Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468437
• Subject: XM_006522228.1
• Aligned Length: 831
• Identities: 702
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGCCCTGTTTCCAAAAACGCGTACAGGCTCATCTTGGCAGCCAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGTCCTGTTTCCAAAAATGCATACAGGCTCATCTTGGCAGCCAA  74

Query  75  CAGGGATGAATTCTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGC  148
           |||.|||||||||||.|.|.|.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct  75  CAGAGATGAATTCTATAACAGGCCGTCCAAGTTGGCAGACTTCTGGGGGAACAACAGTGAGATCCTCAGTGGGC  148

Query 149  TGGACATGGAGGAAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACC  222
           |.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||||
Sbjct 149  TCGACATGGAGGAAGGCAAGGCAGGAGGAACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGGAAGCTGGGGGCACTCACC  222

Query 223  AACTACCTGCAGCCGCAGCTGGACTGGCAG--GCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACT  294
           ||||||||.|||||.|.||..||  |.|||  |||||.||..|||||||||||||..|.|||||||||||||.|
Sbjct 223  AACTACCTACAGCCCCGGCAAGA--GCCAGACGCCCGTGGTAGAGGTGAACTTGTGTCTCACTTTCTGACCAGT  294

Query 295  GACGTGGACAGCTTGTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGC  368
           |||.||||||||.||||||||||||||||||||||||..||||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||
Sbjct 295  GACATGGACAGCCTGTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTACAGAGGGCCACCTGTATAACGGCTTTAACATCATAGC  368

Query 369  AGCCAACCTGAGCACAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTT  442
           |||..||||||||||..||||.|||||.||..|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 369  AGCTGACCTGAGCACGTCAAAAGGAGATGTTGTTTGCTACTATGGAAACCGGGGGGAGCCTGAGCCTATTGTCT  442

Query 443  TGACGCCAGGCACCTACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAG  516
           ||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.||.
Sbjct 443  TGACACCAGGAACCTATGGGCTAAGCAATGCCCTGCTGGAGACGCCCTGGAAGAAGCTGTGCTTTGGCAAACAA  516

Query 517  CTCTTCCTGGAGGCTGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGC-CAGCCTCCTGGATGTGC  589
           ||||||.||||.||.|||||.|.||||.|.||.||.||.|||||.||.||..||.| ||| |||||.|||||.|
Sbjct 517  CTCTTCATGGAAGCAGTGGAGCAGAGCGAAGCACTCCCTAAGGACGTCCTTGTCACTCAG-CTCCTAGATGTCC  589

Query 590  TCAACAATAAAGAGGCGCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTG  663
           ||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||...||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 590  TCAACAATGAGGAGGCACAGCTGCCAGACCCAGCCATTGAGGACCAGGGCCAGGAGTATGTACAGCCAATTCTG  663

Query 664  AGCAAGTACGCGGCTGTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCAGAACCAACACTATCATCCTGGTAGATGC  737
           |.||||||.||.||||||||.||.|||||..|...|||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 664  AACAAGTATGCAGCTGTGTGTGTCCGCTGTGCCACCTATGGCACCAGAACCAACACCATCATCCTTGTGGATGC  737

Query 738  GGACGGCCACGTGACCTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAACCTATG  811
           ..|.||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||.|||..|||.|.|||||||||||..|||||||
Sbjct 738  AAATGGCCACGTGACCTTCACTGAACGGAGCATGCTGGACAAAGACACCTCTCGCTGGGAGACCAACACCTATG  811

Query 812  AGTTCACACTGCAGAGC  828
           ||||||||||.|||||.
Sbjct 812  AGTTCACACTACAGAGT  828