Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468268
• Subject: XM_024451487.1
• Aligned Length: 2122
• Identities: 1469
• Gaps: 455

Alignment

Query    1  ATGACCACGTTGAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGAGGCTGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAACTGTACCGAGAAGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
                                              |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------ATGCTGGAGAACTTCAGAAACCTGCTATCAGTGGGGCATC  40

Query  149  AATCACT---CCACAGAGATACTTTCCACTTCCTAAAG-GAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCA  218
            |   |||   ||||.||||||||||.||||||| |||| |||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct   41  A---ACTTTCCCACCGAGATACTTTTCACTTCC-AAAGAGAAGAAAAGTTTTGGATCATGGAGACAGCAACCCA  110

Query  219  AAGAGAAGGGAATTTAGGAGGCAAGATCCAAATGGAGATGGAGACTGTTTCAGAATCAGGAACACATGAAGGCT  292
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||..|
Sbjct  111  AAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAACAGGACCACATGAAGAGT  184

Query  293  TGTTCAGTCATCAAACCTGGGAACAAATTTCAAGTGACTTAACCAGGTTTCAAGACTCCATGGTAAACAGCTTT  366
            .||...|.||.||||.|||||||||||.|.|||||||.|||||.||...|||||||||||   |||..||||.|
Sbjct  185  GGTCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGAGTTAACTAGACCTCAAGACTCCA---TAAGTAGCTCT  255

Query  367  CAGTTCTCCAAACAAGATGATATGCCCTGCCAGGTTGATGCAGGACTATCTATAATTCACGTAAGACAGAAACC  440
            ||||||||||.|||||.||||.|.||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||.||.||.|||.|||
Sbjct  256  CAGTTCTCCACACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGACGCAGGACTATCTATAATTCACATAGGAGAGACACC  329

Query  441  TTCTGAGGGTAGGACGTGTAAAAAGTCCTTTAGTGATGTCTCCGTCCTTGATCTTCATCAACAACTACAGTCAA  514
            |||||||..|.|||.|||||||||.|.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.|||.
Sbjct  330  TTCTGAGCATGGGAAGTGTAAAAAATTCTTCAGTGATGTCTCCATCCTTGATCTTCATCAACAATTACACTCAG  403

Query  515  GAGAGAAGTCTCATACATGTGATGAATGTGGAAAGAGTTTCTGTTATAGCTCAGCTCTTCGTATTCATCAGAGA  588
            ||.|||..||.|||||||||.||||.|...|.|||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|
Sbjct  404  GAAAGATATCCCATACATGTAATGAGTACAGGAAGAGATTCTGTTATAGCTCAGCTCTTTGTCTTCATCAGAAA  477

Query  589  GTTCACATGGGGGAGAAACTCTATAATTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTCAATCAGAGCTCACATCTGCAAAT  662
            |||||||||||.|||||||.||||||.||||||||||||.||||||.|||.|.|||||.||||||.|||||||.
Sbjct  478  GTTCACATGGGAGAGAAACGCTATAAGTGTGATGTGTGTAGTAAGGCATTTAGTCAGAACTCACAACTGCAAAC  551

Query  663  TCATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTTAGTCGTAGATCAG  736
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||||
Sbjct  552  TCATCAGAGAATCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAAGTTTCAGCCGTAGATCAG  625

Query  737  GACTTTATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGTGAAACCTCATATTTGTGAGAAATGTGGGAAGGCCTTCATT  810
            ||.|.|||||||||.|.||||||||||||||||..||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  626  GAATGTATGTTCATTGCAAATTACACACAGGAGAAAAACCTCATATTTGTGAGGAATGTGGGAAGGCCTTCATT  699

Query  811  CATGATTCCCAGCTTCAGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTTGTAA  884
            ||..||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  700  CACAATTCCCAGCTTCGGGAACATCAAAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTTATATATGTGGTAA  773

Query  885  GAGCTTCCGTAGTAGAGCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTTCACATGCGAGAGAAACCATTCAGATGTGATA  958
            ||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.||||.||||||||||
Sbjct  774  GAGCTTCCATAGTAGATCAAATCTTAATAGGCATTCCATGGTCCACATGCAAGAGAAATCATTTAGATGTGATA  847

Query  959  CATGTGGTAAGAGCTTTGGTCTGAAATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACGGTAC  1032
            |.|||.||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||..||||||||..|||
Sbjct  848  CCTGTAGTAATAGCTTTGGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTGCATGGACCACACAAAAGAGAAACTATAC  921

