Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468309
• Subject: NM_001330367.2
• Aligned Length: 1328
• Identities: 1117
• Gaps: 208

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------ATGCCAATGTGGAA--------------  14
                                                          |||     ||||||              
Sbjct    1  ATGGATGATGATGATTTTGGTGGTTTTGAGGCTGCGGAGACTTTTGATG-----GTGGAAGTGGTGAAACCCAA  69

Query   15  -----------------------------------TAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA  53
                                               |..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  ACAACATCTCCTGCTATTCCTTGGGCTGCCTTTCCTGCAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGA  143

Query   54  GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  GATTGTACTGGACCGTGACCACTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGA  217

Query  128  ATACACATGCAGCAAATAGCATTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCAT  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  ATACACATGCAGCAAATAGCATTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCAT  291

Query  202  CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  CTGGATATCTCACTTTTTCCATTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTC  365

Query  276  TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  TGAGGATCCTGGAGCCAATGTATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAG  439

Query  350  TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  TATCTGAAGAAGAAAAACAGAGAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAA  513

Query  424  GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  GGCTTTCTAAAAGAAAAAGAGCAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAA  587

Query  498  ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTAC  571
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  588  ACAAGAATTGGAAGACATGAGGAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATA---------  652

Query  572  TGCAGTCTTCAGTTAAGCAACAAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACAC  645
                                                                                      
Sbjct  653  --------------------------------------------------------------------------  652

Query  646  AAGTGTGAGGAGTTGCTAAATGCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA  719
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  -------------------------AGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAA  701

Query  720  AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  AGAAAAAATAAAGGAAGCTTTGATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAG  775

Query  794  AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAATGAAGGATGCAGTTTTA  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  776  AAAGGCAAAGAAATAAAGAGGCATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAGTGAAGGATGCAGTTTTA  849

Query  868  AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  AAAGTCGTAGAAGAAGAAAGAAAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACA  923

Query  942  TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  TGCAAAAGATCAAGAAAAAGTATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAA  997

Query 1016  CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  CTGTTAAGGCAGCAATAATAGAAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGA  1071

Query 1090  GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  GATGAATTGATAGAGTATATAAAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTT  1145

Query 1164  GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146  GGAACTGTTCCTCTCCTGTGCACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1215