Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468162
- Subject:
- XM_006523355.2
- Aligned Length:
- 1198
- Identities:
- 986
- Gaps:
- 65
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
|||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGACTACCGCCGCGGTGGTGGCCGAGGAAGACACGGAGCTGCGCGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
Query 75 GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA 148
|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 GAACAGCGGCGTGCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCAGAGCGGCTGTGTTTTTAGCACTAGAAGAACAAGAAA 148
Query 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG 222
|||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCATTGGTCAATGAGAACTTGAAAAAGTTTTTAAACACAAAAGATGGTCGTTTAGTG 222
Query 223 GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG 296
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GCTAGTCTCGTCGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAATCTTGACTTCACCTTGGCTGTTTTCCATCCTGAAACTAG 296
Query 297 CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACAATTCAAGGTCTTGAAGGTCGAGAGAACTTGGCCCAGGATTTAGGCATCATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
Query 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA 444
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||.||.||||||||||
Sbjct 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATTAGACGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGACCGGCCAGTGTGGAAGGTGCA 444
Query 445 CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA 518
||.||||||||.||||.||||.|||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.|..|.||.||||||||
Sbjct 445 CTGGATCTATCCGATGGACATCCTCCATCAAAGTCACCTGAAGGAAAATCAAGTGCAAACTCCACCCCAAGTAA 518
Query 519 G-------------AAGGCCAA--------------------------------TGA------------TGAGG 535
| ||||.||| ||| ||||.
Sbjct 519 GATACCAAGGTATAAAGGACAAGGTAAGAAGAAGACAATCGGTCAGAAGCCTGGTGACAAGACTAGCAGTGAGA 592
Query 536 CCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTCACTTACTGTCCCATGAA 609
|||.|||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||||.||||.|||||||.
Sbjct 593 CCAGTCAGAGTGAGCCAAGTGTCTCCTTGTCAGAGTCCAAGAGTAAAAGCAGCCTGCACTCACTGGCCCATGAG 666
Query 610 ACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGC--TGGCCTTTGTCCAGATGAA 681
||||.|||||.||||||..||||||.|||..||.||||||.||.|||| ||| ||.||||||||||||||..
Sbjct 667 ACAAGAATTGCATCTTTCTTAAGCAGCAGCGCTGTAGATGCCAGAGAC--AGCAGTGCCCTTTGTCCAGATGGG 738
Query 682 GATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTACGGTTTGAGGAATGA 755
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.|||...|||
Sbjct 739 GATGATGTGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAACCAGAAAAAACCTATGGTTGGAGAGCTGA 812
Query 756 ACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCA--CCCCCCTTAAAAAGTGGACTCAGCTCCCT 827
||||.|||||||||..|||.||||||||||.||.||.|| || ||||.|||||..||.||.|||||||||||
Sbjct 813 ACCTCGGAAGCAAGTGGGAGGTCTGGCCTCACTGTCTGA--CAAGCCCCACTTAAGGAGCGGTCTCAGCTCCCT 884
Query 828 GGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGATCTGAAATTGATCA 901
|||.||||||||.||..|||.|||..|.||||||||||||||||..||.||..||||.||||||||||||.|..
Sbjct 885 GGCCGGAGCCCCATCGCTAACAGATCCAGAGAGTAAAAGGGGAAGCACCGTCCTGAAGGATCTGAAATTGGTTG 958
Query 902 GTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTTTAATAGTACCAGC 975
||||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 959 GTGAGAAGATTGGATCACTTGGGCTAGGCACTGGAGAAGATGAGGACTATGCTGATGATTTTAATAGTGCTAGC 1032
Query 976 CATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGGAAATAGATGACAT 1049
|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||.|.||||.|||..
Sbjct 1033 CATCGCTCAGAAAAAAGTGAGCTAAGTATTGGTGAAGAGATTGAAGAAGACCTTTCCATGGGAGTAGAGGACGG 1106
Query 1050 CAATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAGCTCAGTGATGTTGCGGATTATC 1123
.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1107 GAACACCAGTGATAAACTCGATGACCTCACACAAGACCTGACTGTTTCCCAGCTCAGTGATGTTGCTGACTATC 1180
Query 1124 TGGAAGATGTTGCA 1137
||||||||||||||
Sbjct 1181 TGGAAGATGTTGCA 1194