Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468309
• Subject: XM_024449038.1
• Aligned Length: 1233
• Identities: 1124
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  ATGCCAATGTGGAATAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGAGATTGTACTGGACCGTGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCAATGTGGAATAAAGTATCTGGAGTCCATCTTTCACCATCTTCTCCTGAGATTGTACTGGACCGTGACCA  74

Query   75  CTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGAATACACATGCAGCAAATAGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTCTTCTTCCATTGGCTGCCTCTCTTCTGATGCCATTATTTCATCACCAGAGAATACACATGCAGCAAATAGCA  148

Query  149  TTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCATCTGGATATCTCACTTTTTCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGTGAGTCAAACTATTCCAAAAGCACAGATTCAGCAATCAACACACACTCATCTGGATATCTCACTTTTTCCA  222

Query  223  TTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTCTGAGGATCCTGGAGCCAATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGGTTTAACTGATGAAAAAAGTAATGGAACAATTGCCCTTGTGGATGATTCTGAGGATCCTGGAGCCAATGT  296

Query  297  ATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAGTATCTGAAGAAGAAAAACAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCTAACATACAGCTTCAGCAAAAAATTTCAAGTCTGGAGATTAAACTCAAAGTATCTGAAGAAGAAAAACAGA  370

Query  371  GAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAAGGCTTTCTAAAAGAAAAAGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAATTAAACAGGATGTGGAATCATTGATGGAAAAGCATAATGTCTTAGAAAAAGGCTTTCTAAAAGAAAAAGAG  444

Query  445  CAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAAACAAGAATTGGAAGACATGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGAGGCCATTTCTTTTCAAGATAGATACAAAGAACTTCAGGAAAAACATAAACAAGAATTGGAAGACATGAG  518

Query  519  GAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATAAGGCACTACTGCAGTCTTCAGTTAAGCAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  519  GAAAGCTGGTCACGAAGCCCTCAGCATTATTGTGGATGAATATA------------------------------  562

Query  593  AAGTAGAAGCTATTGAAAAACAGTACATTTCTGCAATTGAGAAACAGGCACACAAGTGTGAGGAGTTGCTAAAT  666
                                                                                      
Sbjct  563  --------------------------------------------------------------------------  562

Query  667  GCTCAGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAAAGAAAAAATAAAGGAAGCTTT  740
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  ----AGCATCAGAGGCTCCTTGAAATGCTAGATACAGAGAAGGAACTGTTAAAAGAAAAAATAAAGGAAGCTTT  632

Query  741  GATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAGAAAGGCAAAGAAATAAAGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  633  GATTCAGCAATCTCAAGAACAGAAGGAAATATTGGAAAAGTGTTTGGAGGAAGAAAGGCAAAGAAATAAAGAGG  706

Query  815  CATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAATGAAGGATGCAGTTTTAAAAGTCGTAGAAGAAGAAAGA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  707  CATTAGTATCCGCTGCAAAGCTTGAAAAAGAAGCAGTGAAGGATGCAGTTTTAAAAGTCGTAGAAGAAGAAAGA  780

Query  889  AAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACATGCAAAAGATCAAGAAAAAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AAAAATTTAGAAAAAGCGCATGCTGAAGAAAGGGAATTATGGAAGACAGAACATGCAAAAGATCAAGAAAAAGT  854

Query  963  ATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAACTGTTAAGGCAGCAATAATAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  ATCTCAGGAAATTCAAAAAGCTATACAAGAACAAAGAAAAATAAGTCAGGAAACTGTTAAGGCAGCAATAATAG  928

Query 1037  AAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGAGATGAATTGATAGAGTATATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  AAGAGCAGAAACGAAGTGAAAAGGCTGTGGAAGAGGCAGTGAAAAGAACAAGAGATGAATTGATAGAGTATATA  1002

Query 1111  AAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTTGGAACTGTTCCTCTCCTGTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  AAAGAACAGAAAAGGCTCGATCAAGTCATCCGCCAAAGAAGCCTGTCCAGTTTGGAACTGTTCCTCTCCTGTGC  1076

Query 1185  ACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1233
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  ACAGAAACAGTTAAGTGCTTTAATAGCTACGGAACCAGTTGACATTGAA  1125