Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468162
• Subject: XM_006523356.2
• Aligned Length: 1146
• Identities: 979
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74
            |||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGACTACCGCCGCGGTGGTGGCCGAGGAAGACACGGAGCTGCGCGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74

Query   75  GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA  148
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  GAACAGCGGCGTGCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCAGAGCGGCTGTGTTTTTAGCACTAGAAGAACAAGAAA  148

Query  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG  222
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCATTGGTCAATGAGAACTTGAAAAAGTTTTTAAACACAAAAGATGGTCGTTTAGTG  222

Query  223  GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG  296
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GCTAGTCTCGTCGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAATCTTGACTTCACCTTGGCTGTTTTCCATCCTGAAACTAG  296

Query  297  CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370
            ||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAATTCAAGGTCTTGAAGGTCGAGAGAACTTGGCCCAGGATTTAGGCATCATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370

Query  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA  444
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||.||.||||||||||
Sbjct  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATTAGACGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGACCGGCCAGTGTGGAAGGTGCA  444

Query  445  CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA  518
            ||.||||||||.||||.||||.|||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.|..|.||.||||||||
Sbjct  445  CTGGATCTATCCGATGGACATCCTCCATCAAAGTCACCTGAAGGAAAATCAAGTGCAAACTCCACCCCAAGTAA  518

Query  519  GA-----AGGCCAATGATGAGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAG  587
            ||     ||        ||||.|||.|||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||.||||||||
Sbjct  519  GACTAGCAG--------TGAGACCAGTCAGAGTGAGCCAAGTGTCTCCTTGTCAGAGTCCAAGAGTAAAAGCAG  584

Query  588  CCTTCACTTACTGTCCCATGAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAG  661
            |||.||||.||||.|||||||.||||.|||||.||||||..||||||.|||..||.||||||.||.||||  ||
Sbjct  585  CCTGCACTCACTGGCCCATGAGACAAGAATTGCATCTTTCTTAAGCAGCAGCGCTGTAGATGCCAGAGAC--AG  656

Query  662  C--TGGCCTTTGTCCAGATGAAGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGA  733
            |  ||.||||||||||||||..||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  657  CAGTGCCCTTTGTCCAGATGGGGATGATGTGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAACCAGAAA  730

Query  734  AAACTTACGGTTTGAGGAATGAACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCA--CCCCCCT  805
            ||||.||.||||.|||...|||||||.|||||||||..|||.||||||||||.||.||.||  ||  ||||.||
Sbjct  731  AAACCTATGGTTGGAGAGCTGAACCTCGGAAGCAAGTGGGAGGTCTGGCCTCACTGTCTGA--CAAGCCCCACT  802

Query  806  TAAAAAGTGGACTCAGCTCCCTGGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTT  879
            |||..||.||.||||||||||||||.||||||||.||..|||.|||..|.||||||||||||||||..||.||.
Sbjct  803  TAAGGAGCGGTCTCAGCTCCCTGGCCGGAGCCCCATCGCTAACAGATCCAGAGAGTAAAAGGGGAAGCACCGTC  876

Query  880  TTGAAAGATCTGAAATTGATCAGTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGT  953
            .||||.||||||||||||.|..||||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||||.
Sbjct  877  CTGAAGGATCTGAAATTGGTTGGTGAGAAGATTGGATCACTTGGGCTAGGCACTGGAGAAGATGAGGACTATGC  950

Query  954  TGATGATTTTAATAGTACCAGCCATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACC  1027
            ||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  951  TGATGATTTTAATAGTGCTAGCCATCGCTCAGAAAAAAGTGAGCTAAGTATTGGTGAAGAGATTGAAGAAGACC  1024

Query 1028  TTTCTGTGGAAATAGATGACATCAATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAG  1101
            ||||..|||.|.||||.|||...||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1025  TTTCCATGGGAGTAGAGGACGGGAACACCAGTGATAAACTCGATGACCTCACACAAGACCTGACTGTTTCCCAG  1098

Query 1102  CTCAGTGATGTTGCGGATTATCTGGAAGATGTTGCA  1137
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1099  CTCAGTGATGTTGCTGACTATCTGGAAGATGTTGCA  1134