Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468204
• Subject: NM_002785.3
• Aligned Length: 1285
• Identities: 905
• Gaps: 308

Alignment

Query    1  ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||..|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATTACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACTTGCCTACCACTGCCCAAGTCATGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTGTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATGGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGACCGGCATACAGTGGACGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGGGAGATGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCTGGAGACTCCTAAG  444
            ||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||.|||
Sbjct  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACTCCCAAG  444

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGACCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.|.||||||||
Sbjct  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGACTGTGATCTTAACCTGTAATCCTGAGAC  518

Query  519  TCCAGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAGCTGTCCGAAA  592
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||.|||||||.||||
Sbjct  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCATAGGATGCAGCTGTCTGAAA  592

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCACAAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATATGGAACTCA  666

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCAAAGCTGTCCAAGCCCTACATCACAATCAA  740
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  667  GGGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC-------------------------------  709

Query  741  CAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGATGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  889  CTACCCAATGTCACGAGAAATGAAACAGGACCTTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  962
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  963  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
                                      |||||||||||||||||||.||||.|||||||.||||||.||||..||
Sbjct  710  --------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTTCCCTTCAGTCACCTCTTACTATT  757

Query 1037  CAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAACCCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            |||||||.||||||.||||||||||||||||..|.||||||||||..|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  758  CAGGAGAGAACCTCGACTTGTCCTGCTTCGCAAACTCTAACCCACCAGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  831

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAATAACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  832  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCTCAGATTACTCCAAAGCATAATGGGCTCTATGCTTGCTC  905

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATCACAGTCAAAGTCTCTGACT------GGAT--  1250
            ||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|.|||.|||.||||..|| ||      ||||  
Sbjct  906  TGCTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACATCCTTGACAATCAGAGTCATTG-CTCCTCCAGGATTA  978

Query 1251  ----------------ATTACCC----  1257
                            ||.|.||    
Sbjct  979  GGAACTTTTGCTTTCAATAATCCAACG  1005