Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468535
• Subject: NM_001328124.1
• Aligned Length: 3747
• Identities: 3119
• Gaps: 603

Alignment

Query    1  ATGGCTTCCTCCAACCCTCCTCCACAGCCTGCCATAGGAGATCAGCTGGTTCCAGGAGTCCCAGGCCCCTCCTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAGGCAGAGGACGACCCAGGAGAGGCGTTTGAGTTTGATGACAGTGATGATGAAGAGGACACCAGCGCAGCCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGGCGTCCCCAGCCTTGCTCCTGAGAGGGACACAGACCCCCCACTGATCCACTTGGACTCCATCCCTGTCACT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACCCAGACCCAGCAGCTGCTCCACCCGGCACAGGGGTGCCAGCCTGGGTGAGCAATGGGGATGCAGCGGACGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AGCCTTCTCCGGGGCCCGGCACTCCAGCTGGAAGCGGAAGAGTTCCCGTCGCATTGACCGGTTCACTTTCCCCG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCTGGAAGAGGATGTGATTTATGACGACGTCCCCTGCGAGAGCCCAGATG---CGCATCAGCCC--GGGGCAG  439
                                                            |||   |.||.||||.|  ||||.| 
Sbjct    1  ------------------------------------------------ATGTTACCCAGCAGCTCGTGGGGGA-  25

Query  440  AGAGGAACCTGCTCTACGAGGATGCGCACCGGGCTGGGGCCCCTCGGCAGGCGGAG----GACCTAGGCTGGAG  509
            |||||||.|||     |||||        |.||||||||    |.||  .||||||    |.||..|||     
Sbjct   26  AGAGGAAGCTG-----CGAGG--------CAGGCTGGGG----TGGG--TGCGGAGTGATGCCCGGGGC-----  75

Query  510  CTCCAGTGA-GTTCGAGAGCTACAGCGAGGACTCGGGGGAGGAGGCCAAGCCGGAGGTCGAGGTCGAGCCCGCC  582
                 |||| ||                              .||||..||.||||     ||||         
Sbjct   76  -----GTGATGT------------------------------GGGCCCGGCAGGAG-----GGTC---------  100

Query  583  AAGCACCGAGTGTCCTTCCAGCCCAAGATGACCCAGCTCATGAAGGCCGCCAAGAGCGGGACCAAGGATGGGCT  656
             .|||||                       ||||            ||.||          ||           
Sbjct  101  -TGCACC-----------------------ACCC------------CCACC----------CC-----------  117

Query  657  GGAGAAGACACGGATGGCCGTGATGCGCAAAGT--CTCCT--TCCTGCACAGGAAGGACGTCCTC---------  717
                    |||     |||||.||.|||  .||  |||||  ||||            |.|||||         
Sbjct  118  --------CAC-----GCCGTCATCCGC--TGTCCCTCCTCCTCCT------------CCTCCTCTGTCTCCTG  164

Query  718  ----GGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAG  787
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  165  CTCAGGTGACTCGGAGGAGGAGGACATGGGGCTCCTGGAGGTCAGCGTTTCGGACATCAAGCCCCCAGCCCCAG  238

Query  788  AGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAG  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  AGCTGGGCCCCATGCCAGAGGGCCTGAGCCCTCAGCAGGTGGTCCGGAGGCATATCCTGGGCTCCATCGTGCAG  312

Query  862  AGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCC  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  313  AGCGAAGGCAGCTACGTGGAGTCTCTGAAGCGGATACTCCAGGACTACCGCAACCCCCTGATGGAGATGGAGCC  386

Query  936  CAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGT  1009
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  387  CAAGGCGCTGAGCGCCCGCAAGTGCCAGGTGGTGTTCTTCCGCGTGAAGGAGATCCTGCACTGCCACTCCATGT  460

Query 1010  TCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCG  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  461  TCCAGATCGCCCTGTCCTCCCGCGTGGCTGAGTGGGATTCCACCGAGAAGATCGGGGACCTCTTCGTGGCCTCG  534

