Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468204
• Subject: NM_001206650.2
• Aligned Length: 1258
• Identities: 832
• Gaps: 368

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATAT-GGGCCTGCATATGGTGGACGAG  295
                                                             || |||||  |.|.|          
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGGGGCC--CCTCT----------  13

Query  296  AAACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACAC  369
               ||||          .|.|||||||  |..|||.||.|.|||.||                           
Sbjct   14  ---CAGC----------CCCTCCCTGC--ACACAGCATATAACCTGG---------------------------  45

Query  370  ATCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAA  443
                 ||||||                                    ||.|..||.||| .||||||||||.||
Sbjct   46  -----AAAGGG------------------------------------CTCCTGCTCACA-GTGGAGACTCCCAA  77

Query  444  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGA  517
            .||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||.|||.|||||||||||..|||||||||||.|||||||
Sbjct   78  ACCCTCCATCTCCAGCAGCAATTTCAACCCCAGGGAGGCCACGGAGGCTGTGATTTTAACCTGTGATCCTGAGA  151

Query  518  CTCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAA  591
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct  152  CTCCAGATGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGCTGTCTGAA  225

Query  592  ACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  665
            ||||||||||||||||..|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  226  ACCAACAGGACCCTCTACCTATTTGGTGTCACAAACTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  299

Query  666  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCA  739
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||
Sbjct  300  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCA  373

Query  740  ACAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTAC  813
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  374  ATAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTCAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTAC  447

Query  814  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCAT  887
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  448  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACGCATTGAAAACAGGATCCTCAT  521

Query  888  TCTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCA  961
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  522  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCA  595

Query  962  GTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  596  GTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCAT  669

Query 1036  TCAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGG  1109
            ||||||.||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  670  TCAGGACAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGG  743

Query 1110  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCT  1183
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  744  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTTTCTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  817

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGACTGGATATTACCC  1257
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  818  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCGTGACAGTCAGAGTCTCTGACTGGACATTACCC  891