Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468204
• Subject: NM_001301707.2
• Aligned Length: 1283
• Identities: 899
• Gaps: 310

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||.||||||||.||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATGGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||..|||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.|||.|||||.||||||||.||.||.|.|||.||||||||||||||                    
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCT--------------------  424

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
                                                                                      
Sbjct  425  --------------------------------------------------------------------------  424

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
                                                                                      
Sbjct  425  --------------------------------------------------------------------------  424

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
                                               ||||||                                 
Sbjct  425  -----------------------------------TATACT---------------------------------  430

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740
                                                       |.||||||.|||..|||||||||||.|||||
Sbjct  431  -------------------------------------------CGAAGCTGCCCATCCCCTACATCACCATCAA  461

Query  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  CAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  535

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  536  TTTGGTGGCTAAACGGTCAGAGCCTCCCCGTCAGTCCCGGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCATT  609

Query  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  610  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCCTCCGCAG  683

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.|||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  TAACCCAGTCATCCTAAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|.||.||||||||||.||||.|.||||.||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTCACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTG---------ACTGGA  1249
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||         | ||||
Sbjct  906  TGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTCCCTGCCA-TGGA  978

Query 1250  TATTACCC-----------------  1257
            .|    ||                 
Sbjct  979  GA----CCTGACAGAGTCTCAGTCA  999