Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468162
- Subject:
- NM_001278690.1
- Aligned Length:
- 1153
- Identities:
- 1021
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
Query 75 GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA 148
Query 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAAAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG 222
Query 223 GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG 296
Query 297 CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
Query 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAA------ 438
Query 445 CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA 518
Sbjct 439 -------------------------------------------------------------------------- 438
Query 519 GAAGGCCAATGATGAGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTC 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 -AAGGCCAATGATGAGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTC 511
Query 593 ACTTACTGTCCCATGAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGCTGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 ACTTACTGTCCCATGAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGCTGGC 585
Query 667 CTTTGTCCAGATGAAGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 CTTTGTCCAGATGAAGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTA 659
Query 741 CGGTTTGAGGAATGAACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCACCCCCCTTAAAAAGTG 814
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 CGGTTTGAGGAAGGAACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCACCCCCCTTAAAAAGTG 733
Query 815 GACTCAGCTCCCTGGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 GACTCAGCTCCCTGGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGAT 807
Query 889 CTGAAATTGATCAGTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CTGAAATTGATCAGTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTT 881
Query 963 TAATAGTACCAGCCATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 TAATAGTACCAGCCATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGG 955
Query 1037 AAATAGATGACATCAATACCAGTGATAAGCTTGATGAC-CTCACACAAGATCT-GACTGTATCCCAGCTC---A 1105
|||||||||||||||||||||||||||| ||| .||||.| |.|| ||.||| |.|||| |
Sbjct 956 AAATAGATGACATCAATACCAGTGATAA-------GACAATCACTC---AGCTGGAATGT----CTGCTCTCTA 1015
Query 1106 GTGATG--TTGCGGATTATCTGGAAGATGTTGCA--------- 1137
.||.|| |||| ||.|..||.|...||||
Sbjct 1016 TTGGTGCCTTGC-----ATTTCAAAAACACTGCAGATATTTTT 1053