Protein Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000468535
Subject:
NM_001328124.1
Aligned Length:
1240
Identities:
1012
Gaps:
183

Alignment

Query    1  MASSNPPPQPAIGDQLVPGVPGPSSEAEDDPGEAFEFDDSDDEEDTSAALGVPSLAPERDTDPPLIHLDSIPVT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  DPDPAAAPPGTGVPAWVSNGDAADAAFSGARHSSWKRKSSRRIDRFTFPALEEDVIYDDVPCESPDAHQPGAER  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  NLLYEDAHRAGAPRQAEDLGWSSSEFESYSEDSGEEAKPEVEVEPAKHRVSFQPKMTQLMKAAKSGTKDGLEKT  222
             .|.....  |.......|||..|......     .|..|....|..|.|...|..........          
Sbjct    1  -MLPSSSW--GKRKLRGRLGWVRSDARGVM-----WARQEGLHHPHPHAVIRCPSSSSSSVSCS----------  56

Query  223  RMAVMRKVSFLHRKDVLGDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESL  296
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   57  -----------------GDSEEEDMGLLEVSVSDIKPPAPELGPMPEGLSPQQVVRRHILGSIVQSEGSYVESL  113

Query  297  KRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDV  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  KRILQDYRNPLMEMEPKALSARKCQVVFFRVKEILHCHSMFQIALSSRVAEWDSTEKIGDLFVASFSKSMVLDV  187

Query  371  YSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDR  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  YSDYVNNFTSAMSIIKKACLTKPAFLEFLKRRQVCSPDRVTLYGLMVKPIQRFPQFILLLQDMLKNTPRGHPDR  261

Query  445  LSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKS  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  LSLQLALTELETLAEKLNEQKRLADQVAEIQQLTKSVSDRSSLNKLLTSGQRQLLLCETLTETVYGDRGQLIKS  335

Query  519  KERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  336  KERRVFLLNDMLVCANINFKPANHRGQLEISSLVPLGPKYVVKWNTALPQVQVVEVGQDGGTYDKDNVLIQHSG  409

Query  593  AKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEE  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  410  AKKASASGQAQNKVYLGPPRLFQELQDLQKDLAVVEQITLLISTLHGTYQNLNMTVAQDWCLALQRLMRVKEEE  483

Query  667  IHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFW  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  IHSANKCRLRLLLPGKPDKSGRPISFMVVFITPNPLSKISWVNRLHLAKIGLREENQPGWLCPDEDKKSKAPFW  557

Query  741  CPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVK  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  CPILACCIPAFSSRALSLQLGALVHSPVNCPLLGFSAVSTSLPQGYLWVGGGQEGAGGQVEIFSLNRPSPRTVK  631

Query  815  SFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPV  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  SFPLAAPVLCMEYIPELEEEAESRDESPTVADPSATVHPTICLGLQDGSILLYSSVDTGTQCLVSCRSPGLQPV  705

Query  889  LCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQ  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  LCLRHSPFHLLAGLQDGTLAAYPRTSGGVLWDLESPPVCLTVGPGPVRTLLSLEDAVWASCGPRVTVLEATTLQ  779

Query  963  PQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQ  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  PQQSFEAHQDEAVSVTHMVKAGSGVWMAFSSGTSIRLFHTETLEHLQEINIATRTTFLLPGQKHLCVTSLLICQ  853

Query 1037  GLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPD  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  GLLWVGTDQGVIVLLPVPRLEGIPKITGKGMVSLNGHCGPVAFLAVATSILAPDILRSDQEEAEGPRAEEDKPD  927

Query 1111  GQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDVWVRS  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  928  GQAHEPMPDSHVGRELTRKKGILLQYRLRSTAHLPGPLLSMREPAPADGAALEHSEEDGSIYEMADDPDIWVRS  1001

Query 1185  RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  RPCARDAHRKEICSVAIISGGQGYRNFGSALGSSGRQAPCGETDSTLLIWQVPLML  1057