Query 1033  AAATGTGAGGAATGTGGAAAACGCTTCATTTATAGGCAAGATCTTTATAAGCATCAGATAGACCACACAGGGGA  1106
            ||||||||.||||||||||...||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  922  AAATGTGAAGAATGTGGAAGGAGCTTCACTTGTAGGCAAGATCTTTGTAAGCATCAGATGGACCATACAGGAGA  995

Query 1107  GAAGCCATATAATTGTAAAGAATGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAGGTCTTTCAAGACATGTGCGAGTCC  1180
            .||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|||||||.|||.|||||.||||||||||||||..|||.||||
Sbjct  996  CAAACCATATAATTGTAATGTATGTGGGAAGGGCTTCAGGTGGTCCTCATGTCTTTCAAGACATCAGCGGGTCC  1069

Query 1181  ACAGTGGAGAGACAACATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACGTTATTCTCAC  1254
            |||.||||||.|||||||||||.||.||.|.||||||||||.|||||||||..||||||||..|..||||.||.
Sbjct 1070  ACAATGGAGAAACAACATTCAAGTGCGACGGATGTGGGAAGAGATTTTATATGAATTCACAGGGCCATTCACAT  1143

Query 1255  CAGAGAGCGCACAGTGGAGAAAAGCCATATAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCT  1328
            |||||||                                                                   
Sbjct 1144  CAGAGAG-------------------------------------------------------------------  1150

Query 1329  TGACTTTCATCAGAGGGTCCACAGAGGAGAGAAACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTGGCTGGG  1402
                                               |||||                                  
Sbjct 1151  -----------------------------------CCTAT----------------------------------  1155

Query 1403  CCTCGTGTCTTTTGAATCATCAGAGAATCCACAGTGGAGAAAAACCATTTAAATGTGAAGAATGTGGGAAAAGA  1476
                                 ||||||                             ||||              
Sbjct 1156  ---------------------AGAGAA-----------------------------GAAG--------------  1165

Query 1477  TTTACTCAGAATTCACAACTTTATACCCATCGTAGAGTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTG  1550
                            ||||.|||                                    |||||         
Sbjct 1166  ----------------AACTGTAT------------------------------------AAATG---------  1178

Query 1551  TGGGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAACTTTATTCTCATCGCAGAGTCCACACTGGAGTAAAGCCATACAAAT  1624
                           |||||                                                      
Sbjct 1179  ---------------TCAGA------------------------------------------------------  1183

Query 1625  GTGAAGAGTGTGGGAAGGGCTTCAACAGTAAGTTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACACCGGAGAGAGA  1698
                  |||||||||||||||.||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1184  ------AGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGA  1251

Query 1699  CCTTATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATGG  1772
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||..||||||||.|||||||||..|||||||||||||||..
Sbjct 1252  CCTTATAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTCAGGTGGGCCTCAGGTATTTTGAGACATAAGAGACTCCATAC  1325

Query 1773  TGATGAAAAGCCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTGAGAATTCACAGCTTCATTCCCATCAGA  1846
            ||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||.||.||||||.|
Sbjct 1326  TGGAGAAAAACCATTCAAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGGTTTACTGAGAATTCAAAACTTCGTTTCCATCAAA  1399

Query 1847  GGGTTCACACTGGGGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGAGCTTCAGATGGGCCTCAACTCATCTA  1920
            |..||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  GAATTCACACTGGAGAAAAGCCTTACAAATGTGAGGAGTGTGGAAAGGGATTCAGATGGGCCTCAACTCATCTA  1473

Query 1921  ACCCATCAGAGACTCCACAGTAGAGAAAAACTACTTCAATGTGAGGACTGTGGGAAGAGCATTGTGCACAGTTC  1994
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1474  ACCCATCAAAGACTCCACAGCAGAGAAAAACTATTCCAATGTGAGGATTGTGGGAAGAGCAGTGAGCACAGTTC  1547

Query 1995  ATGCCTTAAAGACCAACAAAGAGACCAAAGTGGAGAGAAAACATCTAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACA  2068
            |||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1548  ATGCCTTCAAGACCAACAAAGCGACCACAGTGGAGAAAAAACATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACG  1621

Query 2069  AGAGGCGCTTGAATCTTGATACGCTTTTGTCATTATTTTTAAATGACACA  2118
            ||||||||||||||||.||||.|.||||.|||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1622  AGAGGCGCTTGAATCTAGATATGATTTTATCATTATTTTTAAATGATATA  1671