Query 1084  TTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAA  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  535  TTTTCCAAGTCCATGGTGCTAGATGTGTACAGTGACTACGTGAACAACTTCACCAGTGCCATGTCCATCATCAA  608

Query 1158  GAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCA  1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  609  GAAGGCCTGCCTCACCAAGCCTGCCTTCCTCGAGTTCCTCAAGCGACGGCAGGTGTGCAGCCCAGACCGTGTCA  682

Query 1232  CCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAG  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  CCCTCTACGGGCTGATGGTCAAGCCCATCCAGAGGTTCCCACAGTTCATACTCCTGCTTCAGGACATGCTGAAG  756

Query 1306  AACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAA  1379
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757  AACACCCCCAGGGGCCATCCGGACAGGCTGTCGCTGCAGCTGGCCCTCACAGAGCTGGAGACGCTGGCTGAGAA  830

Query 1380  GCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCA  1453
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  GCTGAACGAGCAGAAGCGGCTGGCTGACCAGGTGGCTGAGATCCAGCAGCTGACCAAGAGCGTCAGTGACCGCA  904

Query 1454  GCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTAC  1527
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  905  GCAGCCTCAACAAGCTGTTGACCTCAGGCCAGCGGCAGCTGCTCCTGTGTGAGACGTTGACGGAGACCGTGTAC  978

Query 1528  GGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAA  1601
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  GGTGACCGCGGGCAGCTAATTAAGTCCAAGGAGCGTCGGGTCTTCCTGCTCAACGACATGCTTGTCTGTGCCAA  1052

Query 1602  CATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATG  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053  CATCAACTTCAAGCCTGCCAACCACAGGGGCCAGCTGGAGATCAGCAGCCTGGTGCCCCTGGGGCCCAAGTATG  1126

Query 1676  TGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAG  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127  TGGTGAAGTGGAACACGGCGCTGCCCCAGGTGCAGGTGGTGGAGGTGGGCCAGGACGGTGGCACCTATGACAAG  1200

Query 1750  GACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCT  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201  GACAATGTGCTCATCCAGCACTCAGGCGCCAAGAAGGCCTCTGCCTCAGGGCAGGCTCAGAATAAGGTGTACCT  1274

Query 1824  CGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTC  1897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275  CGGCCCCCCACGCCTCTTCCAGGAGCTGCAGGACCTGCAGAAGGACCTGGCCGTGGTGGAGCAGATCACGCTTC  1348

Query 1898  TCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAG  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349  TCATCAGCACGCTGCACGGCACCTACCAGAACCTGAACATGACTGTGGCTCAAGACTGGTGCCTGGCCCTGCAG  1422

Query 1972  AGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAA  2045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423  AGGCTGATGCGGGTGAAGGAGGAAGAGATCCACTCGGCCAACAAGTGCCGTCTCAGGCTCCTGCTTCCTGGGAA  1496

Query 2046  ACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCT  2119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497  ACCCGACAAGTCCGGCCGCCCCATTAGCTTCATGGTGGTTTTCATCACCCCCAACCCCCTGAGCAAGATTTCCT  1570

Query 2120  GGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAG  2193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571  GGGTCAACAGGTTACATTTGGCCAAAATCGGACTCCGGGAGGAGAACCAGCCAGGCTGGCTATGCCCGGATGAG  1644

Query 2194  GACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACT  2267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645  GACAAGAAGAGCAAAGCCCCATTCTGGTGCCCGATCCTGGCCTGCTGCATCCCTGCCTTCTCCTCCCGGGCACT  1718

Query 2268  CAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCCGTCAGCACCT  2341
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1719  CAGCCTGCAGCTTGGGGCCCTGGTCCACAGTCCTGTCAACTGTCCCCTGCTGGGTTTCTCAGCAGTCAGCACCT  1792

Query 2342  CCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTG  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793  CCCTTCCACAGGGCTACCTCTGGGTCGGGGGCGGACAGGAAGGCGCAGGGGGCCAGGTGGAAATCTTTTCCTTG  1866

