGAAAGCATTCCTCAAACTGCCA 1840
Query 1796 CTCAGCCTGCCATTTCTCCATCACCAAAGGCCATGGTCGCCAGAGTTGTTTCTTCAACATGTCTCAT-AAGCCA 1868
|.|||||.||||||||||||.||||||||.|.|..|||.||||||||||.||.||||||.|.||..| ||.|||
Sbjct 1841 CACAGCCAGCCATTTCTCCACCACCAAAGCCTACAGTCTCCAGAGTTGTCTCCTCAACACGACTGGTAAACCCA 1914
Query 1869 T---CCAGACCTTCAGGAAACTCAGCAACAAACATATCTAATCCTA---------------------------- 1911
| |.|||||||||||||||.||||||||||..|..|||||||||
Sbjct 1915 TCGCCTAGACCTTCAGGAAACACAGCAACAAAAGTCCCTAATCCTATAGTAGGAGTCAAGAGAACGTCCTCACC 1988
Query 1912 -------------------------------------------------------------------------- 1911
Sbjct 1989 CAATAAAGAAGAAAGTCCTAAGAAAACCAAAACAGAAGAGGATGAAACAAGTGAAGATGCTAACTGTCTTGCTT 2062
Query 1912 -------------------------------------------------------------------------- 1911
Sbjct 2063 TGAGTGGACATGATAAAACAGAGACAAAGGAACAAGTTGATCTGGAGACAAGTGCGGTTCAATCAGAAACTGTT 2136
Query 1912 -------------------------------------------------------------------------- 1911
Sbjct 2137 CCGGCATCGGCTTCTCTGTTGGCCTCTCAGAAAACATCCAGTACAGACCTTTCTGATATCCCTGCTCTCCCTGC 2210
Query 1912 ------------------------------------------------- 1911
Sbjct 2211 AAATCCTATTCCTGTTATCAAGAATTCAATAAAACTGAGACTGAATCGG 2259