Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468268
• Subject: XM_017027261.2
• Aligned Length: 2223
• Identities: 1760
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATGACCACGTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCT  74
            |||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGACCACGTTCAAGGAGGCAATGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGGGGCTGCT  74

Query   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            |||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  GGACCTTGCTCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGACATC  148

Query  149  AATCACTCCACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA  222
            ||.||.|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||.
Sbjct  149  AAGCATTCCACAGGGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGATTTGGATGATGAAGACAGCAATCCAAAGG  222

Query  223  GAAGGGAATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCTTGTT  296
            ||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||..|.||.
Sbjct  223  GAAGGGAATTCAGGAGACAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTTCAGAAGCAGGAACACATCAAGAGTGGTC  296

Query  297  CAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCATGGTAAACAGCTTTCAGT  370
            |...||.||||.|||||||.|||||.|||||||.||||||||||.||||||||..|||.||||.||||.|||||
Sbjct  297  CTTCCAGCAAATCTGGGAAAAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGTCTCAAGACTTGATGATAAATAGCTCTCAGT  370

Query  371  TCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACCTTCT  444
            ||||||||.|||.||||.|.|||||||||..|||.||||||||||||.||||||||..||||||||||.||||.
Sbjct  371  TCTCCAAAGAAGGTGATTTCCCCTGCCAGACTGAGGCAGGACTATCTGTAATTCACACAAGACAGAAATCTTCC  444

Query  445  GAGGGTA--GGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAAGA  516
            .||||.|  |||  |.||||...|||||.||||||||||||..|.|||||.|||||||||||.||||.|||.||
Sbjct  445  CAGGGCAATGGA--TATAAACCATCCTTCAGTGATGTCTCCCACTTTGATTTTCATCAACAATTACACTCAGGA  516

Query  517  GAGAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGAGT  590
            |||||.||||||||.||||||||.||||||||||..||.|||||.|.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GAGAAATCTCATACGTGTGATGAGTGTGGAAAGAACTTTTGTTACATCTCAGCCCTTCGTATTCATCAGAGAGT  590

Query  591  TCACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAATTC  664
            .||||||||.||||||..||||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||
Sbjct  591  CCACATGGGAGAGAAATGCTATAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTCACATCTGCAAACTC  664

Query  665  ATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAGGA  738
            ||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|.|.||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  665  ATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCGTTCAAATGTGTGGAATGTGGGAAAGGCTTCAGTCGTAGATCAGCA  738

Query  739  CTTTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATTCA  812
            |||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  739  CTTAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGCGGGAAGGCCTTCATTCA  812

Query  813  TGATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAAGA  886
            .||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  813  CGATTCCCAGCTTCAAGAACATCAGAGAATCCATACGGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGA  886

Query  887  GCTTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATACA  960
            |||||.||.|||||.|||..|||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||.||||||||||.
Sbjct  887  GCTTCTGTGGTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACGGCAGAGAAACCATTCCGATGTGATACG  960

Query  961  TGTGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTACAA  1034
            ||||.||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  961  TGTGATAAGAGCTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGATCCACACAGGAGAGAAACCATACAA  1034

Query 1035  ATGTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGAGA  1108
            |||||||||.|||||||||.||||.||||.|||||.|||||||||||.||||||.||.|.||||||.||.||.|
Sbjct 1035  ATGTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTTATTTGTAGGCGAGATCTTTATACGCATCATATGGTCCACACGGGAGAAA  1108

Query 1109  AGCCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCCAC  1182
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||..||||||..|.||||..||||||||||
Sbjct 1109  AGCCATATAATTGTAAAGAGTGTGGGAAGAGCTTCAGATGGGCCTCGTGTCTTTTGAAACATCAGCGAGTCCAC  1182

Query 1183  AGTGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCACCA  1256
            ||||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1183  AGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAAGGATTTTACACAAATTCACAATGCTATTCCCACCA  1256

Query 1257  GAGAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTG  1330
            ||||.|.||.|||||||||||.|||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  GAGATCCCATAGTGGAGAAAAACCATACAAATGTGTGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTG  1330

Query 1331  ACTTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGGCC  1404
            |||||||.|||.|.|||||.|.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||
Sbjct 1331  ACTTTCACCAGCGCGTCCATACAGGAGAGAAACTGTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGTCGGGCC  1404

Query 1405  TCGTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGATT  1478
            .|.|||||||||||.|||.||                                                     
Sbjct 1405  CCATGTCTTTTGAAACATGAG-----------------------------------------------------  1425

Query 1479  TACTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTG  1552
                                           |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1426  -------------------------------AGACTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCCAATGTGAAGAGTGTG  1468

Query 1553  GGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAATGT  1626
            ||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.||||..|||||.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1469  GGAAGAGATTTACTCAAAATTCACATCTTCATTCCCATCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGT  1542

Query 1627  GAAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGACC  1700
            ||..|||||||.|||||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1543  GAGAAGTGTGGAAAGGGCTACAATAGTAAGTTTAATCTTGATATGCACCAGAAGGTCCACACAGGAGAGAGACC  1616

Query 1701  TTATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGGTG  1774
            .||.||||||||.||||||||||||||.|||.||.|||||||..||.|||||||.|||.|||||||.||..|||
Sbjct 1617  ATACAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGTTTTGGCTGGGCCTCGTGTCTTTTGAAACATCAGAGACTGCACAGTG  1690

Query 1775  ATGAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAGAGG  1848
            ..|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1691  GAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAGCTTCATTCTCATCAAAGA  1764

Query 1849  GTTCACACTGGGGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTAAC  1922
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||.|||.|||||||.|||.|||||||||.|||.||
Sbjct 1765  GTGCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGATGAGTGTGGGAAGGGCTTCAGCTGGTCCTCAACTCGTCTGAC  1838

Query 1923  CCATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTCAT  1996
            |||||||||||.||||||.|||||||.||..||..||||||||.|...||||||||.||||||.||.|.|||||
Sbjct 1839  CCATCAGAGACGCCACAGCAGAGAAACACCTCTCAAATGTGAGCAGCATGGGAAGAACATTGTACAGAATTCAT  1912

Query 1997  GCCTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAG  2070
            .|..|||||..|||.|||.||..||.||||.|||.||..|||..|||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1913  TCTCTAAAGTGCAAGAAAAAGTTCACAGTGTAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGACTGTGGGAAGGGCTACAAC  1986

Query 2071  AGGCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGA-----CACA---------------------  2118
            |||||||||||||||||||.||    .|||            ||     ||||                     
Sbjct 1987  AGGCGCTTGAATCTTGATATGC----ATCA------------GAGGGTCCACATGGGAGAGAAAACATGGAAGT  2044

Query 2119  --------------------------------------------------------------------------  2118
                                                                                      
Sbjct 2045  GTAGGGAGTGTGATATGTGCTTTAGTCAGGCCTCAAGCCTTCGACTTCATCAGAATGTTCATGTTGGAGAAAAA  2118

Query 2119  ---  2118
               
Sbjct 2119  CCT  2121