Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468162
• Subject: XM_006523357.2
• Aligned Length: 1201
• Identities: 857
• Gaps: 215

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74
            |||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGACTACCGCCGCGGTGGTGGCCGAGGAAGACACGGAGCTGCGCGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74

Query   75  GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA  148
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  GAACAGCGGCGTGCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCAGAGCGGCTGTGTTTTTAGCACTAGAAGAACAAGAAA  148

Query  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG  222
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCATTGGTCAATGAGAACTTGAAAAAGTTTTTAAACACAAAAGATGGTCGTTTAGTG  222

Query  223  GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG  296
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GCTAGTCTCGTCGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAATCTTGACTTCACCTTGGCTGTTTTCCATCCTGAAACTAG  296

Query  297  CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370
            ||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAATTCAAGGTCTTGAAGGTCGAGAGAACTTGGCCCAGGATTTAGGCATCATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370

Query  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA  444
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||.||.||||||||||
Sbjct  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATTAGACGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGACCGGCCAGTGTGGAAGGTGCA  444

Query  445  CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA  518
            ||.||||||||.||||.||||.|||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.|..|.||.||||||||
Sbjct  445  CTGGATCTATCCGATGGACATCCTCCATCAAAGTCACCTGAAGGAAAATCAAGTGCAAACTCCACCCCAAGTAA  518

Query  519  G-------------AAGGCCAA--------------------------------TGA---------------TG  532
            |             ||||.|||                                |||               ||
Sbjct  519  GATACCAAGGTATAAAGGACAAGGTAAGAAGAAGACAATCGGTCAGAAGCCTGGTGACAAGAAGACTAGCAGTG  592

Query  533  AGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTCACTTACTGTCCCAT  606
            ||.|||.|||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||||.||||.|||||
Sbjct  593  AGACCAGTCAGAGTGAGCCAAGTGTCTCCTTGTCAGAGTCCAAGAGTAAAAGCAGCCTGCACTCACTGGCCCAT  666

Query  607  GAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGC--TGGCCTTTGTCCAGAT  678
            ||.||||.|||||.||||||..||||||.|||..||.||||||.||.||||  |||  ||.|||||||||||||
Sbjct  667  GAGACAAGAATTGCATCTTTCTTAAGCAGCAGCGCTGTAGATGCCAGAGAC--AGCAGTGCCCTTTGTCCAGAT  738

Query  679  GAAGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTACGGTTTGAGGAA  752
            |..||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.|||...
Sbjct  739  GGGGATGATGTGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAACCAGAAAAAACCTATGGTTGGAGAGC  812

Query  753  TGAACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCA--CCCCCCTTAAAAAGTGGACTCAGCTC  824
            |||||||.|||||||||..|||.||||||||||.||.||.||  ||  ||||.|||||..||.||.||||||||
Sbjct  813  TGAACCTCGGAAGCAAGTGGGAGGTCTGGCCTCACTGTCTGA--CAAGCCCCACTTAAGGAGCGGTCTCAGCTC  884

Query  825  CCTGGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGATCTGAAATTGA  898
            ||||||.||||||||.||..|||.|||..|.||||||||||||||||..||.||..||||.||||||||||||.
Sbjct  885  CCTGGCCGGAGCCCCATCGCTAACAGATCCAGAGAGTAAAAGGGGAAGCACCGTCCTGAAGGATCTGAAATTGG  958

Query  899  TCAGTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTTTAATAGTACC  972
            |..||||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||      
Sbjct  959  TTGGTGAGAAGATTGGATCACTTGGGCTAGGCACTGGAGAAGATGAGGACTATGCTGATGATTTTAAT------  1026

Query  973  AGCCATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGGAAATAGATGA  1046
                                                                                      
Sbjct 1027  --------------------------------------------------------------------------  1026

Query 1047  CATCAATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAGCTCAGTGATGTTGCGGATT  1120
                             ||||.|||||||||||||||||.|                                 
Sbjct 1027  -----------------AGCTCGATGACCTCACACAAGACC---------------------------------  1050

Query 1121  ATCTGGAAGATGTTGCA  1137
                             
Sbjct 1051  -----------------  1050