Query 2416  AACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGA  2489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867  AACCGGCCCTCGCCCCGCACCGTCAAGTCCTTCCCACTGGCAGCCCCTGTGCTCTGCATGGAGTATATCCCGGA  1940

Query 2490  GCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCA  2563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941  GCTGGAGGAGGAGGCGGAGAGCAGAGACGAGAGCCCGACAGTTGCTGACCCCTCGGCCACGGTGCATCCAACCA  2014

Query 2564  TCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGC  2637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015  TCTGCCTCGGGCTCCAGGATGGCAGCATCCTCCTCTACAGCAGTGTGGACACTGGCACCCAGTGCCTGGTGAGC  2088

Query 2638  TGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGA  2711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089  TGCAGGAGCCCAGGTCTGCAGCCTGTGCTCTGCCTGCGACACAGCCCCTTCCACCTGCTCGCTGGCCTGCAGGA  2162

Query 2712  TGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGA  2785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163  TGGGACCCTTGCTGCTTACCCTCGGACCAGCGGAGGTGTCCTGTGGGACCTGGAGAGCCCTCCCGTGTGCCTGA  2236

Query 2786  CTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTC  2859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237  CTGTGGGGCCCGGGCCTGTCCGCACCCTGTTGAGCCTGGAGGATGCCGTGTGGGCCAGCTGTGGGCCCCGGGTC  2310

Query 2860  ACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGAC  2933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311  ACTGTCCTGGAAGCCACCACCCTGCAGCCTCAGCAAAGCTTCGAGGCGCACCAGGACGAGGCAGTGAGCGTGAC  2384

Query 2934  ACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTG  3007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2385  ACACATGGTGAAGGCGGGCAGCGGCGTCTGGATGGCCTTCTCCTCCGGCACCTCCATCCGCCTCTTCCACACTG  2458

Query 3008  AGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTG  3081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459  AGACCCTGGAGCATCTGCAAGAGATCAACATCGCCACCAGGACCACCTTCCTCCTGCCAGGCCAGAAGCACTTG  2532

Query 3082  TGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCC  3155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533  TGTGTCACCAGCCTCCTGATCTGCCAGGGTCTGCTCTGGGTGGGCACTGACCAGGGTGTCATCGTCCTGCTGCC  2606

Query 3156  CGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAATGGGCACTGTGGGCCTG  3229
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2607  CGTGCCTCGGCTGGAAGGCATCCCCAAGATCACAGGGAAAGGCATGGTCTCACTCAACGGGCACTGTGGGCCTG  2680

Query 3230  TGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGG  3303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2681  TGGCCTTCCTGGCTGTGGCTACCAGCATCCTGGCCCCTGACATCCTGCGGAGTGACCAGGAGGAGGCTGAGGGG  2754

Query 3304  CCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGACAGCCACGTGGGCCGAGAGCT  3377
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2755  CCCCGGGCTGAGGAGGACAAGCCAGACGGGCAGGCACACGAGCCCATGCCCGATAGCCACGTGGGCCGAGAGCT  2828

Query 3378  GACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCA  3451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829  GACCCGCAAGAAGGGCATCCTCTTGCAGTACCGCCTGCGCTCCACCGCACACCTCCCGGGCCCGCTGCTCTCCA  2902

Query 3452  TGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCC  3525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2903  TGCGGGAGCCGGCGCCTGCTGATGGCGCAGCTTTGGAGCACAGCGAGGAGGACGGCTCCATTTACGAGATGGCC  2976

Query 3526  GACGACCCCGACGTCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGC  3599
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2977  GACGACCCCGACATCTGGGTGCGCAGCCGGCCCTGCGCCCGCGACGCCCACCGCAAGGAGATTTGCTCTGTGGC  3050

Query 3600  CATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTG  3673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051  CATCATCTCCGGCGGGCAGGGCTACCGCAACTTTGGCAGCGCTCTGGGCAGCAGTGGGAGGCAGGCCCCGTGTG  3124

Query 3674  GGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3720
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3125  GGGAGACGGACAGCACCCTCCTCATCTGGCAGGTGCCCTTGATGCTA  3171