Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468169
• Subject: XM_006536162.1
• Aligned Length: 1277
• Identities: 1086
• Gaps: 58

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGAAGGC-----GGCCGCCCCGGGCACCGCGGTG-----------------CTGCTG----------  42
            |||..||    |||     ||.|.|||.|..||.|.|||||                 ||||||          
Sbjct    1  ATGCAGG----GGCTTTGGGGTCTCCCAGACCAGCTCGGTGTTACATTTCATGTGCTTCTGCTGTGTCTTAGCA  70

Query   43  ----GTCACGGCCAACGTGG-----GCTCGCTCTTCGACGACCCAGAAAACCTGCAGAAGAACTGGCTTCGGGA  107
                |.||.||||    |||     ||..|||         .||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  GAAAGACATGGCC----TGGAGAGAGCATGCT---------GCCAGAAAACCTGCAGAAGAACTGGCTTCGGGA  131

Query  108  ATTTTACCAGGTCGTGCACACACACAAGCCGCACTTCATGGCCTTGCACTGTCAGGAGTTTGGAGGGAAGAACT  181
            |||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  132  ATTTTACCAGGTCCTGCACACACACAAGCCTCACTTCATGGCCTTGCACTGCCAAGAATTTGGAGGGAAAAACT  205

Query  182  ACGAGGCCTCCATGTCCCACGTGGACAAGTTCGTCAAAGAACTATTGTCGAGTGATGCGATGAAAGAATATAAC  255
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct  206  ACGAGGCCTCCATGTCCCATGTGGACAAATTTGTCAAAGAACTACTATCCAGTGACGCAATGAAAGAATACAAC  279

Query  256  AGGGCTCGAGTCTACCTGGATGAAAACTACAAATCCCAGGAGCACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCT  329
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  280  AGGGCGCGTGTCTACCTGGATGAAAACTACAAGTCACAGGAACACTTCACGGCACTAGGAAGCTTTTATTTTCT  353

Query  330  TCATGAGTCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTGACTTTAAAGCTAAGAAGTATAGAAAGGTCGCTGGCAAAGAGA  403
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.|||||||.||||
Sbjct  354  TCACGAATCCTTAAAAAACATCTACCAGTTTGACTTTAAAGCTAAGAAGTATAAAAAAGTCACTGGCAAGGAGA  427

Query  404  TCTACTCGGATACCTTAGAGAGCACGCCCATGCTGGAGAAGGAGAAGTTTCCGCAGGACTACTTCCCCGAGTGC  477
            ||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  428  TCTATTCGGACACTTTGGAGAGCACACCCATGCTGGAGAAGGAGAAGTTCCCACAGGACTACTTTCCTGAGTGC  501

Query  478  AAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCCGGACGAGGTGGTGCATTGCAGACTGTGCCTTTGACTTGGTGAATATCCA  551
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  502  AAATGGTCAAGAAAAGGCTTCATCAGGACGCGGTGGTGCATTGCTGACTGTGCCTTCGACTTGGTGAACATTCA  575

Query  552  TCTTTTCCATGATGCTTCCAATCTGGTCGCCTGGGAAACAAGCCCTTCCGTGTACTCGGGAATCCGGCACAAGG  625
            ||||||.||||||||.|||||..|.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||..||.|||||||||
Sbjct  576  TCTTTTTCATGATGCATCCAACTTAGTGGCCTGGGAGACAAGCCCCTCAGTGTACTCCGGTGTCAGGCACAAGG  649

Query  626  CACTGGGCTACGTGCTGGACAGAATCATTGATCAGCGATTCGAGAAGGTTTCCTACTTTGTATTTGGTGATTTC  699
            |.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  650  CTCTGGGCTATGTGCTGGACAGAATCATCGACCAGCGATTTGAGAAAGTTTCCTACTTTGTCTTCGGTGATTTC  723

Query  700  AACTTCCGGCTGGATTCCAAGTCCGTCGTGGAGACGCTCTGCACAAAAGCCACCATGCAGACGGTCCGGGCCGC  773
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct  724  AACTTCCGCCTGGATTCCAAGTCTGTCGTAGAGACACTCTGCACAAAGGCCACAATGCAGACAGTCCGCGCTGC  797

Query  774  CGACACCAATGAAGTGGTGAAGCTCATATTTCGTGAGTCGGACAACGACCGGAAGGTTATGCTCCAGTTAGAAA  847
            .||.|||||||||||.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..||||||||||.||||
Sbjct  798  TGATACCAATGAAGTTGTAAAGTTGATATTTCGGGAGTCAGACAATGACCGGAAGGTCGTGCTCCAGTTGGAAA  871

Query  848  AGAAACTCTTCGACTACTTCAACCAGGAGGTTTTCCGAGACAACAACGGCACCGCGCTCTTGGAGTTTGACAAG  921
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  872  AGAAGCTCTTCGACTACTTCAACCAGGATGTCTTCCGGGACAACAACGGCACTGCGCTCTTGGAATTTGACAAG  945

Query  922  GAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGAACTGGACATCTCGTTCCCTCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGA  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  946  GAGTTGTCTGTCTTTAAGGACAGACTGTATGAACTGGACATCTCATTCCCCCCCAGCTACCCGTACAGTGAGGA  1019

Query  996  CGCCCGCCAGGGTGAGCAGTACATGAACACCCGGTGCCCAGCCTGGTGTGACCGCATCCTCATGTCCCCGTCTG  1069
            |.||.|||||||.||.||||||||||||||..|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1020  CTCCAGCCAGGGAGAACAGTACATGAACACGAGATGCCCTGCTTGGTGTGATCGCATCCTCATGTCCCTGTCTG  1093

Query 1070  CCAAGGAGCTGGTGCTGCGGTCGGAGAGCGAGGAGAAGGTTGTCACCTATGACCACATTGGGCCCAACGTCTGC  1143
            |||||||||||||.||...|||.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1094  CCAAGGAGCTGGTTCTTAAGTCAGAGAGCGAGGAGAAGGTTGCCACCTACGACCACATCGGGCCTAATGTCTGC  1167

Query 1144  ATGGGAGACCACAAGCCCGTGTTCCTGGCCTTCCGAATCATGCCCGGGGCAGGTAAACCTCATGCCCATGTGCA  1217
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||...||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1168  ATGGGAGACCACAAGCCGGTGTTCCTGGCCTTCCGAATCGCACCTGGGGCAGGTAAACCTCACGCCCATGTACA  1241

Query 1218  CAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1236
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1242  CAAGTGTTGTGTCGTGCAG  1260